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ATRX

El regulador transcripcional ATRX, también conocido como helicasa dependiente de ATP ATRX , helicasa II ligada al cromosoma X o proteína nuclear ligada al cromosoma X (XNP), es ...

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El regulador transcripcional ATRX, también conocido como helicasa dependiente de ATP ATRX , helicasa II ligada al cromosoma X o proteína nuclear ligada al cromosoma X (XNP), es una proteína que en humanos está codificada por el gen ATRX . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Función

El regulador transcripcional ATRX contiene un dominio ATPasa / helicasa y, por lo tanto, pertenece a la familia SWI/SNF de proteínas remodeladoras de la cromatina . ATRX es necesario para la deposición de la variante de histona H3.3 en los telómeros y otras repeticiones genómicas. [ 8 ] Estas interacciones son importantes para mantener el silenciamiento en estos sitios. [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

Además, ATRX sufre fosforilación dependiente del ciclo celular , lo que regula su asociación con la matriz nuclear y la cromatina, y sugiere su participación en la regulación génica en la interfase y la segregación cromosómica en la mitosis. [ 7 ]

Importancia clínica

Mutaciones hereditarias

Las mutaciones hereditarias del gen ATRX se asocian con un síndrome de discapacidad intelectual ligada al cromosoma X ( XLMR ), que con mayor frecuencia se acompaña del síndrome de alfa-talasemia ( ATR-X ). Se ha demostrado que estas mutaciones causan diversos cambios en el patrón de metilación del ADN , lo que podría establecer un vínculo entre la remodelación de la cromatina, la metilación del ADN y la expresión génica en los procesos de desarrollo. Se han descrito múltiples variantes de transcripción con empalme alternativo que codifican isoformas distintas . Las mujeres portadoras pueden presentar inactivación sesgada del cromosoma X. [ 7 ]

Mutaciones somáticas

Se han descrito mutaciones adquiridas en ATRX en varios cánceres humanos, incluidos tumores neuroendocrinos pancreáticos , [ 12 ] gliomas , [ 13 ] [ 14 ] osteosarcomas , [ 15 ] sarcomas de tejidos blandos , [ 16 ] y feocromocitomas malignos . [ 17 ] Existe una fuerte correlación entre las mutaciones de ATRX y un fenotipo de alargamiento alternativo de telómeros (ALT) en cánceres. [ 12 ]

Interacciones

ATRX forma un complejo con DAXX , que es una chaperona de la histona H3.3. [ 18 ]

También se ha demostrado que ATRX interactúa con EZH2 . [ 19 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000085224 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000031229 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Stayton CL, Dabovic B, Gulisano M, Gecz J, Broccoli V, Giovanazzi S, et al. (noviembre de 1994). "Clonación y caracterización de un nuevo gen humano Xq13 que codifica una supuesta helicasa". Human Molecular Genetics . 3 (11): 1957– 64. doi : 10.1093/hmg/3.11.1957 . PMID 7874112 .  
  6. ↑ Gibbons RJ, Suthers GK, Wilkie AO, Buckle VJ, Higgs DR (noviembre de 1992). "Síndrome de alfa-talasemia/retraso mental ligado al cromosoma X (ATR-X): localización en Xq12-q21.31 mediante inactivación del cromosoma X y análisis de ligamiento" . American Journal of Human Genetics . 51 (5): 1136–49 . PMC 1682840. PMID 1415255 .  
  7. 1 2 3 "Gen Entrez: Síndrome de talasemia alfa/retraso mental ligado al cromosoma X ATRX (homólogo de RAD54, S. cerevisiae)" .
  8. ↑ Wong LH, McGhie JD, Sim M, Anderson MA, Ahn S, Hannan RD, et al. (marzo de 2010). " ATRX interactúa con H3.3 en el mantenimiento de la integridad estructural de los telómeros en células madre embrionarias pluripotentes" . Genome Research . 20 (3): 351– 60. doi : 10.1101/gr.101477.109 . PMC 2840985. PMID 20110566 .   
  9. ↑ Voon HP, Hughes JR, Rode C, De La Rosa-Velázquez IA, Jenuwein T, Feil R, et al. (abril de 2015). "ATRX desempeña un papel clave en el mantenimiento del silenciamiento en loci heterocromáticos intersticiales y genes improntados" . Cell Reports . 11 (3): 405–18 . doi : 10.1016/j.celrep.2015.03.036 . PMC 4410944. PMID 25865896 .   
  10. ↑ Elsässer SJ, Noh KM, Diaz N, Allis CD, Banaszynski LA (junio de 2015). "La histona H3.3 es necesaria para el silenciamiento de elementos retrovirales endógenos en células madre embrionarias" . Nature . 522 ( 7555): 240–4 . Bibcode : 2015Natur.522..240E . doi : 10.1038/nature14345 . PMC 4509593. PMID 25938714 .  
  11. ↑ Udugama M, M Chang FT, Chan FL, Tang MC, Pickett HA, R McGhie JD, et al. (diciembre de 2015). "La variante de histona H3.3 proporciona la marca de trimetilación de la lisina 9 de la histona heterocromática en los telómeros" . Nucleic Acids Research . 43 (21): 10227–37 . doi : 10.1093/nar/gkv847 . PMC 4666390. PMID 26304540 .   
  12. 1 2 Heaphy CM, de Wilde RF, Jiao Y, Klein AP, Edil BH, Shi C, et al. (julio de 2011). " Telómeros alterados en tumores con mutaciones ATRX y DAXX" . Science . 333 (6041): 425. Bibcode : 2011Sci...333..425H . doi : 10.1126/science.1207313 . PMC 3174141. PMID 21719641 .   
  13. ↑ Schwartzentruber J, Korshunov A, Liu XY, Jones DT, Pfaff E, Jacob K, et al. (enero de 2012). "Mutaciones impulsoras en la histona H3.3 y genes de remodelación de la cromatina en glioblastoma pediátrico". Nature . 482 ( 7384): 226– 31. Bibcode : 2012Natur.482..226S . doi : 10.1038/nature10833 . PMID 22286061. S2CID 4312169 .   
  14. ↑ Kannan K, Inagaki A, Silber J, Gorovets D, Zhang J, Kastenhuber ER, et al. (octubre de 2012). " La secuenciación del exoma completo identifica la mutación de ATRX como un determinante molecular clave en el glioma de bajo grado" . Oncotarget . 3 (10): 1194–203 . doi : 10.18632/oncotarget.689 . PMC 3717947. PMID 23104868 .   
  15. ↑ Chen X, Bahrami A, Pappo A, Easton J, Dalton J, Hedlund E, et al. (abril de 2014). " Las variaciones estructurales somáticas recurrentes contribuyen a la tumorigénesis en el osteosarcoma pediátrico" . Cell Reports . 7 (1): 104–12 . doi : 10.1016/j.celrep.2014.03.003 . PMC 4096827. PMID 24703847 .   
  16. ↑ Cancer Genome Atlas Research Network (noviembre de 2017). "Caracterización genómica integral e integrada de los sarcomas de tejidos blandos en adultos" . Cell . 171 ( 4): 950– 965. doi : 10.1016/j.cell.2017.10.014 . PMC 5693358. PMID 29100075 .  
  17. ↑ Comino-Méndez, I (junio de 2016). "Mutación impulsora de ATRX en un feocromocitoma maligno compuesto". Cancer Genetics . 209 (6): 272–7 . doi : 10.1016/j.cancergen.2016.04.058 . hdl : 10641/3656 . PMID 27209355 . 
  18. ↑ Lewis PW, Elsaesser SJ, Noh KM, Stadler SC, Allis CD (agosto de 2010). "Daxx es una chaperona de histonas específica de H3.3 y coopera con ATRX en el ensamblaje de cromatina independiente de la replicación en los telómeros" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 107 (32): 14075–80 . Bibcode : 2010PNAS..10714075L . doi : 10.1073/pnas.1008850107 . PMC 2922592. PMID 20651253 .  
  19. ↑ Cardoso C, Timsit S, Villard L, Khrestchatisky M, Fontès M, Colleaux L (abril de 1998). "Interacción específica entre el producto del gen XNP/ATR-X y el dominio SET de la proteína humana EZH2" . Human Molecular Genetics . 7 (4): 679–84 . doi : 10.1093/hmg/7.4.679 . PMID 9499421 . 

Lecturas adicionales

  • Mulley JC, Kerr B, Stevenson R, Lubs H (1992). "Directrices de nomenclatura para el retraso mental ligado al cromosoma X". American Journal of Medical Genetics . 43 ( 1– 2): 383– 91. doi : 10.1002/ajmg.1320430159 . PMID 1605216 . 
  • Tang P, Park DJ, Marshall Graves JA, Harley VR (septiembre de 2004). "ATRX y diferenciación sexual". Trends in Endocrinology and Metabolism . 15 (7): 339– 44. doi : 10.1016/j.tem.2004.07.006 . PMID 15350606. S2CID 22192941 .  
  • Olvídese de BG (marzo de 2006). "Formas de novo y adquiridas de alfa talasemia". Current Hematology Reports . 5 (1): 11– 4. PMID 16537041 . 
  • Adès LC, Kerr B, Turner G, Wise G (septiembre de 1991). "Síndrome de Smith-Fineman-Myers en dos hermanos". American Journal of Medical Genetics . 40 (4): 467– 70. doi : 10.1002/ajmg.1320400419 . PMID 1684092 . 
  • Sutherland GR , Gedeon AK, Haan EA, Woodroffe P, Mulley JC (1988). "Estudios de ligamiento con el gen de un síndrome ligado al cromosoma X de retraso mental, microcefalia y diplejía espástica (MRX2)". American Journal of Medical Genetics . 30 ( 1–2 ): 493–508 . doi : 10.1002/ajmg.1320300152 . PMID 3177467 . 
  • Shapiro MB, Senapathy P (septiembre de 1987). "Uniones de empalme de ARN de diferentes clases de eucariotas: estadísticas de secuencia e implicaciones funcionales en la expresión génica" . Nucleic Acids Research . 15 (17): 7155–74 . doi : 10.1093/nar/15.17.7155 . PMC 306199. PMID 3658675 .  
  • Gibbons RJ, Picketts DJ, Villard L, Higgs DR (marzo de 1995). "Las mutaciones en un supuesto regulador transcripcional global causan retraso mental ligado al cromosoma X con alfa-talasemia (síndrome ATR-X)" . Cell . 80 (6): 837–45 . doi : 10.1016/0092-8674(95)90287-2 . PMID 7697714 . 
  • Wang LH, Collins A, Lawrence S, Keats BJ, Morton NE (agosto de 1994). "Integración de mapas genéticos: cromosoma X". Genomics . 22 (3): 590– 604. doi : 10.1006/geno.1994.1432 . PMID 8001970 . 
  • Gecz J, Pollard H, Consalez G, Villard L, Stayton C, Millasseau P, Khrestchatisky M, Fontes M (enero de 1994). "Clonación y expresión del homólogo murino de un supuesto gen de proteína nuclear humana ligada al cromosoma X estrechamente ligado a PGK1 en Xq13.3". Human Molecular Genetics . 3 (1): 39– 44. doi : 10.1093/hmg/3.1.39 . PMID 8162050 . 
  • Villard L, Gecz J, Mattéi JF, Fontés M, Saugier-Veber P, Munnich A, Lyonnet S (abril de 1996). "Mutación XNP en una familia numerosa con síndrome de Juberg-Marsidi". Nature Genetics . 12 (4): 359– 60. doi : 10.1038/ng0496-359 . PMID 8630485. S2CID 33759894 .  
  • Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 . 
  • Picketts DJ, Higgs DR, Bachoo S, Blake DJ, Quarrell OW, Gibbons RJ (diciembre de 1996). "ATRX codifica un nuevo miembro de la familia de proteínas SNF2: las mutaciones apuntan a un mecanismo común subyacente al síndrome ATR-X" . Human Molecular Genetics . 5 (12): 1899–907 . doi : 10.1093/hmg/5.12.1899 . PMID 8968741 . 
  • Villard L, Lacombe D, Fontés M (1997). "Una mutación puntual en el gen XNP, asociada con un fenotipo ATR-X sin alfa-talasemia". European Journal of Human Genetics . 4 (6): 316– 20. doi : 10.1159/000472225 . PMID 9043863. S2CID 43618843 .  
  • Villard L, Lossi AM, Cardoso C, Proud V, Chiaroni P, Colleaux L, Schwartz C, Fontés M (julio de 1997). "Determinación de la estructura genómica del gen XNP/ATRX que codifica una helicasa potencial de dedos de zinc". Genomics . 43 (2): 149– 55. doi : 10.1006/geno.1997.4793 . PMID 9244431 . 
  • Golub EI, Kovalenko OV, Gupta RC, Ward DC, Radding CM (octubre de 1997). "Interacción de las proteínas de recombinación humanas Rad51 y Rad54" . Nucleic Acids Research . 25 (20): 4106–10 . doi : 10.1093/nar/25.20.4106 . PMC 147015. PMID 9321665 .  
  • Gibbons RJ, Bachoo S, Picketts DJ, Aftimos S, Asenbauer B, Bergoffen J, Berry SA, Dahl N, Fryer A, Keppler K, Kurosawa K, Levin ML, Masuno M, Neri G, Pierpont ME, Slaney SF, Higgs DR (octubre de 1997). "Las mutaciones en el regulador transcripcional ATRX establecen la importancia funcional de un dominio similar a PHD". Nature Genetics . 17 (2): 146–8 . doi : 10.1038/ng1097-146 . PMID 9326931. S2CID 12470300 .  
  • Cardoso C, Timsit S, Villard L, Khrestchatisky M, Fontès M, Colleaux L (abril de 1998). "Interacción específica entre el producto del gen XNP/ATR-X y el dominio SET de la proteína humana EZH2" . Human Molecular Genetics . 7 (4): 679–84 . doi : 10.1093/hmg/7.4.679 . PMID 9499421 . 
  • Bérubé NG, Mangelsdorf M, Jagla M, Vanderluit J, Garrick D, Gibbons RJ, Higgs DR, Slack RS, Picketts DJ (febrero de 2005). "La proteína ATRX, que remodela la cromatina , es fundamental para la supervivencia neuronal durante la corticogénesis" . The Journal of Clinical Investigation . 115 (2): 258–67 . doi : 10.1172/JCI22329 . PMC 544602. PMID 15668733 .  
  • Entrada de GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre el síndrome de retraso mental ligado al cromosoma X por alfa-talasemia; síndrome ATRX; alfa-talasemia/retraso mental ligado al cromosoma X; síndrome XLMR-hipotónico facial.
  • Entradas de OMIM sobre el síndrome de retraso mental ligado al cromosoma X por alfa-talasemia
  • Ubicación del genoma humano ATRX y página con detalles del gen ATRX en el navegador genómico de UCSC .
  • Ubicación del genoma humano RAD54L y página de detalles del gen RAD54L en el navegador genómico de UCSC .
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