Base animal

AnimalBase es un proyecto que nació en 2004 y es mantenido por la Universidad de Göttingen , Alemania. El objetivo del proyecto AnimalBase es digitalizar la literatura zoológica antigua, proporcionar acceso abierto y libre de derechos de autor a obras zoológicas y ofrecer listas verificadas manualmente de nombres de géneros y especies zoológicas como recurso gratuito para el público. AnimalBase contribuyó a la difusión de la literatura taxonómica clásica, lo cual se considera útil porque el acceso a la literatura antigua (especialmente la de finales del siglo XVIII) puede ser difícil para los investigadores que necesitan las fuentes antiguas para su investigación taxonómica . ^{[ 1 ]}

Los datos de AnimalBase son de dominio público . El uso público de los datos de AnimalBase no está restringido ni condicionado. ^{[ 2 ]} AnimalBase abarca todas las disciplinas zoológicas. En el campo de la bioinformática, AnimalBase es único al proporcionar vínculos entre los nombres de taxones genéricos y específicos y sus descripciones originales digitalizadas, con especial atención a la literatura y los nombres publicados antes de 1800.

El proyecto se inició en 2003 con financiación de la Fundación Alemana de Investigación (DFG). La base de datos y su interfaz web comenzaron a desarrollarse en 2004 y se lanzaron en línea en 2005. La interfaz web se diseñó para ser accesible a generaciones anteriores de ordenadores y navegadores web . Entre 2003 y 2005 se digitalizaron aproximadamente 400 publicaciones zoológicas de los años 1550 a 1770, y se incorporaron 10 000 nombres zoológicos vinculados a la base de datos. Un segundo esfuerzo (2008-2011) incluyó literatura digitalizada adicional, lo que permitió acceder a varias decenas de miles de nombres zoológicos más, extraídos de las fuentes originales y vinculados con sus descripciones originales digitalizadas.

Las primeras publicaciones zoológicas se digitalizan con los más altos estándares de calidad por el Centro de Digitalización Retrospectiva de Gotinga ( Göttinger Digitalisierungszentrum , GDZ) de la Biblioteca Estatal y Universitaria de Gotinga (Staats- und Universitätsbibliothek Göttingen, SUB), una de las bibliotecas más grandes de Alemania, con más de 4,5 millones de volúmenes. Si está disponible, AnimalBase también proporciona enlaces al contenido digitalizado de dominio público de otros proveedores, como la Biblioteca del Patrimonio de la Biodiversidad (BHL) o Gallica .

Los nombres zoológicos de taxones genéricos y específicos establecidos en publicaciones zoológicas tempranas se han ingresado manualmente en la base de datos, incluyendo la ortografía original y corregida de los nombres, las localidades tipo y los números de página donde se establecieron originalmente en las publicaciones. Además, los nombres se han comparado con las entradas del Index Animalium de Charles Davies Sherborn (1902, 1922–1933) y el Nomenclator Zoologicus de Neave (1939/1940, actualizado). El estatus nomenclatural de los nombres se ha verificado según la edición actual del Código Internacional de Nomenclatura Zoológica (ICZN). Las posibles discrepancias entre las bases de datos antiguas y los hallazgos de la investigación de nombres de AnimalBase (es decir, prioridad nomenclatural u ortografía incorrecta) se han discutido ocasionalmente en los comentarios proporcionados para cada taxón. Todo el proceso se ha realizado siguiendo el estándar establecido de AnimalBase.

Los nombres específicos y genéricos de los taxones se introducen manualmente haciendo referencia a la descripción original. La introducción básica de un nombre de taxón sigue el estándar de AnimalBase, que se compone de las siguientes directrices:

• Se comprueba la ortografía original correcta del nombre genérico y específico de acuerdo con las reglas de nomenclatura (Código ICZN, edición vigente).
• Los nombres específicos se registran estrictamente junto con el género al que se atribuyeron en la descripción original. En los casos en que el autor que estableció el nombre específico escribió incorrectamente el nombre genérico, el equipo de AnimalBase combina el nombre específico con la ortografía correcta de dicho género.
• Además, se incluyen las grafías originales del nombre del taxón que sean incorrectas (es decir, que difieran de la grafía correcta), conservando el uso original de diacríticos , ligaduras, letras mayúsculas para nombres específicos, guiones, espacios entre palabras y grafías posteriores incorrectas del nombre genérico en una combinación género-especie utilizada por el autor.
• Se proporciona el nombre del autor, escrito según el nombre que aparece en la página del título de la fuente original (ejemplos: Linnæus 1758, Linné 1766).
• Se proporciona el año o la fecha de publicación, según lo determinen las reglas de nomenclatura (fecha real de publicación).
• Se proporciona el tratamiento de género (nombres específicos, modificables o inmutables, según las reglas gramaticales del latín posclásico ). A menudo resulta difícil determinar si un nombre latino es un adjetivo o no, por lo que las entradas resultantes en AnimalBase con estos datos pueden no ser 100% fiables.
• Se proporciona un enlace a la publicación digitalizada que contiene la descripción original.
• Se proporciona la página de la descripción original del nombre del taxón (que es la página donde el nombre se mencionó y se publicó por primera vez). Si el animal descrito aparece en las láminas sin que se mencione su nombre, esto no se indica necesariamente.
• La localidad tipo se proporciona tal como aparece en la descripción original si es fácilmente reconocible o puede inferirse implícitamente de la obra. Este procedimiento puede ser impreciso (ya que la localidad tipo es la localidad de donde provienen los tipos que dan nombre a la especie, la cual no es investigada por el equipo de AnimalBase), pero sin duda proporciona información útil.
• Se indica el grupo animal superior en el que se clasifica el taxón (filo, clase, orden o clado).
• Las entradas se cotejan con Index Animalium y (en el caso de los géneros) con Nomenclator Zoologicus. Las entradas incorrectas (usos posteriores de nombres previamente establecidos, que Sherborn a menudo catalogaba erróneamente como nuevos o nomina nuda ) y las grafías incorrectas de los nombres en estas bases de datos no se copian en AnimalBase, si se detectan como tales.
• Las grafías posteriores incorrectas generalmente no se consideran nuevos taxones, pero pueden figurar como no disponibles y discutirse si el nombre se mencionó como un nombre nuevo en el Index Animalium o es importante por algún otro motivo.
• Todos los grupos de animales reciben un trato coherente siguiendo las normas de la ICZN (los nombres de los peces siguen las mismas normas que los nombres de los insectos).

El estándar AnimalBase permite un fácil acceso a los datos primarios de la descripción original. El equipo de AnimalBase no coteja la ortografía ni la autoría de cada nombre original con las que figuran en las diversas bases de datos zoológicas especializadas por disciplina o región. El objetivo principal de AnimalBase es proporcionar enlaces a las descripciones originales digitalizadas, pero también puede consultarse para verificar la ortografía y la autoría correctas de los nombres zoológicos. En este sentido, AnimalBase podría ser una actualización útil del Index Animalium de Sherborn.

AnimalBase también ofrece la opción de combinar los nombres originales con sus asignaciones actuales (combinaciones actuales de género y especie). Por ejemplo, se dispone de información biológica detallada e imágenes de 2500 especies de moluscos no marinos europeos , incluyendo más de 6000 fotografías. AnimalBase es un proyecto colaborativo y de código abierto; todos los colaboradores registrados pueden corregir o introducir datos. Esto incluye la carga de imágenes ( libres de derechos de autor ) de especies animales, datos biológicos (incluidas medidas y caracteres diagnósticos), datos de distribución , el estado de conservación actual , etc. Se permite expresamente el uso de las imágenes y los datos proporcionados por AnimalBase en otros sitios web (copiados o enlazados).

• AnimalBase http://www.animalbase.org
• Índice Animalium https://www.sil.si.edu/digitalcollections/indexanimalium/
• Nomenclator Zoologicus https://web.archive.org/web/20121126194823/http://uio.mbl.edu/NomenclatorZoologicus/
• Centro de Digitalización de la SUB Göttingen