Articulo de referencia

Minero ARG

ARGminer es una base de datos que se centra en el novedoso método de curación colaborativa sobre la curación manual de genes de resistencia a antibióticos (ARG) obtenidos de múl...

ARGminer es una base de datos que se centra en el novedoso método de curación colaborativa sobre la curación manual de genes de resistencia a antibióticos (ARG) obtenidos de múltiples fuentes como CARD , ARDB , NDARO, DeepARG, Uniprot , ResFinder y SARG. [ 1 ] Además, debido a la existencia de elementos genéticos móviles (MGE), ARGminer también interactúa con PATRIC y ACLAME. [ 1 ] ARGminer anota los genes utilizando su nombre, categoría de antibiótico , mecanismo de resistencia, evidencia de movilidad y ocurrencia en cepas bacterianas clínicamente importantes. [ 1 ] Hay dos grupos de curadores colaborativos. Uno fue contratado en Amazon Mechanical Turk , que ofrece una amplia audiencia de expertos y no expertos colaborativos que pueden anotar a cambio de una recompensa monetaria. Debido a la presencia de experiencia mixta, cada usuario solo puede realizar un máximo de 20 anotaciones. El otro grupo es una clase de microbiología de nivel de posgrado. [ 1 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 4 Zhang, L.; Vikingsland, PJ; Pruden, A .; Heath, LS; Riquelme, MV; Garner, E.; Gurón, GKP; Arango-Argoty, GA (2020). "ARGminer: una plataforma web para la curación de genes de resistencia a antibióticos basada en crowdsourcing". Bioinformática . 36 (9): 2966–2973 . bioRxiv 10.1101/274282 . doi : 10.1093/bioinformática/btaa095 . PMID 32058567 .