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Articulo de referencia

VectorBase

VectorBase [ 1 ] [ 2 ] es uno de los cinco Centros de Recursos Bioinformáticos (BRC) financiados por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID), un com...

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VectorBase [ 1 ] [ 2 ] es uno de los cinco Centros de Recursos Bioinformáticos (BRC) financiados por el Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID), un componente de los Institutos Nacionales de Salud (NIH), que es una agencia del Departamento de Salud y Servicios Humanos de los Estados Unidos . VectorBase se centra en vectores invertebrados de patógenos humanos y trabaja con los centros de secuenciación y la comunidad de investigación para curar genomas de vectores (principalmente anotación genómica ).

Genomas incluidos en la base de datos VectorBase

Herramientas disponibles a través del sitio web de VectorBase.

  • Navegador del genoma
  • Sistema de anotación de la comunidad
  • repositorio de microarrays y expresión génica
  • Vocabularios controlados para anatomía, [ 5 ] resistencia a insecticidas y enfermedades transmitidas por vectores (malaria y dengue)
  • BLAST realiza búsquedas en todos los genomas cubiertos.

Véase también

Referencias

  1. ↑ Lawson, D; Arensburger, P; Atkinson, P; Besansky, NJ; Bruggner, RV; Butler, R; Campbell, KS; Christophides, GK; et  al. (2007). "VectorBase: un hogar para vectores invertebrados de patógenos humanos" . Nucleic Acids Research . 35 (número especial de bases de datos): D503–5. doi : 10.1093/nar/gkl960 . PMC 1751530. PMID 17145709 .  
  2. ↑ Lawson, D; Arensburger, P; Atkinson, P; Besansky, NJ; Bruggner, RV; Butler, R; Campbell, KS; Christophides, GK; et al. (2009). "VectorBase: un recurso de datos para la genómica de vectores de invertebrados" . Nucleic Acids Research . 37 (número especial de bases de datos): D583–7. doi : 10.1093/nar/gkn857 . PMC 2686483. PMID 19028744 .   
  3. ↑ Nene, V; Wortman, JR; Lawson, D; Haas, B; Kodira, C; Tu, ZJ; Loftus, B; Xi, Z; et al. (2007). "Secuencia del genoma de Aedes aegypti, un importante vector de arbovirus" . Science . 316 ( 5832): 1718– 23. Bibcode : 2007Sci...316.1718N . doi : 10.1126/science.1138878 . PMC 2868357. PMID 17510324 .   
  4. ↑ Holt, RA; Subramanian, GM; Halpern, A; Sutton, GG; Charlab, R; Nusskern, DR; Wincker, P; Clark, AG; et al. (2002). "La secuencia del genoma del mosquito de la malaria Anopheles gambiae". Science . 298 (5591): 129– 49. Bibcode : 2002Sci...298..129H . CiteSeerX 10.1.1.149.9058 . doi : 10.1126/science.1076181 . PMID 12364791 . S2CID 4512225 .    
  5. ↑ Topalis, P; Tzavlaki, C; Vestaki, K; Dialynas, E; Sonenshine, DE; Butler, R; Bruggner, RV; Stinson, EO; et al. (2008). "Ontologías anatómicas de mosquitos y garrapatas, y sus navegadores web en VectorBase". Insect Molecular Biology . 17 (1): 87– 9. doi : 10.1111/j.1365-2583.2008.00781.x . PMID 18237287 . S2CID 8618269 .   
  • vectorbase.org
  • Centros de Recursos Bioinformáticos. Página del NIAID que describe los objetivos y actividades de los BRC.
  • Sitio web del portal de patógenos para los cinco BRC; proporciona información resumida.
Navegadores de genomas VectorBase
  • Navegador del genoma de Aedes aegypti en VectorBase
  • Navegador del genoma de Anopheles gambiae en VectorBase
  • Navegador del genoma de Culex quinquefasciatus en VectorBase
  • Explorador del genoma de Ixodes scapularis en VectorBase
  • Explorador del genoma de Pediculus humanus en VectorBase
  • Navegador del genoma de Rhodnius prolixus en VectorBase