Articulo de referencia

Cartera internacional de investigación sobre el envejecimiento

El Portafolio Internacional de Investigación sobre el Envejecimiento ( IARP ) es un sistema de gestión del conocimiento sin ánimo de lucro y de acceso abierto que integra subven...

El Portafolio Internacional de Investigación sobre el Envejecimiento ( IARP ) es un sistema de gestión del conocimiento sin ánimo de lucro y de acceso abierto que integra subvenciones , publicaciones y congresos en ciencias naturales, sociales y del comportamiento. Además de las herramientas de búsqueda avanzada y análisis visual de tendencias, el sistema incluye un directorio de proyectos de investigación clasificados en categorías relacionadas con la investigación sobre el envejecimiento. El sistema utiliza algoritmos de clasificación automática con elementos de aprendizaje automático para asignar los proyectos de investigación a las categorías pertinentes. El directorio está gestionado por numerosos editores expertos de categorías y miembros del consejo asesor científico. El presidente del consejo asesor científico es el Dr. Charles Cantor .

Fondo

La investigación sobre el envejecimiento es un campo multidisciplinario que abarca numerosas áreas de las ciencias naturales, sociales y del comportamiento, y los datos de investigación se encuentran ampliamente dispersos. Recursos populares como PubMed y Google Scholar permiten acceder a resúmenes científicos históricos y a las publicaciones completas más recientes. Sin embargo, existen pocos recursos que integren bases de datos internacionales de publicaciones científicas, resúmenes de solicitudes de subvención y bases de datos de ensayos clínicos.

Los resúmenes de las solicitudes de subvención suelen ser publicados por las organizaciones financiadoras y preceden a las publicaciones en revistas científicas revisadas por pares. Algunos de los experimentos descritos en los resúmenes no prosperan o no se publican en revistas científicas revisadas por pares. Para evitar la redundancia y fomentar la cooperación científica, es importante consultar toda la información disponible sobre subvenciones a nivel mundial para comprobar si existen proyectos similares que estén recibiendo financiación.

La base de datos IARP integra información sobre subvenciones para investigación, publicaciones revisadas por pares y solicitudes de patentes emitidas, provenientes de diversas fuentes. Además, utiliza mecanismos y herramientas flexibles de clasificación de proyectos para analizar las asociaciones y tendencias entre ellos. Este sistema permite a los científicos buscar en la base de datos centralizada, clasificar y categorizar proyectos sobre el envejecimiento y analizar los aspectos de financiación en múltiples disciplinas de investigación. IARP está diseñada para optimizar la asignación y priorización de los escasos fondos para la investigación, reducir la superposición de proyectos y mejorar la colaboración científica, acelerando así el progreso científico y médico en un área de investigación en rápido crecimiento.

El sistema IARP agrega datos de subvenciones de diversas fuentes, incluyendo los Institutos Nacionales de Salud (NIH) de EE. UU. , la Comisión Europea (CE) , los Institutos Canadienses de Investigación en Salud , la Fundación Nacional de Ciencias de EE. UU. , el Consejo Nacional de Salud y Medicina de Australia y datos de resúmenes de publicaciones mediante una licencia de la base de datos MEDLINE . La base de datos permite realizar búsquedas y los resultados se pueden presentar en forma de gráficos para el análisis de tendencias. Una de las principales características del sistema IARP es la clasificación automática y manual de los proyectos de investigación en un directorio estructurado. El consejo asesor científico de IARP y los editores de categorías expertos voluntarios clasifican los proyectos de la base de datos en las categorías pertinentes. Estos proyectos clasificados manualmente se convierten en conjuntos de entrenamiento para los algoritmos de clasificación automática con elementos de aprendizaje automático. El sistema IARP es altamente modular y portátil, y puede utilizarse como plataforma para desarrollar otros sistemas de gestión del conocimiento para la investigación sobre el envejecimiento.

Contenido

El Portafolio Internacional de Investigación sobre el Envejecimiento (IARP, por sus siglas en inglés) incluye datos históricos de subvenciones de los Institutos Nacionales de Salud (NIH) , la Comisión Europea (CE) , la Fundación Nacional de Ciencias ( NSF) , los consejos de investigación canadienses y australianos, y muchas otras fuentes. También contiene resúmenes de artículos de MEDLINE bajo licencia de la Biblioteca Nacional de Medicina. El equipo de desarrollo voluntario del IARP trabaja directamente con las oficinas de publicación y actualiza periódicamente la base de datos, ya sea automáticamente o analizando los datos enviados por correo postal.

Características

Búsquedas sencillas

En IARP se pueden realizar búsquedas sencillas introduciendo los aspectos clave de un tema en la ventana de búsqueda.

IARP traduce esta formulación de búsqueda inicial y agrega automáticamente nombres de campos, operadores booleanos y mejora significativamente la formulación de búsqueda, en particular combinando de forma rutinaria (usando el operador OR) palabras de texto.

'Envejecimiento según la teoría programada'

se traduce como

("Programado" O "Teoría" O "Envejecimiento")

Búsquedas avanzadas

La búsqueda avanzada de proyectos permite a los usuarios limitar sus criterios de búsqueda, desde la fecha de creación y el mecanismo de investigación y financiación hasta proyectos específicos. Además de la descripción, cada proyecto de investigación incluye información específica sobre la entidad financiadora, la entidad receptora y el/los investigador/es principal/es . Asimismo, vincula el proyecto actual con otros proyectos y mecanismos de financiación similares.

Para utilizar eficazmente las funciones de búsqueda avanzada, el usuario debe tener conocimientos sobre el área de investigación y emplear palabras clave y filtros relevantes y específicos. El formulario permite especificar varios valores para una recuperación de datos precisa.

[Palabras clave] . Los usuarios pueden usar operadores booleanos y máscaras para encontrar información en los campos de descripción y título del proyecto.

Ejemplos de consultas de búsqueda:

'nervio*'
'Célula madre Y célula NO embrionaria'
'Acumulación de amiloide en la enfermedad de Alzheimer'

[Áreas de investigación] . Los usuarios pueden limitar sus búsquedas seleccionando las áreas de investigación deseadas en el árbol de categorías.

[Teorías del envejecimiento] . Los usuarios pueden seleccionar varios valores de una lista de Teorías del envejecimiento .

Además, los usuarios pueden limitar su búsqueda mediante:

Años fiscales, número de proyecto, investigadores principales , fechas de inicio y finalización del proyecto, organizaciones receptoras y financiadoras, tipo de financiación.

Trends Analysis Chart & Tools es un conjunto de herramientas para visualizar los datos del proyecto mediante diagramas, gráficos y tablas comparativas. La interfaz permite a los usuarios crear gráficos bidimensionales que comparan la financiación de la investigación por año, institución, universidad, investigador principal, región y categoría.

Estadísticas descriptivas

Representa un análisis exhaustivo de los datos almacenados en el sistema (útil para comprender el contenido de la base de datos por número total de proyectos). Muestra el estado actual de la base de datos, con publicaciones y proyectos detallados  : totales, clasificados, clasificados manualmente, clasificados como antiguos y sin clasificar. Muestra los 50 proyectos activos y finalizados con mayor financiación, los principales países, estados de EE. UU., investigadores, organismos financiadores y organizaciones receptoras, también por financiación total.

Otras herramientas

El sistema también incorpora herramientas como Grant Matchmaker, Who is Who y Funding Organizations, así como Biotechnology Events y Webcasts, que actualmente se encuentran en diversas fases de desarrollo. El objetivo de estas herramientas es brindar a la comunidad investigadora la posibilidad de identificar organizaciones que financian proyectos de investigación similares, encontrar posibles colaboradores y hallar conferencias relevantes para sus intereses de investigación.

Clasificación de datos

Clasificación automática de proyectos

La clasificación automática de proyectos se utiliza para identificar proyectos relacionados con la investigación sobre el envejecimiento dentro de grandes conjuntos de datos y para clasificarlos en grupos semánticos relevantes. El sistema utiliza dos algoritmos de clasificación con elementos de aprendizaje automático: Máquina de Vectores de Soporte ( SVM) y Análisis Factorial Booleano (BFA) basado en Redes Neuronales Recurrentes. [ 1 ] Desde 2014, el algoritmo SVM se modificó para facilitar la clasificación multietiqueta de conjuntos de datos incompletamente etiquetados, donde hay pocas etiquetas asignadas por los expertos de la IARP. Esto permitió mejorar la precisión de la clasificación. [ 2 ]

Clasificación manual de proyectos

Dado que los algoritmos de clasificación automática actuales son limitados y requieren que cada categoría cuente con conjuntos de datos de entrenamiento relativamente grandes, el sistema depende en gran medida de la clasificación manual realizada por editores de categorías expertos. La interfaz administrativa del Consejo Asesor Científico (SAB) y del Editor de Categorías permite a los miembros del SAB , a los directores de institutos y a los jefes de laboratorio gestionar las categorías de nivel superior y delegar la administración de las categorías de nivel inferior a los estudiantes de posgrado.

IARP tiene la capacidad de identificar automáticamente proyectos relacionados y similares en su base de datos mediante un análisis algorítmico de resúmenes de proyectos, patentes y publicaciones. Este tipo de análisis avanzado de proyectos podría ayudar a evitar la superposición de proyectos y la financiación redundante de programas similares, además de resaltar las lagunas de conocimiento para posibles fuentes de financiación.

Otros recursos que utilizan la base de datos de IARP

El proyecto FundingTrends permite realizar búsquedas sencillas por palabras clave entre millones de proyectos biomédicos financiados por las principales organizaciones de investigación a nivel mundial. A continuación, calcula la cantidad de financiación anual para los proyectos que contienen dichas palabras clave.

El proyecto Aging.CC permite realizar una búsqueda sencilla por palabras clave entre millones de proyectos biomédicos financiados por las principales organizaciones de investigación de todo el mundo.

Reseñas

Véase también

Referencias

  1. Alex Zhavoronkov; Charles R. Cantor (22 de julio de 2011). "Métodos para estructurar el conocimiento científico de muchas áreas relacionadas con la investigación del envejecimiento" . PLoS ONE . 6 (7) e22597. Bibcode : 2011PLoSO...622597Z . doi : 10.1371/journal.pone.0022597 . PMC 3142169. PMID 21799912 .  
  2. Antón Kolesov; Dmitri Kamyshenkov; María Litovchenko; Elena Smekalova; Alexey Golovizin; Alex Zhavoronkov (23 de enero de 2014). "Sobre métodos de clasificación de etiquetas múltiples de datos de texto biomédicos etiquetados de forma incompleta" . Métodos Computacionales y Matemáticos en Medicina . 2014 781807.doi : 10.1155 / 2014/781807 . PMC 3920912 . PMID 24587817 .  
  3. GEN (15 de octubre de 2011). "GEN Best Of The Web: 15 de octubre de 2011 (Vol. 31, No. 18)" . Noticias de Ingeniería Genética y Biotecnología .
  • Sitio web del portafolio internacional de investigación sobre el envejecimiento
  • Comunicado de prensa de la Comisión Europea sobre el sistema CORDIS
  • Tutoriales en vídeo de IARP
  • Foro de debate profesional de la IARP
  • Envejecimiento.CC
  • Tendencias de financiación
  • 1