Articulo de referencia

aldolasa de fructosa-bisfosfato

La fructosa-bisfosfato aldolasa ( EC 4.1.2.13 ), a menudo simplemente aldolasa , es una enzima que cataliza una reacción reversible que divide el aldol , fructosa 1,6-bisfosfato...

La fructosa-bisfosfato aldolasa ( EC 4.1.2.13 ), a menudo simplemente aldolasa , es una enzima que cataliza una reacción reversible que divide el aldol , fructosa 1,6-bisfosfato , en los triosafosfatos dihidroxiacetona fosfato (DHAP) y gliceraldehído 3-fosfato (G3P). La aldolasa también puede producir DHAP a partir de otros (3S,4R) -cetosa 1-fosfatos como la fructosa 1-fosfato y la sedoheptulosa 1,7-bisfosfato . La gluconeogénesis y el ciclo de Calvin , que son vías anabólicas , utilizan la reacción inversa. La glucólisis , una vía catabólica , utiliza la reacción directa. La aldolasa se divide en dos clases según su mecanismo.

El término aldolasa también se refiere, de forma más general, a una enzima que realiza una reacción aldólica (creando un aldol ) o su reacción inversa (rompiendo un aldol), como la aldolasa del ácido siálico , que forma ácido siálico . Véase la lista de aldolasas .

Mecanismo y estructura

Las proteínas de clase I forman un intermedio de base de Schiff protonada que une una lisina del sitio activo altamente conservada con el carbono carbonilo de la DHAP. Además, los residuos de tirosina son cruciales para este mecanismo, ya que actúan como aceptores de hidrógeno estabilizadores. Las proteínas de clase II utilizan un mecanismo diferente que polariza el grupo carbonilo con un catión divalente como el Zn²⁺ . La proteína del operón de galactitol de Escherichia coli , gatY, y la proteína del operón de N-acetilgalactosamina , agaY, que son tagatosa-bisfosfato aldolasas , son homólogas de la fructosa-bisfosfato aldolasa de clase II. Se ha demostrado que dos residuos de histidina en la primera mitad de la secuencia de estos homólogos participan en la unión del zinc. [ 1 ]

Las subunidades proteicas de ambas clases poseen un dominio α/β plegado en un barril TIM que contiene el sitio activo. Varias subunidades se ensamblan para formar la proteína completa . Las dos clases comparten poca identidad de secuencia .

Con pocas excepciones, solo se han encontrado proteínas de clase I en animales , plantas y algas verdes . [ 2 ] Con pocas excepciones, solo se han encontrado proteínas de clase II en hongos . Ambas clases se han encontrado ampliamente en otros eucariotas y en bacterias . [ 3 ] Las dos clases a menudo están presentes juntas en el mismo organismo. Las plantas y las algas tienen aldolasa plastidial , a veces una reliquia de endosimbiosis , además de la aldolasa citosólica habitual. Una aldolasa/fosfatasa bifuncional de fructosa-bisfosfato, con mecanismo de clase I, se ha encontrado ampliamente en arqueas y en algunas bacterias. [ 4 ] El sitio activo de esta aldolasa arqueal también está en un barril TIM.

En la gluconeogénesis y la glucólisis

La gluconeogénesis y la glucólisis comparten una serie de seis reacciones reversibles. En la gluconeogénesis, el gliceraldehído-3-fosfato se reduce a fructosa-1,6-bisfosfato mediante la acción de la aldolasa. En la glucólisis, la fructosa-1,6-bisfosfato se transforma en gliceraldehído-3-fosfato y dihidroxiacetona fosfato mediante la acción de la aldolasa. La aldolasa utilizada en la gluconeogénesis y la glucólisis es una proteína citoplasmática.

En los vertebrados se encuentran tres formas de proteína de clase I. La aldolasa A se expresa preferentemente en músculo y cerebro; la aldolasa B en hígado, riñón y enterocitos ; y la aldolasa C en cerebro. Las aldolasas A y C participan principalmente en la glucólisis , mientras que la aldolasa B participa tanto en la glucólisis como en la gluconeogénesis. [ 5 ] Algunos defectos en la aldolasa B causan intolerancia hereditaria a la fructosa . El metabolismo de la fructosa libre en el hígado aprovecha la capacidad de la aldolasa B para utilizar fructosa 1-fosfato como sustrato . [ 6 ] Se presume que la fructosa-bisfosfato aldolasa/fosfatasa de las arqueas participa en la gluconeogénesis porque su producto es fructosa 6-fosfato. [ 7 ]

En el ciclo de Calvino

El ciclo de Calvin es una vía de fijación de carbono ; forma parte de la fotosíntesis, que convierte el dióxido de carbono y otros compuestos en glucosa. Comparte con la gluconeogénesis una serie de cuatro reacciones reversibles. En ambas vías, el 3-fosfoglicerato (3-PGA o 3-PG) se reduce a fructosa 1,6-bisfosfato, siendo la aldolasa la enzima que cataliza la última reacción. Una quinta reacción, catalizada en ambas vías por la fructosa 1,6-bisfosfatasa , hidroliza la fructosa 1,6-bisfosfato a fructosa 6-fosfato y fosfato inorgánico. La gran disminución de energía libre hace que esta reacción sea irreversible. En el ciclo de Calvin, la aldolasa también cataliza la producción de sedoheptulosa 1,7-bisfosfato a partir de DHAP y eritrosa 4-fosfato . Los principales productos del ciclo de Calvin son el triosa fosfato (TP), que es una mezcla de DHAP y G3P, y la fructosa 6-fosfato. Ambos también son necesarios para regenerar RuBP . La aldolasa utilizada por las plantas y las algas en el ciclo de Calvin suele ser una proteína dirigida a los plastidios, codificada por un gen nuclear.

Reacciones

La aldolasa cataliza

fructosa 1,6-bifosfato DHAP + G3P

y también

sedoheptulosa 1,7-bisfosfato DHAP + eritrosa 4-fosfato
fructosa 1-fosfato DHAP + gliceraldehído

La aldolasa se utiliza en la vía reversible de la gluconeogénesis/glucólisis.

2( PEP + NADH + H + + ATP + H2O )fructosa 1,6-bisfosfato + 2(NAD + + ADP + Pi )

La aldolasa también se utiliza en la parte del ciclo de Calvin que comparte con la gluconeogénesis, con la hidrólisis irreversible del fosfato al final catalizada por la fructosa 1,6-bisfosfatasa.

2( 3-PG + NADPH + H + + ATP + H 2 O) fructosa 1,6-bisfosfato + 2(NADP + + ADP + Pi )
fructosa 1,6-bisfosfato + H 2 O → fructosa 6-fosfato + Pi

En la gluconeogénesis, el 3-PG es producido por la enolasa y la fosfoglicerato mutasa que actúan en serie.

PEP + H₂O 2 -PG ⇌ 3 -PG

En el ciclo de Calvin, el 3-PG es producido por la RuBisCO.

RuBP + CO 2 + H 2 O → 2(3-PG)

La G3P es producida por la fosfoglicerato quinasa que actúa en serie con la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (GAPDH) en la gluconeogénesis, y en serie con la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa (NADP+) (fosforilante) en el ciclo de Calvin.

3-PG + ATP 1,3-bisfosfoglicerato + ADP
1,3-bisfosfoglicerato + NAD(P)H + H + G3P + Pi + NAD(P) +

La triosafosfato isomerasa mantiene el DHAP y el G3P en un equilibrio casi perfecto, produciendo la mezcla denominada triosafosfato (TP).

G3P DHAP

Por lo tanto, tanto el DHAP como el G3P están disponibles para la aldolasa.

Propiedades de trabajo secundario

La aldolasa también se ha visto implicada en muchas funciones secundarias o no catalíticas, debido a su afinidad de unión con muchas otras proteínas, incluyendo la actina F , la α-tubulina , la dineína de cadena ligera , WASP , el intercambiador de aniones Banda 3 , la fosfolipasa D ( PLD2 ), el transportador de glucosa GLUT4 , el inositol trifosfato , la V-ATPasa y ARNO (un factor de intercambio de nucleótidos de guanina de ARF6 ). Se cree que estas asociaciones están predominantemente involucradas en la estructura celular; sin embargo, se ha explorado su participación en la endocitosis, la invasión de parásitos, la reorganización del citoesqueleto, la motilidad celular, el tráfico y reciclaje de proteínas de membrana, la transducción de señales y la compartimentalización tisular. [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]

Referencias

  1. Zgiby SM, Thomson GJ, Qamar S, Berry A (2000). "Explorando la unión y discriminación del sustrato en las aldolasas de fructosa 1,6-bisfosfato y tagatosa 1,6-bisfosfato" . Eur. J. Biochem . 267 (6): 1858–68 . doi : 10.1046/j.1432-1327.2000.01191.x . PMID 10712619 . 
  2. Patron NJ, Rogers MB, Keeling PJ (2004). "El reemplazo genético de la fructosa-1,6-bisfosfato aldolasa apoya la hipótesis de un único ancestro fotosintético de los cromalveolados" . Eukaryotic Cell . 3 (5): 1169– 75. doi : 10.1128/EC.3.5.1169-1175.2004 . PMC 522617. PMID 15470245 .  
  3. Trung Hieu Pham, Shreesha Rao, Ta-Chih Cheng, Pei-Chi Wang, Shih-Chu Chen, La proteína multifuncional fructosa 1,6-bisfosfato aldolasa como posible candidata a vacuna contra Photobacterium damselae subsp. piscicida en la lubina asiática (Lates calcarifer), Developmental & Comparative Immunology, Volumen 124, 2021, 104187, ISSN 0145-305X, https://doi.org/10.1016/j.dci.2021.104187 .
  4. Siebers B, Brinkmann H, Dörr C, Tjaden B, Lilie H, van der Oost J, Verhees CH (2001). "Las aldolasas de fructosa-1,6-bisfosfato arqueales constituyen una nueva familia de aldolasas de tipo I arqueal" . J. Biol. Chem . 276 (31): 28710–8 . doi : 10.1074/jbc.M103447200 . PMID 11387336 . 
  5. Walther EU, Dichgans M, Maricich SM, Romito RR, Yang F, Dziennis S, Zackson S, Hawkes R, Herrup K (1998). "Las secuencias genómicas de la aldolasa C (Zebrin II) dirigen la expresión de lacZ exclusivamente en células no neuronales de ratones transgénicos" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 (5): 2615–20 . Bibcode : 1998PNAS...95.2615W . doi : 10.1073/pnas.95.5.2615 . PMC 19434. PMID 9482935 .  
  6. Gopher A, Vaisman N, Mandel H, Lapidot A (1990). "Determinación de las vías metabólicas de la fructosa en niños normales e intolerantes a la fructosa: un estudio de RMN de C-13 utilizando fructosa C-13" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 87 (14): 5449–53 . doi : 10.1073/pnas.87.14.5449 . PMC 54342. PMID 2371280 .  
  7. Estelmann S, Hügler M, Eisenreich W, Werner K, Berg IA, Ramos-Vera WH, Say RF, Kockelkorn D, Gad'on N, Fuchs G (2011). " Etiquetado y estudios enzimáticos del metabolismo central del carbono en Metallosphaera sedula " . J. Bacteriol . 193 (5): 1191–200 . doi : 10.1128/JB.01155-10 . PMC 3067578. PMID 21169486 .  
  8. Rangarajan ES, Park H, Fortin E, Sygusch J, Izard T (2010). "Mecanismo de control de la alolasa sobre la función de Sorting Nexin 9 en la endocitosis" . J. Biol. Chem . 285 (16): 11983–90 . doi : 10.1074/jbc.M109.092049 . PMC 2852936. PMID 20129922 .  
  9. Ahn AH, Dziennis S, Hawkes R, Herrup K (1994). "La clonación de la zebrina II revela su identidad con la aldolasa C". Development . 120 (8): 2081– 90. doi : 10.1242/dev.120.8.2081 . PMID 7925012 . 
  10. Merkulova M, Hurtado-Lorenzo A, Hosokawa H, Zhuang Z, Brown D, Ausiello DA, Marshansky V (2011). " La aldolasa interactúa directamente con ARNO y modula la morfología celular y la distribución de vesículas ácidas" . Am J Physiol Cell Physiol . 300 (6): C1442-55. doi : 10.1152/ajpcell.00076.2010 . PMC 3118619. PMID 21307348 .  

Lecturas adicionales

  • Berry A, Marshall KE (febrero de 1993). "Identificación de ligandos que se unen al zinc en la fructosa-1,6-bisfosfato aldolasa de clase II de Escherichia coli" . FEBS Lett . 318 (1): 11– 6. Bibcode : 1993FEBSL.318...11B . doi : 10.1016/0014-5793(93)81317-S . PMID 8436219. S2CID 7682431 .  
  • Freemont PS, Dunbar B, Fothergill-Gilmore LA (febrero de 1988). "La secuencia completa de aminoácidos de la fructosa-bisfosfato aldolasa del músculo esquelético humano" . Biochem . J. 249 ( 3): 779–88 . doi : 10.1042/bj2490779 . PMC 1148774. PMID 3355497 .  
  • Galkin A, Li Z, Li L, Kulakova L, Pal LR, Dunaway-Mariano D, Herzberg O (2009). "Conocimientos estructurales sobre la unión del sustrato y la estereoselectividad de la fructosa-1,6-bisfosfato aldolasa de giardia" . Bioquímica . 48 (14): 3186– 96. doi : 10.1021/bi9001166 . PMC 2666783 . PMID 19236002 .  
  • Marsh JJ, Lebherz HG (marzo de 1992). "Aldolasas de fructosa-bisfosfato: una historia evolutiva". Trends Biochem. Sci . 17 (3): 110– 3. doi : 10.1016/0968-0004(92)90247-7 . PMID 1412694 . 
  • Perham RN (abril de 1990). "Las aldolasas de fructosa-1,6-bisfosfato: misma reacción, diferentes enzimas". Biochem. Soc. Trans . 18 (2): 185–7 . doi : 10.1042/bst0180185 . PMID 2199259 . 
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  • Laboratorio Tolan en la Universidad de Boston