Variante beta del SARS-CoV-2

La variante Beta ^{[ 1 ] [ 2 ]} (B.1.351) ^{[ a ]} ​​fue ^{[ 5 ] [ 6 ]} una variante del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . Una de las varias variantes del SARS-CoV-2 que inicialmente se creyó que eran de particular importancia , se detectó por primera vez en el área metropolitana de Nelson Mandela Bay ^{[ 7 ]} de la provincia de Cabo Oriental de Sudáfrica a finales de octubre de 2020, ^{[ 8 ]} lo cual fue informado por el departamento de salud del país el 18 de diciembre de 2020. ^{[ 9 ]} El análisis filogeográfico sugiere que esta variante surgió en el área de Nelson Mandela Bay en julio o agosto de 2020. ^{[ 10 ]}

La Organización Mundial de la Salud denominó a la variante variante Beta, no para reemplazar el nombre científico sino como un nombre para que el público se refiera comúnmente a ella. ^{[ 11 ] [ 12 ]} La OMS la considera una variante preocupante que ya no está en circulación. ^{[ 5 ]}

Esta variante también se conoce como la variante sudafricana .

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  Mutaciones de aminoácidos de la variante beta del SARS-CoV-2 representadas en un mapa genómico del SARS-CoV-2 con especial atención a la proteína Spike. ^{[ 13 ]}

Hay tres mutaciones de particular interés en la región de la espícula del genoma del linaje B.1.351: ^{[ 14 ]}

• K417N
• E484K
• N501Y

y otras cinco mutaciones de espiga que hasta ahora han generado menos preocupación: ^{[ 14 ]}

• L18F
• D80A
• D215G
• R246I
• A701V

Fuera de la región de la espícula, también presenta: K1655N, deleción SGF 3675-3677, P71L y T205I. ^{[ 15 ]}

Los científicos observaron que la variante puede unirse más fácilmente a las células humanas debido a tres mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD) en la glicoproteína de la espícula del virus: N501Y ^{[ 9 ] [ 16 ]} (un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) ^{[ 17 ]} en la posición 501 del aminoácido ), K417N y E484K. ^{[ 18 ] [ 19 ]} Dos de estas mutaciones, E484K y N501Y, se encuentran dentro del motivo de unión al receptor (RBM) del dominio de unión al receptor (RBD). ^{[ 20 ] [ 21 ]}

La mutación N501Y también se ha detectado en el Reino Unido. ^{[ 9 ] [ 22 ]} Dos mutaciones encontradas en la variante Beta, E484K y K417N, no se encuentran en la variante Alfa . Además, Beta no tiene la mutación 69-70del encontrada en la otra variante. ^{[ 16 ] [ 23 ]}

El 4 de enero de 2021, el periódico británico The Telegraph informó que el inmunólogo de Oxford, Sir John Bell, creía que había "un gran interrogante" sobre la posible resistencia de la nueva variante sudafricana a las vacunas contra la COVID-19 , lo que generó temores de que las vacunas no funcionaran con la misma eficacia en esa cepa variante. ^{[ 24 ]} Ese mismo día, Shabir Madhi , profesor de vacunología en la Universidad de Witwatersrand , comentó a CBS News que "no es seguro" que la nueva variante Beta (variante 501.V2) pudiera evadir las vacunas, pero que debía considerarse que "podrían no tener la eficacia completa". ^{[ 25 ]} Las mutaciones adicionales en la proteína de la espícula en Beta fueron planteadas como un factor preocupante por Simon Clarke, profesor asociado de microbiología celular en la Universidad de Reading , ya que "podrían hacer que el virus sea menos susceptible a la respuesta inmune desencadenada por las vacunas". ^{[ 26 ]} Lawrence Young, virólogo de la Universidad de Warwick , también señaló que las múltiples mutaciones de la proteína espiga de la variante "podrían conducir a cierto escape de la protección inmunitaria". ^{[ 26 ]}

Se informó que el cambio de aminoácido E484K, una mutación del dominio de unión al receptor (RBD), estaba "asociado con el escape de anticuerpos neutralizantes" que podría afectar negativamente la eficacia de las vacunas contra la COVID dependientes de la proteína espiga. ^{[ 27 ] [ 28 ]} La mutación de la proteína espiga E484K se relacionó con un caso de reinfección con la variante Beta del SARS-CoV-2 en Brasil, que los investigadores creen que es el primer caso de reinfección que involucra esta mutación. ^{[ 29 ]} La posibilidad de una alteración en la antigenicidad se denominó "mutación de escape" de un anticuerpo monoclonal con la capacidad de neutralizar las variantes de la proteína espiga del SARS-CoV-2. ^{[ 30 ] [ 31 ]} Esto sugiere que las vacunas existentes pueden y deben actualizarse para contrarrestar las nuevas cepas sin recurrir a ensayos por fases.

Pfizer–BioNTech

El 17 de febrero de 2021, Pfizer anunció que la actividad de neutralización se había reducido en dos tercios para la variante Beta, aunque se abstuvo de hacer afirmaciones sobre la eficacia de la vacuna para prevenir la enfermedad como resultado de esta variante. ^{[ 34 ]}

El 16 de marzo de 2021, la Autoridad Reguladora de Productos Sanitarios de Sudáfrica (SAHPRA) aprobó la vacuna Pfizer-BioNTech (BNT162b2) para la Autorización de Uso de Emergencia de la sección 21. ^{[ 35 ]}

El 1 de abril de 2021, una actualización de un ensayo de vacuna sudafricano indicó que la vacuna había sido 100% efectiva hasta el momento (es decir, los participantes vacunados no presentaron casos), y que seis de las nueve infecciones en el grupo de control con placebo correspondían a la variante Beta (linaje B.1.351). ^{[ 36 ]} Sin embargo, nueve días después, un estudio israelí encontró que la variante estaba presente incluso en personas que habían recibido ambas dosis de la vacuna, con una prevalencia desproporcionada, ocho veces mayor, entre los individuos vacunados en comparación con las cepas salvajes. ^{[ 37 ]}

El 5 de mayo de 2021, una carta que resumía los resultados del Grupo Nacional de Estudio de Qatar para la Vacunación contra la COVID-19 mostró una efectividad del 75% contra la infección, con cero casos de enfermedad grave. ^{[ 38 ]}

Investigadores y funcionarios informaron que la prevalencia de la variante era mayor entre los jóvenes sin afecciones de salud subyacentes, y que causa enfermedades graves con mayor frecuencia en estos casos que otras variantes. ^{[ 63 ] [ 64 ]} El departamento de salud de Sudáfrica también indicó que la variante podría estar impulsando la segunda ola de la pandemia de COVID-19 en el país, ya que se propaga más rápido que otras variantes anteriores del virus. ^{[ 9 ] [ 63 ]}

Un equipo de genómica liderado por la Plataforma de Investigación, Innovación y Secuenciación de KwaZulu-Natal ( KRISP ) en la Universidad de KwaZulu-Natal descubrió la nueva variante. ^{[ 65 ]} Fue descubierta mediante secuenciación del genoma completo . Varias secuencias genómicas de este linaje fueron enviadas a la base de datos de secuencias GISAID . ^{[ 66 ]}

El 23 de diciembre de 2020, el ministro de salud del Reino Unido, Matt Hancock, anunció que dos personas que habían viajado de Sudáfrica al Reino Unido estaban infectadas con la variante Beta (variante 501.V2). ^{[ 23 ] [ 67 ]} El 28 de diciembre, la variante se había detectado en dos personas en Suiza ^{[ 68 ]} y en una en Finlandia . ^{[ 69 ]} El 29 de diciembre, la cepa se había detectado en un visitante de Sudáfrica a Japón , ^{[ 70 ]} y en un viajero del extranjero a Queensland , Australia . ^{[ 71 ]} El 30 de diciembre, la variante se detectó en Zambia . ^{[ 72 ]} El 31 de diciembre, también se detectó en Francia , en un pasajero que regresaba de Sudáfrica. ^{[ 73 ]} El 2 de enero de 2021, el primer caso de esta variante se detectó en Corea del Sur . ^{[ 74 ]} Austria informó su primer caso de esta variante, junto con cuatro casos de la variante Alfa el 4 de enero. ^{[ 75 ]} La República de Botsuana también detectó su primer caso el 4 de enero. ^{[ 76 ]} La República Popular China informó del primer caso de esta variante en la provincia sureña de Guangdong el 6 de enero. ^{[ 77 ]}

El 8 de enero de 2021, la República de Irlanda informó la detección de 3 casos, todos vinculados a viajes desde Sudáfrica. ^{[ 78 ]} El mismo día se informó de un caso de reinfección con la nueva variante por una mujer que había tenido COVID-19 en Brasil , la primera reinfección de este tipo informada en el mundo. ^{[ 29 ]} Canadá informó del primer caso de esta variante en Alberta el 9 de enero, ^{[ 79 ]} e Israel informó de cuatro casos, todos los cuales fueron importados en personas que viajaban desde Sudáfrica. ^{[ 80 ]} Nueva Zelanda informó del primer caso de esta variante el 10 de enero. ^{[ 81 ] [ 82 ]} El 12 de enero, Alemania informó de la detección de la mutación en seis personas de tres hogares diferentes. ^{[ 83 ]} El mismo día, se informó que el Reino Unido tenía un total de 29 casos, dos de los cuales ya se habían informado. ^{[ 84 ]} Al día siguiente, Bélgica informó del primer caso en una persona de Flandes Occidental sin antecedentes de viaje, ^{[ 85 ]} Israel informó de cuatro casos más, ^{[ 86 ]} y Taiwán informó del primer caso en un hombre suazi de unos 30 años que había dado positivo por COVID-19 el 1 de enero. ^{[ 87 ]}

El 14 de enero, Alemania detectó un caso más ^{[ 88 ]} y al día siguiente, Canadá informó de un segundo caso de la mutación que se detectó en la provincia canadiense de Columbia Británica . ^{[ 89 ]} Se informó de otro caso en Alemania el mismo día. ^{[ 90 ]} Dinamarca y Reunión informaron de sus primeros casos el 16 de enero, mientras que Israel descubrió otros cuatro casos. ^{[ 91 ] [ 92 ] [ 93 ]} El 17 de enero, Israel informó de otros cuatro casos, lo que elevó el número total de casos de esta variante a 20. ^{[ 94 ]} Se informaron dos casos más en los Países Bajos el 18 de enero, lo que elevó el total del país a tres. ^{[ 95 ]} Ghana informó de su primer caso de la variante el 19 de enero. ^{[ 96 ]} El 23 de enero, Panamá detectó su primer caso de la cepa en una persona de Zimbabue, que había viajado desde Sudáfrica. ^{[ 97 ]} También el 23 de enero, Bélgica informó al menos 15 casos de la variante en Ostende, ^{[ 98 ]} mientras que se confirmaron 6 casos en las Comoras. ^{[ 99 ]} El 26 de enero, la República de Irlanda informó la detección de 6 casos más. ^{[ 100 ]} Estados Unidos informó sus primeros casos de la variante el 28 de enero de 2021, en el estado de Carolina del Sur . ^{[ 101 ]} El 27 de enero, Israel informó 3 casos más que fueron los primeros casos de la variante a partir de muestras que se recolectaron en la comunidad al azar, sin conocer la fuente de infección. ^{[ 102 ]} Los datos preliminares informados por el CDC de África el 29 de enero indicaron que la variante había llegado a Ghana . ^{[ 103 ]} El 31 de enero, Israel informó su primer caso de reinfección con la nueva variante por un hombre que regresó de Turquía . ^{[ 104 ]}

El 1 de febrero de 2021, el Secretario de Estado de Salud y Asistencia Social del Reino Unido informó de la detección aleatoria de 11 casos de la variante sin conexión con viajes internacionales. ^{[ 105 ]} Ese mismo día, la provincia canadiense de Ontario informó del primer caso de la variante en la región de Peel , con una ausencia similar de antecedentes de viaje y sin contacto con nadie que hubiera estado recientemente en el extranjero. ^{[ 106 ]} El 8 de febrero, la República de Irlanda informó de la detección de 2 casos más. ^{[ 107 ]}

El 8 de febrero de 2021, Austria detectó el mayor brote de la variante Beta en Europa hasta la fecha. Se identificaron un total de 293 casos confirmados y 200 casos sospechosos mediante secuenciación, la mayoría de los cuales probablemente se confirmarán. Todos los casos se encontraron en la región del Tirol, donde casi el 9% de las pruebas PCR positivas se identificaron como la variante Beta mediante secuenciación. ^{[ 108 ]} Se estimó que había alrededor de 140 casos activos. Después de una semana de debate público y presión política sobre una posible cuarentena del Tirol, el gobierno de Austria se abstuvo de aislar las áreas de preocupación y, en su lugar, hizo un llamamiento formal para reducir los desplazamientos dentro y fuera de la región y realizarse pruebas después de visitar el Tirol. ^{[ 109 ]} Las autoridades tirolesas declararon su intención de flexibilizar las normas de confinamiento en el Tirol, en consonancia con el resto de Austria. ^{[ 110 ]}

El 22 de febrero, el Ministerio de Salud israelí declaró que la variante había sido secuenciada genéticamente en poco menos del 1% de 3000 muestras comunitarias. ^{[ 111 ]} Posteriormente, Israel informó un total de 444 casos de la variante, lo que la convirtió en la tasa de infección más alta del mundo fuera de Sudáfrica. ^{[ 112 ]} El 25 de febrero, la República de Irlanda informó la detección de 4 casos más. ^{[ 113 ]} A finales de febrero, Turquía tenía 49 casos de la variante Beta. ^{[ 114 ]}

El 3 de marzo de 2021, Filipinas confirmó sus primeros 6 nuevos casos de la variante sudafricana, con 3 pacientes de Pasay sin antecedentes de viaje y 3 con antecedentes de viaje a Qatar y Emiratos Árabes Unidos . ^{[ 115 ]} El 5 de marzo de 2021, Rumania informó sus primeros dos casos de la variante sudafricana, provenientes de dos pacientes en Bucarest y Pitești . ^{[ 116 ]}

El 23 de marzo de 2021, Lituania confirmó sus dos primeros casos nuevos de la cepa sudafricana, uno en el condado de Kaunas y otro en Vilna . Hay otros diez casos sospechosos. Las personas infectadas declararon no haber viajado a ningún sitio. ^{[ 117 ]} El 26 de marzo se confirmaron tres casos más, lo que significa que el virus se está propagando con éxito dentro del país.

El 1 de abril de 2021, Malasia detectó sus primeros casos de la variante sudafricana. El Ministerio de Salud informó de dos casos que se cree que se originaron en el grupo de Jalan Lima, que involucraban a un empleado del Aeropuerto Internacional de Kuala Lumpur (KLIA), con otros casos reportados detectados de forma dispersa en Selangor . ^{[ 118 ]} Hasta el 1 de abril, se reportaron un total de nueve casos que involucraban la variante. ^{[ 119 ]} Para el 2 de mayo, se habían detectado un total de 48 casos en al menos 5 grupos y a través del rastreo de contactos, de los cuales 20 se encontraron en dos grupos en Perak y Kelantan . ^{[ 120 ]}

El 12 de abril de 2021, Turquía tenía 285 casos en 11 provincias. ^{[ 121 ]}

En marzo de 2022, la Organización Mundial de la Salud incluyó las variantes Alfa , Beta y Gamma como previamente circulantes, citando la falta de casos detectados en las semanas y meses anteriores. ^{[ 122 ]}

• Pandemia de COVID-19 en Sudáfrica
• Vacunación contra la COVID-19 en Sudáfrica
• Variantes del SARS-CoV-2 : Alfa , Gamma , Delta , Epsilon , Zeta , Eta , Theta , Iota , Kappa , Lambda , Mu , Omicron

• Linajes PANGO: Informe de nuevas variantes  -  Informe sobre la distribución global del linaje B.1.351
• Informe de COG-UK sobre las mutaciones de la proteína Spike del SARS-CoV-2 de interés en el Reino Unido.