Articulo de referencia

Bionomía

Bionomia (anteriormente Bloodhound Tracker [ 1 ] ) es una base de datos y una herramienta de entrada de datos que permite asignar las cadenas de nombres de los recolectores y de...

Bionomia (anteriormente Bloodhound Tracker [ 1 ] ) es una base de datos y una herramienta de entrada de datos que permite asignar las cadenas de nombres de los recolectores y de los taxónomos que determinan los datos de los especímenes a la persona única que recolectó o identificó el espécimen. Si la persona está viva, esto se hace a través de su ORCID iD, y si ha fallecido, a través de su identificador de Wikidata . De esta manera, se resuelve la ambigüedad cuando dos o más recolectores tienen nombres similares, o cuando un recolector ha trabajado con dos nombres, o con un solo nombre escrito de dos o más maneras. Los datos de los especímenes asociados con Bionomia y utilizados por ella son los datos agregados de GBIF . [ 2 ]

Este mecanismo de contribución a los datos de especímenes surgió de un proyecto [ 3 ] iniciado por el Muséum national d'histoire naturelle , París (MNHN) en marzo de 2019, [ 4 ] y está motivado (en parte) por "la importancia mundial de las colecciones de historia natural, (que) están en riesgo porque están críticamente subfinanciadas o subvaloradas. Un factor que contribuye a esta aparente negligencia es la falta de un sistema de recompensa profesional que cuantifique e ilustre la amplitud y profundidad de la experiencia requerida para recolectar e identificar especímenes, mantenerlos, digitalizar sus etiquetas, movilizar los datos y mejorar estos datos a medida que las partes interesadas identifican errores y omisiones". [ 5 ] También está motivado por el hecho de que el importante trabajo de los taxónomos en la identificación de especímenes en colecciones de todo el mundo no es reconocido, y este fracaso, perjudica tanto a las instituciones como a los taxónomos. [ 6 ] En agosto de 2018, Bionomia se lanzó (bajo el nombre de Bloodhound Tracker) como una propuesta para el Ebbe Nielsen Challenge . [ 7 ]

Otros artículos que establecen el contexto, la justificación y el propósito de Bionomia son: [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]

La tarea principal en Bionomia es resolver las cadenas de nombres de los diversos recolectores y taxónomos que han determinado la especie de un espécimen, asignándoles nombres únicos. Una vez hecho esto, los registros de especímenes de plantas y animales contenidos en las descargas de GBIF (referenciados permanentemente mediante DOI), junto con los artículos derivados de ellos, [ 12 ] se vinculan a los perfiles de personas en Bionomia. De este modo, el trabajo taxonómico fundamental para la investigación botánica puede rastrearse hasta la institución que lo custodia y hasta el taxónomo, vinculando así la institución, el taxónomo y la ciencia generada.

De este modo, Bionomia, al cuantificar las contribuciones de los taxónomos, permite contabilizar su trabajo no solo en términos de recuento de especímenes, sino también en términos de recuento de artículos científicos.

Contribuyendo

Para atribuir datos de recolección/identificación en Bionomia y ver los datos de perfil de los recolectores/identificadores, una persona debe iniciar sesión en el sitio de Bionomia a través de un ID ORCID (preferiblemente público).

Los perfiles de los recolectores son privados por defecto, lo que significa que el perfil de cualquier persona viva que haya contribuido a los datos de especímenes recopilados por GBIF no se puede ver hasta que el recolector/identificador en cuestión lo haga público. Un perfil privado implica que los datos de un recolector no son visibles ni verificables por otros. (Sin embargo, se pueden atribuir especímenes a esa persona).

Al pulsar «Ayuda con el atributo» para un perfil, aparecen los registros de especímenes de GBIF con cadenas de caracteres que forman parte del nombre de la persona. A veces, a partir de la cadena de caracteres del recolector/identificador, la fecha, la institución y el país donde se recolectó, queda claro que el espécimen debe atribuirse a la persona. Sin embargo, a menudo es necesario examinar todos los datos transcritos del espécimen, y también puede haber una fotografía de alta resolución del espécimen junto con todas sus anotaciones a lo largo de los años, lo que permite aceptar o rechazar que el espécimen haya sido recolectado por la persona. Al examinar el espécimen, se accede a la base de datos de GBIF, y si se detecta un error, es posible notificar el problema por correo electrónico al conservador de la institución que proporcionó los datos.

Ejemplos

Personas vivas

Por ejemplo, el perfil de Kevin Thiele [ 13 ] en Bionomia muestra que ha determinado (identificado) unos 11.291 especímenes botánicos de al menos 12 países, ha recolectado unos 4.797 especímenes de al menos 4 países, y que 21 de estos especímenes (identificados o recolectados) se han utilizado en 10 artículos publicados, y que al 5 de junio de 2020, queda un 6% más de especímenes que pueden o no haber sido recolectados o identificados por él. Al presionar la pestaña "Especialidades" [ 14 ] se muestra que ha recolectado 542 especímenes de Myrtaceae y 459 especímenes de Poaceae , mientras que ha identificado 3.829 especímenes de Dilleniaceae y 2.916 especímenes de Rhamnaceae . La pestaña "Depositado en" [ 15 ] revela que los especímenes que ha recolectado están distribuidos en 22 instituciones.

El perfil de Shelley James [ 16 ] muestra que ha determinado 2836 especímenes botánicos de al menos 20 países, ha recolectado 3522 de 5 países y que 4457 de los especímenes que ha identificado o recolectado se han utilizado en 33 artículos científicos, mientras que Stylianos Chatzimanolis (un sistemático de escarabajos) ha recolectado 31.493 especímenes identificados de al menos 38 países, 33.667 especímenes recolectados de al menos 15 países, de los cuales 6 se han utilizado en 3 artículos científicos. [ 17 ]

Coleccionistas anteriores

Mary Ann McHard , una australiana occidentalUna pionera, que recolectó para Ferdinand von Mueller (y cuyo perfil también es público) [ 18 ] , se considera que recolectó al menos 2072 especímenes existentes, y estos aún contribuyen al conocimiento científico, con 12 de sus especímenes contribuyendo a un artículo científico. [ 19 ]

Hermann Beckler , [ 20 ] quien recolectó en Australia entre 1856 y 1862, tiene 3179 especímenes existentes recolectados por él, algunos supuestamente recolectados en los EE. UU. (fuente GBIF ), (lo que ilustra el poder de este proyecto/sitio web, ya que los errores de transcripción e interpretación cometidos al crear la base de datos de especímenes pueden detectarse y corregirse). Ocho de sus especímenes se han utilizado en cuatro publicaciones científicas. [ 21 ] [ 22 ] [ 23 ] [ 24 ] [ 25 ]

Referencias

  1. Shorthouse, David P. (15 de junio de 2020). "Un cambio de marca" . Bionomia.net . Consultado el 19 de junio de 2020 .
  2. "Red GBIF" . www.gbif.org . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  3. ^ "DataPOC MHNH: UN OUTIL POUR EXPLORER LES RICHESSES DES DONNÉES PRODUITES PAR LA RECHERCHE EN SCIENCES NATURELLES" . datapoc.mnhn.fr . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  4. Besombes, C.; Chagnoux, S.; Illien, G. (18 de junio de 2019). "Personas de las colecciones: ¿facilitadores de la interoperabilidad?" . Biodiversity Information Science and Standards . 3 e35268. doi : 10.3897/biss.3.35268 . ISSN 2535-0897 . 
  5. Shorthouse, DP "Bionomia: Fundamentos" . bionomia.net . Consultado el 4 de junio de 2020 .
  6. McDade, LA; Maddison, DR; Guralnick, R.; Piwowar, HA; Jameson, ML; Helgen, KM; Herendeen, PS; Hill, A.; Vis, ML (2011). "La biología necesita un sistema de evaluación moderno para la productividad profesional" . BioScience . 61 (8): 619– 625. doi : 10.1525/bio.2011.61.8.8 . ISSN 1525-3244 . 
  7. Shorthouse, David P. "Historia" . bionomia.net . Consultado el 18 de junio de 2020 .
  8. Vos, R.; Biserkov, J.; Balech, B.; Beard, N.; Blissett, M.; Brenninkmeijer, C.; van Dooren, T.; Eades, D.; Gosline, G.; Groom, Q.; Hamann, T. (16 de junio de 2014). " Datos de biodiversidad enriquecidos como recurso y servicio" . Biodiversity Data Journal . 2 (2) e1125. doi : 10.3897/BDJ.2.e1125 . ISSN 1314-2828 . PMC 4092319. PMID 25057255 .   
  9. Groom, Q.; Besombes, C.; Brown, J.; Chagnoux, S.; Georgiev, T.; Kearney, N.; Marcer, A.; Nicolson, N.; Page, R.; Phillips, S.; Rainer, H. (13 de junio de 2019). "Avances en la gestión de autoridades de nombres de personas para colecciones" . Biodiversity Information Science and Standards . 3 e35074. doi : 10.3897/biss.3.35074 . ISSN 2535-0897 . 
  10. Shorthouse, D.; Page, R. (8 de agosto de 2019). "Cuantificación del alcance institucional a través de la red humana en colecciones de historia natural" . Biodiversity Information Science and Standards . 3 e35243. doi : 10.3897/biss.3.35243 . ISSN 2535-0897 . 
  11. Page, R. (13 de junio de 2019). "Wikidata y el grafo de conocimiento de la biodiversidad" . Biodiversity Information Science and Standards . 3 e34742. doi : 10.3897/biss.3.34742 . ISSN 2535-0897 . 
  12. "GBIF: Recursos (Literatura)" . www.gbif.org . Consultado el 8 de junio de 2020 .
  13. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Kevin Thiele" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  14. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Kevin Thiele: Especialidades" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  15. Shorthouse, DP "Kevin Thiele: Depositado en" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  16. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Shelley James" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  17. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Stylianos Chatzimanolis" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  18. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Mary Ann McHard" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  19. Li, M.; He, J.; Zhao, Z.; Lyu, R.; Yao, M.; Cheng, J.; Xie, L. (9 de marzo de 2020). "Modelado predictivo de la distribución de Clematis sect. Fruticella s. str. bajo el cambio climático revela una expansión del rango durante el Último Máximo Glacial" . PeerJ . 8 e8729. doi : 10.7717/peerj.8729 . ISSN 2167-8359 . PMC 7067196. PMID 32195054 .   
  20. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Hermann Beckler" . bionomia.net . Consultado el 5 de junio de 2020 .
  21. Shorthouse, DP (5 de junio de 2020). "Hermann Beckler: Citaciones" . bionomia.net . Recuperado el 5 de junio de 2020 .
  22. Adhikari, S.; Burke, IC; Eigenbrode, SD (26 de mayo de 2020). Fried, G. (ed.). "Biología y manejo de la manzanilla silvestre (Anthemis cotula L.): una revisión de un invasor global emergente" . Weed Research . 60 (5): 313– 322. Bibcode : 2020WeedR..60..313A . doi : 10.1111/wre.12426 . ISSN 0043-1737 . 
  23. Li, M.; He, J.; Zhao, Z.; Lyu, R.; Yao, M.; Cheng, J.; Xie, L. (9 de marzo de 2020). "Modelado predictivo de la distribución de Clematis sect. Fruticella s. str. bajo el cambio climático revela una expansión del rango durante el Último Máximo Glacial" . PeerJ . 8 e8729. doi : 10.7717/peerj.8729 . ISSN 2167-8359 . PMC 7067196. PMID 32195054 .   
  24. Ringelberg, JJ; Zimmermann, NE; Weeks, A.; Lavin, M.; Hughes, CE (2020). Moles, A. (ed.). "Biomas como arenas evolutivas: Convergencia y conservadurismo en el bioma suculento transcontinental" . Ecología y biogeografía global . 29 (7): 1100– 1113. Bibcode : 2020GloEB..29.1100R . doi : 10.1111/geb.13089 . hdl : 20.500.11850/419357 . ISSN 1466-822X . 
  25. Karger, DN; Kessler, M.; Conrad, O.; Weigelt, P.; Kreft, H.; König, C.; Zimmermann, NE (2019). Grytnes, J.-A. (ed.). "Por qué las líneas de árboles son más bajas en las islas: los efectos climáticos y biogeográficos tienen la respuesta" . Ecología y biogeografía global . 28 (6): 839– 850. Bibcode : 2019GloEB..28..839K . doi : 10.1111/geb.12897 . ISSN 1466-822X . S2CID 91900199 .  
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