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AFF2

El miembro 2 de la familia AF4/FMR2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen AFF2 . ​​[ 5 ] Las mutaciones en AFF2 están implicadas en casos de cáncer de mama ....

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El miembro 2 de la familia AF4/FMR2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen AFF2 . ​​[ 5 ] Las mutaciones en AFF2 están implicadas en casos de cáncer de mama . [ 6 ]

Las expansiones de repeticiones CCG en este gen están asociadas con la discapacidad intelectual ligada al cromosoma X y, específicamente, con un síndrome conocido como retraso mental por cromosoma X frágil (FRAXE). FRAXE es una de las formas más comunes de discapacidad intelectual ligada al cromosoma X no sindrómica. El gen también se conoce como FMR2 (Fragile Mental Retardation 2) debido a esta condición. [ 7 ]

Genómica

Este gen se localiza en el brazo largo del cromosoma X (Xq27.3-Xq28). Posee 22 exones que abarcan al menos 500 kb. Puede producirse un procesamiento alternativo del ARN mensajero que involucre los exones 2, 3, 5, 7 y 21. La proteína codificada normalmente tiene una longitud de 1311 codones . Se expresa como un transcrito de 8,7 kilobases en la placenta y el cerebro adulto .

La región 5' no traducida normal tiene entre 10 y 35 repeticiones de CCG y, con mayor frecuencia, entre 15 y 20. Las expansiones patogénicas suelen tener más de 200 repeticiones y están metiladas.

Este gen pertenece a la familia de genes AFF, que actualmente cuenta con cuatro miembros: AFF1 /AF4, AFF2/FMR2, AFF3 /LAF4 y AFF4 /AF5q31. [ 8 ] Todas las proteínas AFF se localizan en el núcleo y actúan como activadores transcripcionales con una acción positiva sobre la elongación del ARN. AFF2/FMR2, AFF3/LAF4 y AFF4/AF5q31 se localizan en las motas nucleares (estructuras subnucleares consideradas sitios de almacenamiento/modificación de factores de empalme de pre-ARNm) y pueden unirse al ARN con una alta afinidad aparente por la estructura G-cuadruplex. Parecen modular el empalme alternativo mediante la interacción con la estructura formadora de ARN G-cuadruplex.

Se ha informado que los demás miembros de esta familia forman genes de fusión como consecuencia de translocaciones cromosómicas y están involucrados en la patogénesis de la leucemia mieloide/linfoide o de linaje mixto .

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000155966 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031189 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ "Gen Entrez: Familia AFF2 AF4/FMR2, miembro 2" .
  6. ↑ The Cancer Genome Atlas Network (octubre de 2012). "Retratos moleculares completos de tumores de mama humanos" . Nature . 490 (7418): 61– 70. Bibcode : 2012Natur.490...61T . doi : 10.1038/nature11412 . PMC 3465532. PMID 23000897 .  
  7. ↑ Stettner GM, Shoukier M, Höger C, Brockmann K, Auber B (agosto de 2011). "Discapacidad intelectual familiar y comportamiento autista causados ​​por una pequeña deleción del gen FMR2". American Journal of Medical Genetics. Parte A. 155A ( 8): 2003–7 . doi : 10.1002/ajmg.a.34122 . PMID 21739600. S2CID 9568277 .  
  8. ^ Melko M, Douguet D, Bensaid M, Zongaro S, Verheggen C, Gecz J, Bardoni B (mayo de 2011). "Caracterización funcional de la familia AFF (AF4/FMR2) de proteínas de unión a ARN: conocimientos sobre la patología molecular de la discapacidad intelectual FRAXE" . Genética Molecular Humana . 20 (10): 1873–85 . doi : 10.1093/hmg/ddr069 . PMID 21330300 . 

Lecturas adicionales

  • Mulley JC, Yu S, Loesch DZ, Hay DA, Donnelly A, Gedeon AK, Carbonell P, López I, Glover G, Gabarrón I (marzo de 1995). «FRAXE y el retraso mental» . Revista de genética médica . 32 (3): 162– 9. doi : 10.1136/jmg.32.3.162 . PMC 1050310 . PMID 7783162 .  
  • Gecz J, Gedeon AK, Sutherland GR , Mulley JC (mayo de 1996). "Identificación del gen FMR2, asociado con el retraso mental FRAXE". Nature Genetics . 13 (1): 105–8 . doi : 10.1038/ng0596-105 . PMID 8673085. S2CID 40161014 .  
  • Gu Y, Shen Y, Gibbs RA, Nelson DL (mayo de 1996). "Identificación de FMR2, un nuevo gen asociado con la repetición FRAXE CCG y la isla CpG". Nature Genetics . 13 (1): 109–13 . doi : 10.1038/ng0596-109 . PMID 8673086. S2CID 6781698 .  
  • Chakrabarti L, Knight SJ, Flannery AV, Davies KE (febrero de 1996). "Un gen candidato para la discapacidad intelectual leve en el sitio frágil FRAXE" . Human Molecular Genetics . 5 (2): 275–82 . doi : 10.1093/hmg/5.2.275 . PMID 8824884 . 
  • Gécz J, Oostra BA, Hockey A, Carbonell P, Turner G, Haan EA, Sutherland GR , Mulley JC (marzo de 1997). "Expresión de FMR2 en familias con retraso mental FRAXE" . Human Molecular Genetics . 6 (3): 435–41 . doi : 10.1093/hmg/6.3.435 . PMID 9147647 . 
  • Gecz J, Bielby S, Sutherland GR , Mulley JC (septiembre de 1997). "Estructura genética y localización subcelular de FMR2, un miembro de una nueva familia de supuestos activadores de la transcripción". Genomics . 44 (2): 201–13 . doi : 10.1006/geno.1997.4867 . PMID 9299237 . 
  • Chakrabarti L, Bristulf J, Foss GS, Davies KE (marzo de 1998). "Expresión del homólogo murino de FMR2 en el cerebro del ratón y durante el desarrollo" . Human Molecular Genetics . 7 (3): 441–8 . doi : 10.1093/hmg/7.3.441 . PMID 9467002 . 
  • Gecz J, Mulley JC (1999). "Caracterización y expresión de una isoforma grande de FMR2 de 13,7 kb" . European Journal of Human Genetics . 7 (2): 157– 62. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200279 . PMID 10196698 . 
  • Murray A, Webb J, Dennis N, Conway G, Morton N (octubre de 1999). "Las microdeleciones en FMR2 pueden ser una causa significativa de insuficiencia ovárica prematura" . Journal of Medical Genetics . 36 (10): 767–70 . doi : 10.1136/jmg.36.10.767 . PMC 1734234. PMID 10528856 .  
  • Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (marzo de 2000). "Secuenciación rápida del transcriptoma humano con etiquetas de secuencia expresadas en ORF" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (7): 3491– 6. Código bibliográfico : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .  
  • Lo Nigro C, Faravelli F, Cavani S, Perroni L, Novello P, Vitali M, Bricarelli FD, Grasso M (marzo de 2000). "Mutación FRAXE en un sujeto con retraso mental y en su hermano gemelo fenotípicamente normal" . European Journal of Human Genetics . 8 (3): 157– 62. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200425 . PMID 10780779 . 
  • Tzeng CC, Tzeng PY, Sun HS, Chen RM, Lin SJ (junio de 2000). "Implicaciones del cribado de mutaciones de los genes FMR1 y FMR2 en individuos con retraso mental inespecífico en Taiwán". Diagnostic Molecular Pathology . 9 (2): 75– 80. doi : 10.1097/00019606-200006000-00002 . PMID 10850542 . 
  • Musumeci SA, Scuderi C, Ferri R, Anello G, Salluzzo R, Bosco P, Elia M (septiembre de 2000). "¿Existe un patrón EEG peculiar también para el retraso mental FRAXE?". Neurofisiología clínica . 111 (9): 1632–6.doi : 10.1016 / S1388-2457(00 ) 00367-9 . PMID 10964075 . S2CID 42912350 .  
  • Hillman MA, Gecz J (2001). "La proteína 2 de retraso mental familiar asociada al síndrome del cromosoma X frágil (FMR2) actúa como un potente activador de la transcripción" . Journal of Human Genetics . 46 (5): 251– 9. doi : 10.1007/s100380170074 . PMID 11355014 . 
  • Kitano T, Schwarz C, Nickel B, Pääbo S (agosto de 2003). "Patrones de diversidad genética en 10 loci del cromosoma X en humanos y chimpancés" . Biología Molecular y Evolución . 20 (8): 1281–9 . doi : 10.1093/molbev/msg134 . PMID 12777533 . 
  • Brylawski BP, Chastain PD, Cohen SM, Cordeiro-Stone M, Kaufman DG (abril de 2007). "Mapeo de un origen de replicación del ADN en el promotor del gen FMR1 del síndrome del cromosoma X frágil" . Experimental and Molecular Pathology . 82 (2): 190– 6. doi : 10.1016/j.yexmp.2006.10.004 . PMC 1934615. PMID 17196195 .