Varisulca

Varisulca fue un taxón podiado basal propuesto . ^[1] Abarcaba varios linajes de protistas heterótrofos , más notablemente las anciromónadas (planomónadas), los colodictiónidos (difileidos), los rigifilidos ( Rigifila , Micronuclearia ) y los mantamonádidos . Evidencias recientes sugieren que los últimos tres están estrechamente relacionados entre sí, formando un clado llamado CRuMs , pero que es poco probable que esté específicamente relacionado con las anciromónadas. ^[2]

Cavalier-Smith había propuesto el nuevo subfilo Varisulca que consiste en las clases Hilomonadea , Diphyllatea y Glissodiscea . ^[3] La validez de esta taxonomía propuesta aún debe ser determinada por la Sociedad de Protistólogos. Es poco probable que sea ampliamente aceptada, ya que Varisulca parece ser parafilético o polifilético (no se infiere que las ancyromonas sean el grupo hermano de CRuMs). Glissodiscea y Multirhiza (un taxón que abarca Diphyllatea y Glissodiscea) también parecen parafiléticos o polifiléticos, ya que Mantamonas pertenece a CRuMs pero las ancyromonas no.

Los varisulcos parecen ser un tallo parafilético de los podios , por lo que otros podios basales como Malawimonas , Metamonada y/o Amoebozoa y Amorphea pueden haber surgido en los varisulcos. ^[4]^[5] Algunos grupos de Apusozoos se consideran ahora varisulcos. Los Apusomonadida (por ejemplo, Thecamonas ) ya no están directamente asociados con los varisulcos, pero se consideran hermanos de los opistocontos . Los sulcozoos (originalmente solo Varisulca y Apusozoa) ^[6] ahora abarcan los unikonta /amorphea y se convierten en equivalentes de los podios (raíces) y los sarcomastigota. ^{[ cita requerida ]}

Mantamonadida parece ser hermana de Apusomonadida en Apusozoa en algunos hallazgos. ^[7]^[8]

Taxonomía

[Advertencia: Varisulca, Multirhiza y Glissodiscea carecen de apoyo filogenético molecular y son fuertemente no monofiléticas en estudios recientes]

Subfilo Varisulca Cavalier-Smith 2012

Superclase Hilomonadia Cavalier-Smith 2012
- Clase Hilomonadea Cavalier-Smith 2008 em. 2012
  - Orden Rigifilida Cavalier-Smith & Yabuki 2012
    - Familia Rigifilidae Cavalier-Smith & Yabuki 2012
      - Género Rigifila Cavalier-Smith & Yabuki 2012
    - Familia Micronucleariidae Cavalier-Smith 2008
      - Género Micronuclearia Mikrjukov y Mylnikov 2001
Superclase Multirhiza Cavalier-Smith 2012
- Clase Diphyllatea Cavalier-Smith 2003 [Anisomonadea]
  - Orden Diphylleida Cavalier-Smith 1993 [Collodictyonida]
    - Familia Sulcomonadidae Cavalier-Smith 2012
      - Género Sulcomonas Brugerolle 2006
    - Familia Diphylleidae Cavalier-Smith, 1993 [Collodictyonidae Brugerolle et al. 2002 ]
      - Género Diphylleia Massart 1920 no Michaux 1803
      - Género Collodictyon Carter 1865
- Clase Glissodiscea Cavalier-Smith 2012
  - Pedir Discocelida Cavalier-Smith 1997
    - Familia Discoceliidae Cavalier-Smith 2012
      - Género Discocelia Cavalier-Smith 2013 [ Discocelis Vørs 1988 no Ehrenberg 1836 ]
  - Orden Mantamonadida Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011
    - Familia Mantamonadidae Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011
      - Género Mantamonas Cavalier-Smith Glücksman et al. 2011
  - Orden Planomonadida Cavalier-Smith 2008 ^[9] ( Ancyromonadida Cavalier-Smith 1998 emend. Atkins 2000 )
    - Familia Ancyromonadidae Cavalier-Smith 1993
      - Género Ancyromonas Kent 1880
    - Familia Planomonadidae Cavalier-Smith 2008
      - Género Fabomonas Glücksman & Cavalier-Smith 2013
      - Género Planomonas Cavalier-Smith enmienda de 2008. Cavalier-Smith 2013
    - Familia Nutomonadae Cavalier-Smith 2013
      - Género Nutomonas Cavalier-Smith 2013

Referencias

^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Snell, Elizabeth A.; Berney, Cédric; Fiore-Donno, Anna Maria; Lewis, Rhodri (1 de diciembre de 2014). "La filogenia eucariota multigénica revela los probables ancestros protozoarios de los opistocontos (animales, hongos, coanozoos) y los amebozoos". Filogenética molecular y evolución . 81 : 71–85. doi : 10.1016/j.ympev.2014.08.012 . PMID 25152275.
^ Marrón, Mateo W; Heiss, Aaron A; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo (19 de enero de 2018). "La filogenómica sitúa los linajes de protistán huérfanos en un nuevo supergrupo eucariota". Biología y evolución del genoma . 10 (2): 427–433. doi : 10.1093/gbe/evy014. ISSN 1759-6653. PMC 5793813 . PMID 29360967.
^ Cavalier-Smith T (2013). "Evolución temprana de los modos de alimentación eucariota, diversidad estructural celular y clasificación de los filos protozoarios Loukozoa, Sulcozoa y Choanozoa". Eur J Protistol . 49 (2): 115–78. doi :10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID 23085100.
^ Cavalier-Smith, Thomas (5 de febrero de 2017). "Origen de la multicelularidad animal: precursores, causas, consecuencias: la transición coanoflagelado/esponja, la neurogénesis y la explosión cámbrica". Phil. Trans. R. Soc. B. 372 ( 1713): 20150476. doi :10.1098/rstb.2015.0476. ISSN 0962-8436. PMC 5182410. PMID 27994119 .
^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Lewis, Rhodri (2016). "La filogenia de 187 genes del filo protozoario Amoebozoa revela una nueva clase (Cutosea) de Lobosa marinos envueltos, ultraestructuralmente únicos y de ramificación profunda, y aclara la evolución de las amebas". Filogenética molecular y evolución . 99 : 275–296. doi : 10.1016/j.ympev.2016.03.023 . PMID 27001604.
^ Ruggiero, Michael A.; Gordon, Dennis P.; Orrell, Thomas M.; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C.; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D.; Kirk, Paul M. (29 de abril de 2015). "Una clasificación de nivel superior de todos los organismos vivos". PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode :2015PLoSO..1019248R. doi : 10.1371/journal.pone.0119248 . ISSN 1932-6203. PMC 4418965 . PMID 25923521.
^ Glücksman E, Snell EA, Berney C, Chao EE, Bass D, Cavalier-Smith T (septiembre de 2010). "El nuevo género de zooflagelados marinos deslizantes Mantamonas (Mantamonadida ord. n.: Apusozoa)". Protista . 162 (2): 207–221. doi :10.1016/j.protis.2010.06.004. PMID 20884290.
^ Orr, Russell JS; Zhao, Sen; Klaveness, Dag; Yabuki, Akinori; Ikeda, Keiji; Makoto, Watanabe M.; Shalchian-Tabrizi, Kamran (8 de octubre de 2017). "Enigmáticos eucariotas de Diphyllatea: el cultivo y la secuenciación dirigida de amplicones PacBio RS revela una diversidad taxonómica de orden superior y una distribución global". bioRxiv 10.1101/199125 .
^ Glücksman, Snell y Cavalier-Smith (2013). "Filogenia y evolución de Planomonadida (Sulcozoa): ocho nuevas especies y nuevos géneros Fabomonas y Nutomonas". Revista Europea de Protistología . 49 (2): 179–200. doi :10.1016/j.ejop.2012.08.007. PMID 23369787.

[1] Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Snell, Elizabeth A.; Berney, Cédric; Fiore-Donno, Anna Maria; Lewis, Rhodri (1 de diciembre de 2014). "La filogenia eucariota multigénica revela los probables ancestros protozoarios de los opistocontos (animales, hongos, coanozoos) y los amebozoos". Filogenética molecular y evolución . 81 : 71–85. doi : 10.1016/j.ympev.2014.08.012 . PMID 25152275.

[2] Marrón, Mateo W; Heiss, Aaron A; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo (19 de enero de 2018). "La filogenómica sitúa los linajes de protistán huérfanos en un nuevo supergrupo eucariota". Biología y evolución del genoma . 10 (2): 427–433. doi : 10.1093/gbe/evy014. ISSN 1759-6653. PMC 5793813 . PMID 29360967.

[Cavalier-Smith2013-3] Cavalier-Smith T (2013). "Evolución temprana de los modos de alimentación eucariota, diversidad estructural celular y clasificación de los filos protozoarios Loukozoa, Sulcozoa y Choanozoa". Eur J Protistol . 49 (2): 115–78. doi :10.1016/j.ejop.2012.06.001. PMID 23085100.

[4] Cavalier-Smith, Thomas (5 de febrero de 2017). "Origen de la multicelularidad animal: precursores, causas, consecuencias: la transición coanoflagelado/esponja, la neurogénesis y la explosión cámbrica". Phil. Trans. R. Soc. B. 372 ( 1713): 20150476. doi :10.1098/rstb.2015.0476. ISSN 0962-8436. PMC 5182410. PMID 27994119 .

[5] Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E.; Lewis, Rhodri (2016). "La filogenia de 187 genes del filo protozoario Amoebozoa revela una nueva clase (Cutosea) de Lobosa marinos envueltos, ultraestructuralmente únicos y de ramificación profunda, y aclara la evolución de las amebas". Filogenética molecular y evolución . 99 : 275–296. doi : 10.1016/j.ympev.2016.03.023 . PMID 27001604.

[6] Ruggiero, Michael A.; Gordon, Dennis P.; Orrell, Thomas M.; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C.; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D.; Kirk, Paul M. (29 de abril de 2015). "Una clasificación de nivel superior de todos los organismos vivos". PLOS ONE . 10 (4): e0119248. Bibcode :2015PLoSO..1019248R. doi : 10.1371/journal.pone.0119248 . ISSN 1932-6203. PMC 4418965 . PMID 25923521.

[pmid20884290-7] Glücksman E, Snell EA, Berney C, Chao EE, Bass D, Cavalier-Smith T (septiembre de 2010). "El nuevo género de zooflagelados marinos deslizantes Mantamonas (Mantamonadida ord. n.: Apusozoa)". Protista . 162 (2): 207–221. doi :10.1016/j.protis.2010.06.004. PMID 20884290.

[8] Orr, Russell JS; Zhao, Sen; Klaveness, Dag; Yabuki, Akinori; Ikeda, Keiji; Makoto, Watanabe M.; Shalchian-Tabrizi, Kamran (8 de octubre de 2017). "Enigmáticos eucariotas de Diphyllatea: el cultivo y la secuenciación dirigida de amplicones PacBio RS revela una diversidad taxonómica de orden superior y una distribución global". bioRxiv 10.1101/199125 .

[Glücksman,_Snell_&_Cavalier-Smith_2013-9] Glücksman, Snell y Cavalier-Smith (2013). "Filogenia y evolución de Planomonadida (Sulcozoa): ocho nuevas especies y nuevos géneros Fabomonas y Nutomonas". Revista Europea de Protistología . 49 (2): 179–200. doi :10.1016/j.ejop.2012.08.007. PMID 23369787.

Taxonomía

Referencias

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