VxInsight es una herramienta de minería de conocimiento desarrollada por Sandia National Laboratories con el Institute for Scientific Information . Permite al usuario visualizar la relación entre grupos de objetos en grandes bases de datos como un paisaje 3D.
En lo que Hillier et al. denominan un "estudio pionero", [1] se ha utilizado VxInsight para analizar datos de expresión génica (es decir, microarrays ) en una serie de condiciones en C. elegans . Utilizando VxInsight, Kim et al. pudieron agrupar genes en "montajes" con funciones coherentes, y también pudieron hacer observaciones novedosas, como el hallazgo de que distintas clases de transposones (como los transposones Tc3 y Mariner) parecen estar reguladas de forma diferencial durante el desarrollo. [2]
Referencias
- ^ Genómica en C. elegans: tantos genes, un gusano tan pequeño - Hillier et al. 15 (12): 1651 - Investigación Genómica
- ^ Kim, Stuart K.; Lund, Jim; Kiraly, Moni; Duke, Kyle; Jiang, Min; Stuart, Joshua M.; Eizinger, Andreas; Wylie, Brian N.; Davidson, George S. (14 de septiembre de 2001). "Un mapa de expresión genética para Caenorhabditis elegans". Science . 293 (5537): 2087– 2092. doi :10.1126/science.1061603. ISSN 0036-8075. PMID 11557892.
Enlaces externos
- VxInsight - Laboratorios Nacionales Sandia
- Tutorial de InfoVis Cyberinfrastructure - VxInsight (con varias capturas de pantalla)
- Visualización de dominios con VxInsight para la gestión de la ciencia y la tecnología