La Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares (ABRF) se dedica a promover laboratorios de biotecnología básicos y de investigación a través de la investigación, la comunicación y la educación. [ 1 ] Los miembros de ABRF incluyen a más de 2000 científicos que representan a 340 laboratorios básicos diferentes en 41 países, incluidos los de la industria, el gobierno, las instituciones académicas y de investigación.
Historia
En 1986 se celebró una reunión satélite del Centro de Recursos de Investigación en conjunto con la Sexta Conferencia Internacional sobre Métodos de Análisis de Secuencias de Proteínas. Al año siguiente, se enviaron muestras de secuenciación de proteínas y aminoácidos para analizar 103 centros de investigación. En 1989, la ABRF se organizó e incorporó formalmente. Cada año se celebró una reunión anual como reunión satélite de la Sociedad de Proteínas hasta 1996, cuando comenzaron las reuniones independientes. [ 2 ]
Grupos de investigación de ABRF
Los Grupos de Investigación se establecen para cumplir dos de los propósitos de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Primero, proporcionar mecanismos para la autoevaluación y mejora de la exactitud, precisión y eficiencia de los procedimientos y operaciones en las instalaciones de recursos y laboratorios de investigación. Segundo, contribuir a la formación del personal, usuarios, administradores y miembros interesados de la comunidad científica de las instalaciones de recursos y laboratorios de investigación. [ 3 ] Los resultados de los estudios de los Grupos de Investigación de la ABRF se han publicado en artículos científicos. [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Los resultados de los estudios de los Grupos de Investigación de la ABRF se han reutilizado en otras investigaciones. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
- Grupo de Secuenciación de Nueva Generación de ABRF (ABRF-NGS)
- Grupo de Investigación en Tecnología de Anticuerpos (ARG)
- Grupo de Investigación Biomédica Ómica (BORG)
- Grupo de Investigación en Secuenciación de ADN (DSRG)
- Grupo de Investigación en Citometría de Flujo (FCRG)
- Grupo de Investigación Genómica (GVRG)
- Grupo de Investigación de Glicoproteínas (gPRG)
- Grupo de Investigación en Microscopía Óptica (LMRG)
- Grupo de Investigación en Metabolómica (MRG)
- Grupo de Investigación en Metagenómica (MGRG)
- Grupo de Investigación de Interacciones Moleculares (MIRG)
- Grupo de Investigación de Ácidos Nucleicos (NARG)
- Grupo de Investigación sobre la Expresión de Proteínas (PERG)
- Grupo de Investigación en Secuenciación de Proteínas (PSRG)
- Grupo de Investigación en Proteómica (PRG)
- Grupo de Investigación en Informática del Proteoma (iPRG)
- Grupo de Investigación de Estándares de Proteómica (sPRG)
Tecnologías de recursos
Los miembros de ABRF participan en un amplio espectro de tecnologías biomoleculares que se implementan en entornos de instalaciones centrales :
- Automatización: cribado de alto rendimiento, LIMS , robótica .
- Química de proteínas y péptidos : análisis de aminoácidos, secuenciación de los extremos N y C, síntesis de péptidos, matrices de péptidos y proteínas.
- Biofísica : calorimetría , dicroísmo circular, fluorescencia , dispersión de luz , resonancia de plasmones superficiales (SPR ), ultracentrifugación .
- Citometría de flujo: clasificación celular activada por fluorescencia
- Expresión, identificación y caracterización de proteínas : fluorescencia diferencial, electroforesis convencional en gel bidimensional , descubrimiento de biomarcadores de enfermedades.
- Expresión y perfilado genético : microarrays genéticos, PCR en tiempo real .
- Espectrometría de masas : análisis cualitativo, cuantitativo y estructural de proteínas, carbohidratos , oligonucleótidos y lípidos .
- Microscopía óptica e imagen, Microscopía confocal
- Química de ácidos nucleicos : secuenciación de ADN , síntesis de ADN , síntesis de ARN , genotipado .
- Separaciones: PAGE 1D y 2D, electroforesis capilar , cromatografía .
- Control de calidad : Buenas prácticas de laboratorio (BPL), buenas prácticas de fabricación (BPF), calidad y cumplimiento normativo.
- El Estándar Universal de Proteómica (UPS), una mezcla de proteínas utilizada como estándar de referencia en proteómica, fue introducido por el mencionado sPRG. [ 10 ] Este incluye dos conjuntos: el original (UPS1, donde las 48 proteínas están a 48 pmol) y un rango dinámico de concentraciones (llamado UPS2), que va desde 500 amol hasta 50 pmol. [ 11 ]
- Otros: bioinformática , análisis de carbohidratos , visualización diferencial, producción de proteínas recombinantes .
Conferencia anual
Cada primavera, la conferencia anual de la Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares se celebra en una ciudad diferente de Norteamérica. Esta conferencia internacional sirve para dar a conocer a los miembros las nuevas tecnologías biotecnológicas emergentes mediante ponencias, mesas redondas, presentaciones de grupos de investigación, sesiones de pósteres, talleres y exposiciones técnicas.
- ABRF 2025, del 23 al 28 de marzo de 2025, Las Vegas, Nevada
- ABRF 2024, del 21 al 24 de abril de 2024, Minneapolis, MN
- ABRF 2023, del 7 al 10 de mayo de 2023, Boston, MA
- ABRF 2022, del 27 al 30 de marzo de 2022, Palm Springs, California.
- ABRF 2021, del 7 al 11 de marzo de 2021, reunión virtual debido a la COVID-19.
- ABRF 2020, del 29 de febrero al 3 de marzo de 2020, Palm Springs, California.
- ABRF 2019, del 23 al 26 de marzo, San Antonio , Texas; 30 años desafiando los límites de la ciencia y la tecnología, abriendo puertas para el futuro.
- ABRF 2018, del 22 al 25 de abril, Myrtle Beach, Carolina del Sur ; La principal conferencia sobre servicios esenciales.
- ABRF 2017, del 25 al 28 de marzo, San Diego , California; Un foro para impulsar las tecnologías centrales actuales y así posibilitar las innovaciones del futuro.
- ABRF 2016, del 20 al 23 de febrero, Fort Lauderdale , Florida; Tecnologías innovadoras que aceleran el descubrimiento.
- ABRF 2015, del 28 al 31 de marzo, St. Louis , Missouri; Tecnologías integradoras para el avance de los núcleos científicos
- ABRF 2014, 23-25 de marzo, Albuquerque , Nuevo México; Ciencia en equipo y macrodatos: Núcleos en la frontera
- ABRF 2013, 2-5 de marzo, Palm Springs, California; Herramientas para el avance de la ciencia de la convergencia.
- ABRF 2012, 17-20 de marzo, Orlando, Florida; Aprendiendo de las biomoléculas
- ABRF 2011, 19-22 de febrero, San Antonio, Texas; Tecnologías para la Medicina Personalizada
- ABRF 2010, 20-23 de marzo, Sacramento, California; Traducción de la investigación básica con avances en tecnología biomolecular.
- ABRF 2009, del 7 al 10 de febrero, Memphis, Tennessee; Aplicación y optimización de biotecnologías existentes y emergentes.
- ABRF 2008, del 9 al 12 de febrero, Salt Lake City, Utah; Tecnologías facilitadoras en las ciencias de la vida
- ABRF 2007, del 31 de marzo al 3 de abril, Tampa, Florida; Creación de la hoja de ruta biológica.
- ABRF 2006, del 11 al 14 de febrero, Long Beach, California; Integración de la ciencia, las herramientas y las tecnologías con la biología de sistemas.
- ABRF 2005, del 5 al 8 de febrero, Savannah, Georgia; Tecnologías biomoleculares: del descubrimiento a la hipótesis.
- ABRF 2004, del 28 de febrero al 2 de marzo, Portland, Oregón; Integración de tecnologías en proteómica y genómica.
- ABRF 2003, del 10 al 13 de febrero, Denver, Colorado; Traducción de la biología mediante proteómica y genómica funcional.
- ABRF 2002, del 9 al 12 de marzo, Austin, Texas; Tecnologías biomoleculares: herramientas para el descubrimiento en proteómica y genómica.
- ABRF 2001, 24-27 de febrero, San Diego, California; La nueva biología: tecnología para resolver comunicaciones macromoleculares
- ABRF 2000, 19-22 de febrero, Bellevue, Washington; De los análisis singulares a los análisis globales de los sistemas biológicos
- ABRF 1999, 19-22 de marzo, Durham, Carolina del Norte; Bioinformática y tecnologías biomoleculares: vinculando genomas, proteomas y bioquímica.
- ABRF 1998, 21-24 de marzo, San Diego, California; De los genomas a la función: desafíos técnicos de la era postgenómica.
- ABRF 1997, 9-12 de febrero, Baltimore, Maryland; Técnicas en la interfaz genoma-proteoma
- ABRF 1996, 30 de marzo – 2 de abril, San Francisco, California; Técnicas Biomoleculares
Premio ABRF
El Premio ABRF se entrega en la reunión anual de la ABRF por contribuciones destacadas a las Tecnologías Biomoleculares. Ganadores anteriores del premio (los años se refieren a la conferencia anual en la que se entregó el premio): [ 12 ]
- En 2023, Christie G. Enke y Richard Yost fueron galardonados por el desarrollo del espectrómetro de masas de triple cuadrupolo y por el enorme impacto que estos dispositivos han tenido en una amplia gama de aplicaciones de investigación biomédica.
- 2022 Jennifer Lippincott-Schwartz
- En 2020, George Church fue galardonado por su innovadora investigación en secuenciación genómica y su liderazgo en los campos de la terapia génica y las tecnologías de biología sintética.
- 2019 Richard M. Caprioli por el descubrimiento del procesamiento temporal y espacial en sistemas biológicos mediante espectrometría de masas.
- 2018 Amos Bairoch por el desarrollo de recursos comunitarios como la base de conocimientos UniProtKB/Swiss-Prot , PROSITE , ENZYME y neXtProt .
- 2017 Sir Shankar Balasubramanian y David Klenerman por la invención de un método de secuenciación de ADN de próxima generación que hoy se conoce comúnmente como "secuenciación por síntesis".
- 2016 Emmanuelle Charpentier y Jennifer Doudna por el desarrollo de las tecnologías de edición genómica CRISPR/Cas9.
- 2015 John G. White y William Bradshaw Amos por el desarrollo de un microscopio confocal de barrido láser de alta resolución.
- 2014 Patrick H. O'Farrell , por el desarrollo de la electroforesis en gel bidimensional.
- 2013 Leonard Herzenberg y Leonore Herzenberg por el desarrollo de la clasificación celular activada por flujo (FACS).
- 2012 Alan G. Marshall por el desarrollo de la espectrometría de masas por resonancia ciclotrónica de iones con transformada de Fourier (FT-ICR).
- 2011 Sir Alec John Jeffreys : Desarrolló técnicas para la identificación genética mediante huellas dactilares y perfiles de ADN.
- 2010 Pat Brown : Trabajo pionero en el desarrollo de microarrays y las diversas aplicaciones de esta tecnología en la investigación genética.
- 2009 Mathias Uhlén
- 2008 Ruedi Aebersold
- 2007 Donald F. Hunt
- 2006 Roger Tsien
- 2005 Stephen Fodor
- 2004 Edwin Southern
- 2003 Franz Hillenkamp y Michael Karas
- 2002 John Fenn
- 2001 Csaba Horvath
- 2000 Leroy Hood
- 1999 Marvin H. Caruthers por sus contribuciones pioneras a la síntesis química del ADN y el ARN.
- 1998 Bruce Merrifield
- 1997 Lloyd M. Smith
- 1996 David Lipman
- 1995 Klaus Biemann
- 1994 Frederick Sanger
Revista de Técnicas Biomoleculares
La ABRF es la editorial de la revista Journal of Biomolecular Techniques. La revista es revisada por pares y se publica trimestralmente. [ 13 ] El objetivo principal de la revista es publicar revisiones científicas y artículos relacionados con instalaciones de recursos biomoleculares. Los informes publicados por el Grupo de Investigación incluyen encuestas anuales. También se incluyen noticias y eventos, así como un seguimiento de artículos centrado en las técnicas utilizadas en entornos típicos de instalaciones centrales. El actual editor jefe es Ron Orlando, de la Universidad de Georgia .
Junta Ejecutiva de ABRF
- Kevin Knudtson, presidente de ABRF, División de Genómica, Universidad de Iowa
- Justine Kigenyi, tesorera, Centro médico de KU
- Marie Adams, Instituto Van Andel
- Roxann Ashworth, Universidad Johns Hopkins
- Kym Delventhal, Instituto Stowers para la Investigación Médica
- Sridar Chittur, SUNY Albany
- Nick Ambulos, Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland
- Sue Weintraub, Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Texas en San Antonio
- Magnus Palmblad, Centro Médico de la Universidad de Leiden
- Ken Schoppmann, director ejecutivo de ABRF
Referencias
- ↑ "Declaración de misión" . Asociación de instalaciones de recursos biomoleculares. Archivado del original el 1 de abril de 2019. Consultado el 4 de marzo de 2020 .
- ↑ Crabb, JW: "ABRF; Una breve historia" ABRF News, junio de 1995
- ↑ "Directrices para grupos de investigación" (PDF) . Asociación de instalaciones de recursos biomoleculares. Archivado del original (PDF) el 31 de enero de 2012. Consultado el 15 de abril de 2009 .
- ↑ Choi, Meena; Eren-Dogu, Zeynep F.; Colangelo, Christopher; Cottrell, John; Hoopmann, Michael R.; Kapp, Eugene A.; Kim, Sangtae; Lam, Henry; Neubert, Thomas A.; Palmblad, Magnus; Phinney, Brett S.; Weintraub, Susan T.; MacLean, Brendan; Vitek, Olga (2017). "ABRF Proteome Informatics Research Group (iPRG) 2015 Study: Detection of Differentially Abundant Proteins in Label-Free Quantitative LC–MS/MS Experiments". Journal of Proteome Research . 16 (2): 945– 957. doi : 10.1021/acs.jproteome.6b00881 . PMID 27990823 . S2CID 4578078 .
- ↑ Chalkley, Robert J.; Bandeira, Nuno; Chambers, Matthew C.; Clauser, Karl R.; Cottrell, John S.; Deutsch, Eric W.; Kapp, Eugene A.; Lam, Henry HN; McDonald, W. Hayes; Neubert, Thomas A.; Sun, Rui-Xiang (2014). "Grupo de investigación en informática del proteoma (iPRG)_2012: un estudio sobre la detección de péptidos modificados en una mezcla compleja" . Molecular & Cellular Proteomics . 13 (1): 360–371 . doi : 10.1074/mcp.M113.032813 . PMC 3879627. PMID 24187338. Recuperado el 5 de noviembre de 2018 .
- ↑ Bennett, Keiryn L.; Wang, Xia; Bystrom, Cory E.; Chambers, Matthew C.; Andacht, Tracy M.; Dangott, Larry J.; Elortza, Félix; Leszyk, John; Molina, Henrik; Moritz, Robert L.; Phinney, Brett S.; Thompson, J. Will; Bunger, Maureen K.; Tabb, David L. (2015). "Estudio del Grupo de Investigación Proteómica ABRF 2012/2013: Evaluación de la variabilidad intralaboratorio longitudinal en análisis rutinarios de cromatografía líquida de péptidos y espectrometría de masas en tándem" . Molecular & Cellular Proteomics . 14 (12): 3299– 3309. doi : 10.1074/mcp.O115.051888 . PMC 4762617 . PMID 26435129. Consultado el 5 de noviembre de 2018 .
- ↑ Nguyen, Trung Hai; Rustenburg, Ariën S.; Krimmer, Stefan G.; Zhang, Hexi; Clark, John D.; Novick, Paul A.; Branson, Kim; Pande, Vijay S.; Chodera, John D.; Minh, David DL (2018). " Análisis bayesiano de calorimetría de titulación isotérmica para termodinámica de unión" . PLOS ONE . 13 (9) e0203224. Bibcode : 2018PLoSO..1303224N . doi : 10.1371/journal.pone.0203224 . PMC 6136728. PMID 30212471 .
- ↑ The, Matthew; Edfors, Fredrik; Perez-Riverol, Yasset; Payne, Samuel H.; Hoopmann, Michael R.; Palmblad, Magnus; Forsström, Björn; Käll, Lukas (2018). "Un estándar de proteínas que emula la homología para la caracterización de algoritmos de inferencia de proteínas" . Journal of Proteome Research . 17 (5): 1879– 1886. doi : 10.1021/acs.jproteome.7b00899 . PMC 6474350. PMID 29631402 .
- ↑ Wu, Guanying; Wan, Xiang; Xu, Baohua (2018). "Una nueva estimación de la tasa de falsos descubrimientos a nivel de proteínas" . BMC Genomics . 19 (Supl. 6): 567. doi : 10.1186/s12864-018-4923-3 . PMC 6101079. PMID 30367581 .
- ↑ "Estándares universales de proteómica: validando el futuro de la proteómica" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ↑ "Estándares proteómicos UPS1 y UP2" . Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ↑ "Premio ABRF" . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado del original el 30 de enero de 2012. Consultado el 22 de agosto de 2016 .
- ↑ "JBT: Journal of Biomolecular Techniques" . Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares. Archivado del original el 10 de septiembre de 2022. Consultado el 16 de octubre de 2022 .
Enlaces externos
- Asociación de Instalaciones de Recursos Biomoleculares (ABRF)
- Federación de Sociedades Americanas de Biología Experimental (FASEB)
- Foro de debate de ABRF
- Revista de Técnicas Biomoleculares
- ABRF en LinkedIn
- Liderazgo
- Sociedades científicas con sede en los Estados Unidos
- Organizaciones de biotecnología
- Asociaciones profesionales con sede en los Estados Unidos
- Establecimientos de 1989