C8orf48

C8orf48 es una proteína que en humanos está codificada por el gen C8orf48 . ^{[ 5 ]} C8orf48 es una proteína nuclear que se predice específicamente que se localiza en la lámina nuclear. ^{[ 6 ] [ 7 ]} Se ha descubierto que C8orf48 interactúa con proteínas que participan en la regulación de diversas respuestas celulares como la expresión génica, la secreción de proteínas, la proliferación celular y las respuestas inflamatorias. ^{[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]} Esta proteína se ha relacionado con el cáncer de mama y el carcinoma papilar de tiroides. ^{[ 11 ] [ 12 ]}

C8orf48 se localiza en el cromosoma 8 (8p22) y abarca desde la posición 13.566.843 hasta la 13.568.288 en la cadena positiva. ^{[ 13 ]} C8orf48 tiene un exón y ningún intrón. ^{[ 5 ] [ 14 ]} Esta proteína no tiene isoformas ni presenta empalme alternativo.

La proteína C8orf48 tiene una longitud de 319 aminoácidos. ^{[ 15 ]} El peso molecular de esta proteína es de 36,9 kDa y su punto isoeléctrico es de 8,86. ^{[ 16 ]} Se predice que la proteína C8orf48 es una proteína nuclear, ubicada específicamente en la lámina nuclear. ^{[ 6 ]} Esta proteína no posee péptidos señal ni dominios transmembrana. También se ha encontrado que esta proteína es bastante abundante en humanos. ^{[ 17 ]}

Estructura

La proteína C8orf48 tiene dos señales de localización nuclear predichas: una que abarca de los aminoácidos 135 a 149 y la otra de los aminoácidos 204 a 221. ^{[ 7 ]} La estructura secundaria de la proteína C8orf48 está compuesta principalmente por hélices alfa y hélices enrolladas. La estructura está compuesta por muy pocas láminas beta; un total de tres áreas muestran una posible estructura de lámina beta . ^{[ 16 ]}

La estructura terciaria de C8orf48 se obtuvo mediante el programa iTASSER.

C8orf48 se conserva en mamíferos, anfibios, reptiles, aves y peces. ^{[ 22 ]} No se encontraron ortólogos de C8orf48 en bacterias, arqueas, plantas ni hongos. ^{[ 22 ]} No se encontraron parálogos humanos de C8orf48. Ciertas porciones del dominio DUF 4606 están altamente conservadas en los ortólogos.

Se ha descubierto que este gen se sobreexpresa en los tejidos del testículo y el músculo del colon, así como en 76 etapas del desarrollo. ^{[ 23 ]} Se ha encontrado que C8orf48 se expresa con mayor frecuencia en la vejiga, el hueso, el corazón, la laringe, el testículo y la tiroides. ^{[ 24 ]} En cuanto a las etapas del desarrollo, C8orf48 se encontró con mayor frecuencia en el cuerpo embrionario. ^{[ 24 ]}

Perfiles GEO

En un estudio sobre células estromales mesenquimales de médula ósea de mieloma múltiple se observa que la expresión de C8orf48 es menor en las células del estado de enfermedad en comparación con las células sanas. ^{[ 25 ]} Lo opuesto se demuestra en el GeoProfile sobre endometriosis; en este estudio, se encontró que los niveles de C8orf48 son más altos en el estado de enfermedad que en el estado sano. ^{[ 26 ]} Otros estudios demuestran la expresión diferencial del cáncer de tiroides papilar y de las células de cáncer de mama MCF7 con silenciamiento del receptor de estrógeno alfa. En las muestras de control, los niveles de C8orf48 fueron menores que los de aquellas con el silenciamiento del receptor de estrógeno. ^{[ 11 ]}

En la Tabla 1 se presentan los factores de transcripción que actúan sobre C8orf48. La mayoría de estos factores participan en el crecimiento, la proliferación o la regulación de la migración celular. Esto sugiere que C8orf48 podría desempeñar un papel en el ciclo celular. Algunos factores de transcripción se presentaron más de una vez, tanto en la cadena positiva como en la negativa. Entre estos factores se incluyen la proteína de unión a MAX y el receptor alfa relacionado con el estrógeno (con preferencia de unión al ADN secundaria), ambos implicados en el crecimiento celular. ^{[ 27 ] [ 28 ]}

Las proteínas que interactúan con C8orf48 incluyen la proteína Deleted In Liver Cancer 1 ( DLC1 ), el inhibidor de la familia MyoD ( MDFI ), la proteína de dedo de zinc 14 ( ZNF14 ) y la sacroglicano zeta ( SGCZ ). ^{[ 8 ]} Todas estas interacciones proteicas se encontraron experimentalmente mediante un enfoque de agrupación de doble híbrido, una matriz de doble híbrido o un cribado de doble híbrido. ^{[ 10 ]}

Se ha encontrado C8orf48 en estudios sobre diversos tipos de carcinoma. Se han encontrado diferentes niveles de expresión de C8orf48 en el cáncer papilar de tiroides y en células de cáncer de mama MCF7 con silenciamiento del receptor de estrógeno alfa. ^{[ 25 ] [ 26 ]}