Articulo de referencia

Bifitano

El bifitano (o bisfitano ) es un isoprenoide C40 producido por la degradación del glicerol dialquil glicerol tetraéter (GDGT). [ 1 ] Como componente común de la membrana lipídic...

El bifitano (o bisfitano ) es un isoprenoide C40 producido por la degradación del glicerol dialquil glicerol tetraéter (GDGT). [ 1 ] Como componente común de la membrana lipídica, el bifitano se utiliza ampliamente como biomarcador de arqueas . [ 2 ] En particular, dada su asociación con sitios de oxidación anaeróbica activa de metano (AOM), se considera un biomarcador de arqueas metanotróficas . [ 3 ] Se ha encontrado tanto en ambientes marinos como terrestres. [ 2 ] [ 4 ]

Estructura química

Estructuras moleculares de GDGT isoprenoides que contienen 0–4 anillos de ciclopentano (GDGT-0 a GDGT-4). [ 5 ]
Estructuras de bifitano con grado creciente de ciclación desde arriba (acíclico) hasta abajo (con tres anillos cicloalquílicos). [ 3 ]

Los tetraéteres de glicerol dialquil glicerol (GDGT) son lípidos de membrana importantes sintetizados por arqueas y algunas bacterias. [ 5 ] En particular, los GDGT isoprenoides se caracterizan por cadenas de carbono isoprenoides conectadas a las moléculas de glicerol mediante enlaces éter. [ 5 ] El bifitano se produce por la ruptura química de los enlaces éter dentro del GDGT isoprenoide (GDGT-0). [ 1 ] Está compuesto por unidades de isopreno unidas por enlaces éter con seis unidades de isopreno (o dos fitanos ) unidas entre sí por un enlace cabeza con cabeza. [ 6 ]

El bifitano puede encontrarse en formas cíclicas que contienen de uno a tres anillos pentacíclicos cuando se deriva de GDGT isoprenoides con esqueletos de carbono isoprenoides ciclados biosintéticamente. [ 5 ] En la mayoría de las muestras ambientales analizadas, la forma acíclica con bifitano como cadena de carbono isoprenoide suele ser la más abundante. [ 2 ] Por lo tanto, en este artículo, el término bifitano se utiliza para referirse a la forma acíclica, salvo que se indique lo contrario.

Origen biológico

Como ocurre dentro de GDGT, el bifitano se ha detectado en la columna de agua, sedimentos marinos, sedimentos influenciados hidrotermalmente, sedimentos de filtraciones frías dominados por la oxidación anaeróbica de la actividad del metano y piedra caliza. [ 2 ] Aunque se había estudiado principalmente en entornos acuáticos, estudios recientes también han comenzado a investigar ambientes terrestres, como turberas donde la fuente de bifitano se identificó como arqueas metanogénicas de turba. [ 4 ] Los estudios también han informado de la detección de bifitano en petróleo. [ 6 ]

Si bien los primeros estudios consideraron a los GDGT (y por lo tanto al bifitano) como biomarcadores de arqueas extremófilas , desde finales de la década de 1970 se dispone de evidencia tanto indirecta como directa de que los GDGT se originan en arqueas de ambientes marinos mesófilos o ambientes lacustres con pH y salinidad no extremos. [ 3 ] Debido a que el bifitano en particular se ha detectado ampliamente en sitios con actividad AOM activa, se considera un biomarcador de arqueas metanotróficas. [ 3 ]

De forma análoga a los esteroles en las membranas eucariotas, la GDGT desempeña un papel similar en la mejora de la rigidez de las membranas celulares de las arqueas. [ 7 ] En apoyo de esto, se ha informado que los termófilos aumentan el grado de ciclación con el aumento de las temperaturas de crecimiento para mejorar aún más la fluidez de la membrana . [ 8 ]

Técnicas de medición

Fragmentos iónicos del espectro de masas característicos del bifitano (acíclico). Las líneas azules marcan la ubicación de la fragmentación y los números asociados corresponden a los valores m/z de los fragmentos iónicos resultantes.

Por lo general, la medición de bifitano se realiza como un análisis indirecto de GDGT. Al derivar químicamente el bifitano a partir de estos lípidos éter, los enlaces éter se rompen primero utilizando yoduro de hidrógeno (HI), tricloruro de boro (BCl₃ ) o tribromuro de boro (BBr₃ ) , lo que produce haluros de alquilo. Luego, los haluros de alquilo se reducen a hidrocarburos saturados utilizando HI/NaSCH₃ o LiAlH₄ , o se convierten en metiltioésteres con NaSCH₃ . Los hidrocarburos saturados o derivatizados obtenidos pueden separarse y medirse posteriormente utilizando procedimientos estándar de cromatografía de gases-espectrometría de masas (GC-MS). [ 6 ]

Alternativamente, el análisis directo de GDGT puede realizarse mediante cromatografía líquida, pero cuando se requiere una caracterización estructural adicional, los fragmentos de espectrometría de masas característicos del bifitano pueden obtenerse mediante cromatografía líquida de alta resolución acoplada a espectrometría de masas en tándem (HPLC-MS/MS). [ 3 ]

Los iones fragmento del espectro de masas de diagnóstico para el bifitano son m/z 197, 259, 267, 323, 383, 393 y 463. [ 6 ] Debido a que los bifitanos cíclicos producen diferentes iones fragmento del espectro de masas, se pueden diferenciar las formas modificadas de bifitano presentes en una muestra. [ 9 ]

Aplicación como biomarcador

Se considera que el bifitano tiene una estabilidad relativamente alta, dada su detección en alta abundancia tanto en sedimentos recientes como antiguos y en petróleo, lo que sugiere su capacidad para persistir en la maduración térmica. [ 7 ] Aún no está claro si el bifitano se degrada a isoprenoides más cortos con el tiempo. [ 10 ]

El bifitano es un biomarcador bien establecido de las arqueas, ya que se encuentra exclusivamente en ellas y en todos los grupos principales, excepto en las arqueas halófilas. [ 2 ] [ 3 ] Cuando se combina con otros análisis, puede utilizarse para obtener información adicional sobre la muestra analizada. Por ejemplo, la relación de abundancia del bifitano (tanto acíclico como cíclico) con respecto al fitano se ha utilizado para distinguir entre diferentes grupos de arqueas metanotróficas anaeróbicas (ANME) de sedimentos marinos, dada su mayor abundancia en ANME-1 que en ANME-2. [ 11 ]

Alternativamente, se podrían combinar mediciones de δ¹³C para confirmar aún más el origen. Debido a que los metanótrofos utilizan fuentes de carbono isotópicamente ligeras, se caracterizan por valores de isótopos de carbono muy negativos (es decir, empobrecidos en ¹³C ) . [ 12 ] Por ejemplo , al comparar los valores de δ¹³C de los diácidos bifitánicos y el bifitano derivado de GDGT de las mismas calizas de filtración, un estudio infirió que, a pesar de la similitud química de los compuestos, probablemente se derivaron de diferentes fuentes; mientras que los diácidos bifitánicos se derivaron principalmente de euriarqueas oxidantes de metano, los bifitanos se derivaron de fuentes mixtas. [ 13 ]

Estudio de caso: Sedimentos del Arcaico tardío

En 2006, Ventura et al. midieron hidrocarburos extraíbles con solventes mediante GC-MS en rocas metasedimentarias muestreadas del conjunto Tisdale y Porcupine (2707 a 2685 Ma) cerca de Timmins, ON, Canadá. [ 14 ] A partir de las muestras extraídas, los autores midieron bifitano, bifitanos cíclicos y derivados de bifitanos. [ 14 ] Dado que se pudo descartar la deposición post-arqueana de los compuestos debido a la reducida capacidad de adsorción y la porosidad restringida de los sedimentos, los autores pudieron concluir que la presencia de bifitano, junto con otros fósiles moleculares , sugiere la existencia de arqueas en los ambientes sedimentarios del Arcaico Tardío y en entornos hidrotermales subterráneos. [ 14 ]

Referencias

  1. 1 2 Schouten, Stefan; Wakeham, Stuart G; Damsté, Jaap S. Sinninghe (2001-10-01). "Evidencia de oxidación anaeróbica de metano por arqueas en aguas euxínicas del Mar Negro" . Geoquímica Orgánica . 32 (10): 1277– 1281. Bibcode : 2001OrGeo..32.1277S . doi : 10.1016/S0146-6380(01)00110-3 . ISSN 0146-6380 . 
  2. 1 2 3 4 5 Saito, Hiroyuki; Suzuki, Noriyuki (2010-09-01). "Distribución de bifitanodioles acíclicos y cíclicos en sedimentos marinos recientes del sitio IODP C0001, Fosa de Nankai" . Geoquímica orgánica . Avances en geoquímica orgánica 2009. 41 (9): 1001– 1004. Bibcode : 2010OrGeo..41.1001S . doi : 10.1016/j.orggeochem.2010.05.007 . hdl : 2115/47336 . ISSN 0146-6380 . 
  3. 1 2 3 4 5 6 Schouten, Stefan; Hopmans, Ellen C.; Sinninghe Damsté, Jaap S. (2013-01-01). "La geoquímica orgánica de los lípidos de glicerol dialquil glicerol tetraéter: una revisión" . Geoquímica orgánica . 54 : 19–61 . Bibcode : 2013OrGeo..54...19S . doi : 10.1016/j.orggeochem.2012.09.006 . ISSN 0146-6380 . 
  4. 1 2 Pancost, Richard D.; van Geel, Bas; Baas, Marianne; Sinninghe Damsté, Jaap S. (2000). <663:cvardo>2.0.co;2 "Valores de δ13C y fechas de radiocarbono de biomarcadores microbianos como trazadores del reciclaje de carbono en depósitos de turba" . Geology . 28 (7): 663. Bibcode : 2000Geo....28..663P . doi : 10.1130 /0091-7613(2000)28 < 663:cvardo > 2.0.co ; 2. ISSN 0091-7613 . 
  5. 1 2 3 4 Guo, Jinqiang; Yuan, Huamao; Canción, Jinming; Qu, Baoxiao; Xing, Jianwei; Wang, Qidong; Li, Xuegang; Duan, Liqin; Recubrimiento; Wang, Yingxia (18 de agosto de 2021). "Variación de GDGT isoprenoides en la columna de agua marina estratificada: implicaciones para la paleotermometría TEX86 basada en GDGT" . Fronteras en las ciencias marinas . 8 . doi : 10.3389/fmars.2021.715708 . ISSN 2296-7745 . 
  6. 1 2 3 4 Peters, Kenneth E., Clifford C. Walters y J. Michael Moldowan. La guía de biomarcadores: Volumen 2, Biomarcadores e isótopos en sistemas petrolíferos e historia de la Tierra . Cambridge University Press, 2007.
  7. 1 2 Chappe, B.; Albrecht, P.; Michaelis, W. (1982-07-02). "Lípidos polares de arqueobacterias en sedimentos y petróleos" . Science . 217 ( 4554): 65– 66. Bibcode : 1982Sci...217...65C . doi : 10.1126/science.217.4554.65 . ISSN 0036-8075 . PMID 17739984. S2CID 42758483 .   
  8. ^ Damsté, Jaap S. Sinninghe; Schouten, Stefan; Hopmans, Ellen C.; van Duin, Adri CT; Geenevasen, enero AJ (2002). "Crenarqueol" . Revista de investigación de lípidos . 43 (10): 1641–1651 . doi : 10.1194/jlr.M200148-JLR200 . PMID 12364548 . S2CID 219230652 .  
  9. Saito, Ryosuke; Kaiho, Kunio; Oba, Masahiro; Tong, Jinnan; Chen, Zhong-Qiang; Tian, ​​Li; Takahashi, Satoshi; Fujibayashi, Megumu (2017-09-01). "Identificación tentativa de productos diagenéticos de bifitanos cíclicos en rocas sedimentarias del Pérmico superior y el Triásico inferior" . Geoquímica orgánica . 111 : 144–153 . Bibcode : 2017OrGeo.111..144S . doi : 10.1016/j.orggeochem.2017.04.013 . ISSN 0146-6380 . 
  10. Finkel, Pablo L.; Carrizo, Daniel; Parro, Victor; Sánchez-García, Laura (2023). "Una visión general de los biomarcadores lipídicos en entornos extremos terrestres con relevancia para la exploración de Marte" . Astrobiología . 23 ( 5): 563– 604. Bibcode : 2023AsBio..23..563F . doi : 10.1089/ast.2022.0083 . ISSN 1531-1074 . PMC 10150655. PMID 36880883 .   
  11. Blumenberg, Martin; Seifert, Richard; Reitner, Joachim; Pape, Thomas; Michaelis, Walter (27 de julio de 2004). " Los patrones lipídicos de membrana caracterizan distintos consorcios metanotróficos anaeróbicos" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 101 (30): 11111– 11116. Bibcode : 2004PNAS..10111111B . doi : 10.1073/pnas.0401188101 . ISSN 0027-8424 . PMC 503748. PMID 15258285 .   
  12. Grice, Kliti; Brocks, Jochen J. (2011), "Biomarcadores (Isótopos orgánicos específicos de compuestos)" , en Reitner, Joachim; Thiel, Volker (eds.), Enciclopedia de Geobiología , Serie Enciclopedia de Ciencias de la Tierra, Dordrecht: Springer Netherlands, pp. 167–182 , doi : 10.1007/978-1-4020-9212-1_29 , ISBN  978-1-4020-9212-1, consultado el 20 de mayo de 2023
  13. Birgel, Daniel; Elvert, Marcus; Han, Xiqiu; Peckmann, Jörn (2008). "Diácidos bifitánicos empobrecidos en 13C como trazadores de la oxidación anaeróbica pasada del metano" . Geoquímica Orgánica . 39 (1): 152– 156. Bibcode : 2008OrGeo..39..152B . doi : 10.1016/j.orggeochem.2007.08.013 .
  14. 1 2 3 Ventura, Gregory T.; Kenig, Fabien; Reddy, Christopher M.; Schieber, Juergen; Frysinger, Glenn S.; Nelson, Robert K.; Dinel, Etienne; Gaines, Richard B.; Schaeffer, Philippe (2007-09-04). "Evidencia molecular de arqueas del Arcaico Tardío y la presencia de una biosfera hidrotermal subsuperficial" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 104 (36): 14260– 14265. doi : 10.1073/pnas.0610903104 . ISSN 0027-8424 . PMC 1964827. PMID 17726114 .   
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