CZIB

CZIB es un gen del genoma humano que codifica la proteína que contiene el motivo CXXC y se une al zinc. Anteriormente, CZIB se conocía como C1orf123 .

CZIB es un gen ubicado en el genoma humano en el brazo corto del cromosoma 1 , en la posición p32.2, entre los pares de bases 53.679.771 y 53.686.289. Tiene una longitud de 6.519 bases con 8 exones y codifica la proteína C1orf123, también conocida como UPF0587. ^{[ 5 ]}

Vecindario genético

Los siguientes genes están cerca de CZIB en el cromosoma 1.

-LRP8: Este gen codifica un miembro de la familia del receptor de lipoproteínas de baja densidad (LDLR), una proteína de la superficie celular que desempeña un papel tanto en la transducción de señales como en la endocitosis mediada por receptores de ligandos específicos para su degradación lisosomal. ^{[ 6 ]}

-CPT2: Este gen codifica una proteína nuclear que se transporta a la membrana interna mitocondrial. ^{[ 7 ]}

-MAGOH: Codifica una proteína que es un componente de un complejo de unión de exones multiproteico dependiente del empalme (EJC) depositado en la unión de empalme en los ARNm. ^{[ 8 ]}

-SLC1A7: Transporta L-glutamato. Su conductancia de cloruro asociada puede participar en el procesamiento visual. ^{[ 9 ]}

La proteína CZIB tiene 160 aminoácidos de longitud y pesa 18,0 kdal. ^{[ 5 ]} Tiene un punto isoeléctrico de 4,73 y pertenece al dominio/familia DUF866, que consta de muchas proteínas eucariotas hipotéticas de función desconocida, todas ellas con una longitud de alrededor de 165 residuos. ^{[ 10 ]} Los alias de la proteína incluyen FLJ20580 y proteína UPF0587. ^{[ 11 ]}

CZIB tiene muchos ortólogos en especies cercanas y distantes, incluyendo primates, mamíferos, reptiles, aves, invertebrados, musgos y levaduras. Las secuencias de proteínas están altamente conservadas en todas estas especies, aunque los transcritos de ARNm del gen solo se han encontrado en primates. No existen parálogos de C1orf123. ^{[ 12 ]}

La proteína C1orf123 no tiene regiones transmembrana, por lo que probablemente no sea una proteína transmembrana. Se han encontrado experimentalmente tres sitios de modificación postraduccional , incluyendo una fosfotirosina , fosfoserina y un isopeptido de glicil - lisina . ^{[ 13 ]} Una porción de la 3' UTR de C1orf123 tiene 100% de identidad con el ARNm para la carnitina palmitoiltransferasa 2 de Homo sapiens, que es un gen nuclear que codifica una proteína mitocondrial. Este gen trabaja con la carnitina palmitoiltransferasa I, y la proteína codificada oxida ácidos grasos de cadena larga en las mitocondrias. ^{[ 14 ]} Se ha encontrado que la estructura secundaria de la proteína C1orf123 es muy similar a la de la proteína MAL13P1.257. Se cree que la proteína C1orf123 tiene siete regiones de lámina beta y una región de hélice alfa y, según el programa Phyre2, hay una confianza del 100 % de que la estructura del 95 % de la proteína C1orf123 coincide con la proteína hipotética MAL13P1.257. ^{[ 15 ]} La MAL13P1.257 es una proteína hipotética conservada del plasmodio de función desconocida. ^{[ 16 ]}

Diversos datos de expresión genética han demostrado que "C1orf123" se expresa en cantidades variables dentro del cuerpo humano. Su expresión es máxima en las glándulas nerviosas y pituitarias, y no se expresa en otros sitios del cuerpo como el oído, el esófago, la laringe y las amígdalas. ^{[ 17 ]} Al comparar estados de salud para la expresión de "C1orf123", se encontró que la expresión del gen aumentaba en tumores suprarrenales y disminuía a niveles inferiores a lo normal en tumores renales y pulmonares. En cuanto a las etapas del desarrollo, "C1orf123" se expresa en mayor medida en el feto y no se expresa en absoluto en neonatos y lactantes. En general, "C1orf123" se expresa en cantidades relativamente promedio en el cuerpo humano, con la excepción de las células NK CD34+ y CD56+, donde la expresión es el doble de la cantidad promedio. ^{[ 18 ]} Los perfiles GEO brindan información sobre la expresión de "C1orf123" bajo diversas condiciones. Se observa que la expresión del gen está ausente en condiciones de hipoxia, como se muestra en la figura siguiente. Los perfiles GEO también muestran que la expresión de "C1orf123" no cambia en el cáncer papilar de tiroides ni en la infección por clamidia. ^{[ 19 ]}

La pérdida del brazo corto del cromosoma 1, la parte del cromosoma 1 donde se localiza C1orf123, causa tumorigénesis de la glándula paratiroides , lo que resulta en hiperparatiroidismo . El 60% de los tumores analizados mostraron una alteración en 1p, en el locus MEN1 o en ambos. La conclusión de este estudio es que el brazo corto del cromosoma 1 contiene al menos dos genes supresores de tumores diferentes involucrados en la tumorigénesis paratiroidea. ^{[ 20 ]}