Entidades Químicas de Interés Biológico , también conocidas como ChEBI , [ 1 ] [ 2 ] es una base de datos química y ontología de entidades moleculares centrada en compuestos químicos "pequeños", que forma parte del proyecto Open Biomedical Ontologies (OBO) del Instituto Europeo de Bioinformática (EBI). El término "entidad molecular" se refiere a cualquier " átomo , molécula , ion , par iónico , radical , ion radical , complejo , conformero , etc., constitutivamente o isotópicamente distinto, identificable como una entidad distinguible por separado". [ 3 ] Las entidades moleculares en cuestión son productos naturales o sintéticos con potencial bioactividad. Las moléculas codificadas directamente por el genoma, como los ácidos nucleicos , las proteínas y los péptidos derivados de proteínas por escisión proteolítica , no suelen estar incluidas en ChEBI.
ChEBI utiliza la nomenclatura , el simbolismo y la terminología avalados por la Unión Internacional de Química Pura y Aplicada (IUPAC) y el comité de nomenclatura de la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (NC-IUBMB).
Alcance y acceso
Todos los datos de la base de datos son de dominio público o provienen de fuentes públicas. Por lo tanto, son de libre acceso y están disponibles para cualquier persona. Además, cada dato es completamente rastreable y está referenciado explícitamente a su fuente original. Su alcance está relacionado con otras bases de datos como ChEMBL , ChemSpider , DrugBank , MetaboLights y PubChem .
Los datos de ChEBI están disponibles a través de una aplicación web pública , servicios web , un punto final SPARQL y descargas. [ 1 ] [ 2 ]
Referencias
- 1 2 3 Malik A, Arsalan M, Moreno C, Mosquera J, Félix E, Kizilören T, Muthukrishnan V, Zdrazil B, Leach AR, O'Boyle N (2026). "ChEBI: rediseñado para un futuro sostenible" . Nucleic Acids Research . 54 (número especial de base de datos): D1768-1778. doi : 10.1093/nar/ gkaf1271 . PMC 12807787. PMID 41312627 .
- 1 2 Degtyarenko K, de Matos P, Ennis M, Hastings J, Zbinden M, McNaught A, Alcántara R, Darsow M, Guedj M, Ashburner M (2008). "ChEBI: una base de datos y ontología para entidades químicas de interés biológico" . Nucleic Acids Research . 36 (número especial de bases de datos): D344-50. doi : 10.1093/nar/gkm791 . PMC 2238832. PMID 17932057 .
- ↑ IUPAC , Compendio de Terminología Química , 5.ª ed. (el "Libro de Oro") (2025). Versión en línea: (2006 – ) " entidad molecular ". doi : 10.1351/goldbook.M03986
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