La calumenina es una proteína que en los humanos está codificada por el gen CALU . [ 5 ] [ 6 ]
La calumenina (CALU) es una proteína de unión al calcio localizada en el retículo endoplasmático (RE) y participa en funciones del RE como el plegamiento y la clasificación de proteínas . La calumenina pertenece a la superfamilia CERC, presente en el RE y el aparato de Golgi . CERC es un acrónimo de sus miembros: Cab-45, reticulocalbina , Erc-55 ( RCN2 ) y calumenina. El gen CALU codifica una proteína deducida de 315 aminoácidos que contiene 6 motivos EF-hand, 1 posible sitio de N-glicosilación y una señal de retención en el RE en el extremo C-terminal. Las proteínas CALU humana y de ratón presentan una identidad del 98%. El ARNm de CALU se expresa de forma ubicua en los tejidos humanos y se localiza en 7q32. [ 6 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000128595 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000029767 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ^ Yabe D, Taniwaki M, Nakamura T, Kanazawa N, Tashiro K, Honjo T (agosto de 1998). "Gen de calumenina humana (CALU): aislamiento de ADNc y mapeo cromosómico de 7q32". Genómica . 49 (2): 331– 3. doi : 10.1006/geno.1998.5245 . PMID 9598325 .
- ^ " Entrez Gene: CALU calumenina" .
Enlaces externos
- Ubicación del genoma humano CALU y página de detalles del gen CALU en el navegador genómico de UCSC .
Lecturas adicionales
- Yabe D, Nakamura T, Kanazawa N, et al. (1997). "Calumenina, una proteína de unión a Ca2+ retenida en el retículo endoplasmático con una nueva secuencia carboxilo-terminal, HDEF" . J. Biol. Chem . 272 (29): 18232–9 . doi : 10.1074/jbc.272.29.18232 . PMID 9218460 .
- Vorum H, Liu X, Madsen P, et al. (1998). "Clonación molecular de un ADNc que codifica la calumenina humana, expresión en Escherichia coli y análisis de su actividad de unión a Ca2+". Biochim. Biophys. Acta . 1386 (1): 121– 31. doi : 10.1016/s0167-4838(98)00089-2 . PMID 9675259 .
- Hseu MJ, Yen CH, Tzeng MC (1999). "Crocalbin: una nueva proteína de unión al calcio que también es una proteína de unión para la crotoxina, una fosfolipasa A2 neurotóxica" . FEBS Lett . 445 ( 2–3 ): 440–4 . doi : 10.1016/S0014-5793(99)00177-5 . PMID 10094503. S2CID 40129100 .
- Vorum H, Hager H, Christensen BM, et al. (1999). "La calumenina humana se localiza en la vía secretora y se secreta al medio". Exp. Cell Res . 248 (2): 473–81 . doi : 10.1006/excr.1999.4431 . PMID 10222138 .
- Vorum H, Jacobsen C, Honoré B (2000) . "La calumenina interactúa con el componente P del amiloide sérico". FEBS Lett . 465 ( 2–3 ): 129–34 . doi : 10.1016/S0014-5793(99)01734-2 . PMID 10631319. S2CID 1943508 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Res . 10 (11): 1788– 95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). "Hacia un catálogo de genes y proteínas humanas: secuenciación y análisis de 500 nuevos cDNA humanos completos que codifican proteínas" . Genome Res . 11 (3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Basrur V, Yang F, Kushimoto T, et al. (2003). "Análisis proteómico de melanosomas tempranos: identificación de nuevas proteínas melanosómicas". J. Proteome Res . 2 (1): 69– 79. doi : 10.1021/pr025562r . PMID 12643545 .
- Gevaert K, Goethals M, Martens L, et al. (2004). "Explorando proteomas y analizando el procesamiento de proteínas mediante la identificación por espectrometría de masas de péptidos N-terminales clasificados". Nat . Biotechnol . 21 (5): 566– 9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801. S2CID 23783563 .
- Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). "Cromosoma 7 humano: secuencia de ADN y biología" . Science . 300 ( 5620): 767– 72. Bibcode : 2003Sci...300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC 2882961. PMID 12690205 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Wiemann S, Arlt D, Huber W, et al. (2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Res . 14 (10B): 2136–44 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 ( 7062): 1173– 8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514. S2CID 4427026 .
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2007). "Secuencia señal y trampa de palabras clave in silico para la selección de cDNA humanos de longitud completa que codifican proteínas de secreción o de membrana a partir de bibliotecas de cDNA con tapa de oligo" . DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, et al. (2006). " La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Res . 34 (Número especial sobre bases de datos): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, et al. (2006). "Un enfoque basado en probabilidades para el análisis de fosforilación de proteínas de alto rendimiento y la localización de sitios". Nat . Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243. S2CID 14294292 .
- Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, et al. (2007). "Caracterización proteómica y bioinformática de la biogénesis y función de los melanosomas". J. Proteome Res . 5 (11): 3135–44 . doi : 10.1021/pr060363j . PMID 17081065 .
- Genes en el cromosoma 7 humano
- Fragmentos de genes del cromosoma 7 humano
- Proteínas que contienen el dominio EF-hand