Hispanopedia WikiLa 5-bromouridina (abreviada BrUrd , 5BrU , br5Urd o, raramente, con el código de una letra B) [ 2 ] es un derivado de la uridina con un sustituyente bromo en el quinto carbono. [ 3 ] La BrUrd se incorpora al ARN y puede detectarse mediante inmunocitoquímica y analizarse por citometría. Causa daño al ADN mediante sustitución de bases y aumenta el número de mutaciones. [ 4 ]
Usos
Detección de la actividad de la vida media
La 5-bromouridina también se ha utilizado para detectar la vida media de las moléculas de ARN. En un método denominado análisis de secuenciación profunda con inmunoprecipitación de 5'-bromouridina (BRIC-seq), la 5'-bromouridina se utiliza para marcar el ARN y permitir la medición de sus niveles a lo largo del tiempo. Este método se empleó en el estudio de Tani et al. para determinar la vida media del ARN e investigar la función de los ARN no codificantes. [ 5 ]
Empalme del pre-ARNm
La 5-bromouridina también se utilizó para estudiar el empalme in vitro del pre-ARNm en un estudio realizado por Wansink. El 5-bromoruridina 5'-trifosfato (BruUTP) se utilizó para marcar el pre-ARNm e investigar la eficiencia del empalme. Descubrieron que el empalme se inhibe si las uridinas en el transcrito de ARN se reemplazan por BrU, lo que sugiere que las uridinas son cruciales para la reacción de empalme. [ 6 ]
Detección de la síntesis de ARN en células individuales
La incorporación de 5-bromouridina por células individuales se detectó inmunocitoquímicamente utilizando anticuerpos contra BrdU seguido de citometría de flujo. [ 7 ]
Véase también
Referencias
- ↑ 5-bromouridina en Linstrom, Peter J.; Mallard, William G. (eds.); NIST Chemistry WebBook , NIST Standard Reference Database Number 69 , National Institute of Standards and Technology, Gaithersburg (MD) (consultado en 2012)
- ↑ Comisión IUPAC-IUB sobre Nomenclatura Bioquímica (1970). "Abreviaturas y símbolos para ácidos nucleicos, polinucleótidos y sus constituyentes". Biochemistry . 9 (20): 4022– 4027. doi : 10.1021/bi00822a023 .
- ↑ CSID:82616, http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.82616.html (consultado a las 22:51 del 19 de octubre de 2012)
- ↑ "5-bromouridina (CHEBI:20553)." EBI.ac.uk. Instituto Europeo de Bioinformática, 30 de noviembre de 2010. Web. 26 de octubre de 2012.< http://www.ebi.ac.uk/chebi/advancedSearchFT.do;jsessionid=29B3462C81CE2E1F80223B50A927F832?chebiId=20553&structureSearchMethod=substructure >
- ↑ Tani, H; Mizutani, R; Salam, KA; Tano, K; Ijiri, K; Wakamatsu, A; Isogai, T; Suzuki, Y; Akimitsu, N (2012). "La determinación a nivel genómico de la estabilidad del ARN revela cientos de transcritos no codificantes de corta duración en mamíferos" . Genome Research . 22 (5): 947– 56. doi : 10.1101/gr.130559.111 . PMC 3337439. PMID 22369889 .
- ↑ Wansink, DG; Nelissen, RL; De Jong, L (1994). "Empalme in vitro de pre-ARNm que contiene bromouridina" . Molecular Biology Reports . 19 (2): 109–13 . doi : 10.1007/BF00997156 . hdl : 11245/1.105890 . PMID 8072491. S2CID 10367635 .
- ↑ Larsen, JK; Jensen, P. Ø.; Larsen, J (2001). Análisis de la síntesis de ARN mediante citometría de flujo por detección de la incorporación de bromouridina . Vol. 12. pp. 7.12.1–7.12.11. doi : 10.1002/0471142956.cy0712s12 . ISBN 978-0471142959. PMID 18770724 . S2CID 39703414 .
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Enlaces externos
- 5-bromouridina enLinstrom, Peter J.; Mallard, William G. (eds.); NIST Chemistry WebBook , Base de datos de referencia estándar NIST número 69 , Instituto Nacional de Estándares y Tecnología, Gaithersburg (MD) (consultado en 2012)
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