VPS13B

La proteína de transferencia de lípidos intermembrana VPS13B , también conocida como proteína asociada a la clasificación de proteínas vacuolares 13B y proteína del síndrome de Cohen 1 , es una proteína que en humanos está codificada por el gen VPS13B . Es una proteína gigante asociada al aparato de Golgi que se cree que participa en la clasificación y el transporte post-aparato de Golgi. ^{[ 5 ]} Las mutaciones en el gen VPS13B humano causan el síndrome de Cohen .

El gen VPS13B también se conoce como CHS1, COH1, KIAA0532, ^{[ 6 ]} y DKFZp313I0811. ^{[ 7 ]}

La localización citogenética del gen humano VPS13B es 8q22, que corresponde al brazo largo del cromosoma ocho en la posición 22.2. Se han identificado diversas variantes de empalme que codifican isoformas. La forma canónica de la proteína expresada, codificada por el gen humano VPS13B, tiene 3997 aminoácidos . ^{[ 6 ]}

El gen VPS13B se encuentra en el cromosoma 8q22. Las deleciones en este cromosoma están asociadas con el síndrome de Cohen , razón por la cual este gen también se denomina COH1. ^{[ 8 ]} El gen está compuesto por 66 exones , cuatro de los cuales son alternativos. ^{[ 9 ]} El patrón de empalme alternativo en el gen VS13B es complejo en las regiones analizadas, incluyendo los exones 28B y 28. Esto finalmente provoca que se utilicen cuatro codones de terminación y tres formas de empalme alternativo . ^{[ 10 ]} El exón 2 es donde se encuentra su codón de inicio de traducción . ^{[ 9 ]}  VPS13B es un gen grande: abarca una región de secuencia de ADN genómico de aproximadamente 864 kilobases pares, o 846 000 pares de bases. ^{[ 9 ]} El gen VPS13B se expresa ampliamente, especialmente en la próstata , testículo, ovario y colon, con transcritos de aproximadamente 12 a 14 kilobases. También se expresa en el cerebro fetal, hígado y riñón, con transcritos de aproximadamente 2,0 a 5,0 kilobases. La expresión en el cerebro adulto es mínima. ^{[ 11 ]} Las variantes 1A y 2A son las principales variantes del gen que codifican proteínas de 4022 y 39997 aminoácidos, respectivamente. ^{[ 8 ]} Dos secuencias repetidas Alu están presentes en las regiones 3' no traducidas. ^{[ 12 ]}

El gen VPS13B también se conoce como: ^{[ 13 ]}

• CHS1
• COH1
• Síndrome de Cohen 1
• DKFZp313I0811
• KIAA0532
• Homólogo B de la proteína de clasificación vacuolar 13 (levadura)
• Clasificación de proteínas vacuolares 13B
• VP13B_HUMAN

Las proteínas producidas a partir del gen VPS13B forman parte del aparato de Golgi . ^{[ 13 ]} También son responsables de la clasificación y el transporte de proteínas dentro de la célula. ^{[ 13 ]} La proteína VPS13B es importante porque desempeña un papel crucial en la función del crecimiento normal, el desarrollo de las neuronas y el desarrollo de los adipocitos. ^{[ 13 ]} Esta proteína también puede desempeñar un papel en el desarrollo de la función de los ojos, el sistema hematológico y el sistema nervioso central; y en el almacenamiento y la distribución de grasas en el cuerpo. ^{[ 14 ]} VPS13B se encuentra en el locus 8q22.2. ^{[ 13 ]} Esto significa que el gen VPS13B está ubicado en el cromosoma 8 en la posición 22.2 en el brazo q largo en 8q22.2. ^{[ 13 ]} La proteína VPS13B está compuesta por 4.022 aminoácidos y podría tener un total de diez dominios transmembrana y un patrón complejo de motivos funcionales. ^{[ 15 ]}

Actualmente, el gen VPS13B se reconoce como un gen codificador de proteínas que produce la proteína VPS13B. ^{[ 16 ]} La proteína VPS13B se ha asociado con el aparato de Golgi y procesos intracelulares como la modificación , organización y distribución de proteínas. ^{[ 17 ]} También se ha especulado que la proteína VPS13B puede influir en el desarrollo de ciertas células somáticas y sistemas corporales, y puede estar involucrada en el almacenamiento y la distribución de grasas en humanos. ^{[ 6 ] [ 17 ]}

Las mutaciones en el gen VPS13B pueden provocar una función anormal de la proteína VPS13B. Se ha vinculado a mutaciones dentro del gen como un factor potencial en el síndrome de Cohen y el autismo . ^{[ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ]} En el síndrome de Cohen, se cree que las mutaciones por deleción en el gen alteran la forma de la proteína VPS13B, lo que resulta en una proteína más corta y no funcional. ^{[ 17 ] [ 19 ]} La proteína VPS13B alterada no puede funcionar correctamente debido a estos cambios genéticos, lo que provoca una obstrucción de los procesos regulares. ^{[ 17 ]} Los estudios también han vinculado mutaciones en el gen VPS13B con la osteoporosis . ^{[ 8 ]} Se ha encontrado una asociación entre un aumento de las variantes del número de copias de VPS13B y una menor densidad mineral ósea en adultos. ^{[ 8 ]} Sin embargo, se desconoce la función normal y definitiva del gen VPS13B , así como las implicaciones específicas de sus formas mutadas.

Se han identificado más de 150 tipos de mutaciones diferentes en el gen VPS13B en individuos diagnosticados con síndrome de Cohen. ^{[ 13 ]} Una deleción en el gen VPS13B provoca una señal de parada prematura en las instrucciones para la síntesis de la proteína VPS13B, lo que hace que la proteína sea anormalmente corta e inactiva. ^{[ 13 ]} Cuando esto ocurre, la proteína inactiva impide el correcto funcionamiento del aparato de Golgi y detiene la glicosilación normal. ^{[ 13 ]}

• Asociación del síndrome de Cohen. Archivado el 27/06/2011 en Wayback Machine.
• Entrada de GeneReviews/NCBI/NIH/UW sobre el síndrome de Cohen