BLUPF90

La familia de programas BLUPF90 es un paquete de software estadístico utilizado en genética cuantitativa para el mejoramiento animal y vegetal . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Puede ajustar modelos mixtos utilizando máxima verosimilitud restringida , así como muestreo de Gibbs para estimar componentes de varianza y predecir valores genéticos mediante la mejor predicción lineal insesgada (BLUP).

Codificado en Fortran , puede realizar selección genómica en cientos de miles de individuos genotipados . ^{[ 3 ]}

Las versiones compiladas de BLUPF90 están disponibles gratuitamente para investigación y pueden utilizarse en Linux, Microsoft Windows y Mac OS X. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} También existe un complemento para R (lenguaje de programación) . ^{[ 6 ]}

Referencias

↑ Misztal, Ignacy (1999). "Modelos complejos, más datos: ¿programación más sencilla?". Boletín Interbull . 20 : 33–42 .
↑ Misztal, I; Tsuruta, S; Strabel, T; Auvray, B; Druet, T; Lee, DH (2002). BLUPF90 y programas relacionados (BGF90) . VII Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Montpellier, Francia.
↑ Aguilar, I; Misztal, I; Tsuruta, S; Legarra, A; Wang, H (2014). PREGSF90 – POSTGSF90: Herramientas computacionales para la implementación de la selección genómica en un solo paso y la asociación de todo el genoma con individuos no genotipados en programas BLUPF90 (PDF) . 10.º Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Sociedad Americana de Ciencia Animal, Champaign, IL.
↑ http://nce.ads.uga.edu/software/
↑ http://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start
↑ https://famuvie.github.io/breedR/

Enlaces externos

Página principal de BLUPF90

[1] Misztal, Ignacy (1999). "Modelos complejos, más datos: ¿programación más sencilla?". Boletín Interbull . 20 : 33–42 .

[2] Misztal, I; Tsuruta, S; Strabel, T; Auvray, B; Druet, T; Lee, DH (2002). BLUPF90 y programas relacionados (BGF90) . VII Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Montpellier, Francia.

[3] Aguilar, I; Misztal, I; Tsuruta, S; Legarra, A; Wang, H (2014). PREGSF90 – POSTGSF90: Herramientas computacionales para la implementación de la selección genómica en un solo paso y la asociación de todo el genoma con individuos no genotipados en programas BLUPF90 (PDF) . 10.º Congreso Mundial de Genética Aplicada a la Producción Ganadera. Sociedad Americana de Ciencia Animal, Champaign, IL.

[4] ttp://nce.ads.uga.edu/software/

[5] ttp://nce.ads.uga.edu/wiki/doku.php?id=start

[6] ttps://famuvie.github.io/breedR/

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