Articulo de referencia

chaperona química

Las chaperonas químicas son una clase de moléculas pequeñas que mejoran el plegamiento y/o la estabilidad de las proteínas . Constituyen un grupo amplio y diverso de moléculas q...

Las chaperonas químicas son una clase de moléculas pequeñas que mejoran el plegamiento y/o la estabilidad de las proteínas . Constituyen un grupo amplio y diverso de moléculas que pueden influir en la estabilidad proteica y la organización polipeptídica mediante diversos mecanismos. Se utilizan en una amplia gama de aplicaciones, desde la producción de proteínas recombinantes hasta el tratamiento del plegamiento incorrecto de proteínas in vivo .

Clases de chaperonas químicas

Existen numerosas moléculas pequeñas que pueden mejorar la estabilidad y el plegamiento de las proteínas; muchas de ellas pueden agruparse en grandes clases según su estructura y su mecanismo de acción propuesto. Los parámetros que definen estos grupos no están estrictamente definidos, y muchas moléculas pequeñas que ejercen un efecto de chaperona química no se ajustan fácilmente a ninguna de estas categorías. Por ejemplo, el aminoácido libre arginina no se define clásicamente como una chaperona química, pero tiene un efecto antiagregante bien documentado. [ 1 ]

Osmolitos

Los osmolitos celulares son pequeñas moléculas polares que las células sintetizan o absorben para mantener la integridad de los componentes celulares durante períodos de estrés osmótico u otras formas de estrés. [ 1 ] Los osmolitos son diversos en su estructura química e incluyen polioles, azúcares, metilaminas y aminoácidos libres y sus derivados. Ejemplos de estos incluyen glicerol , trehalosa , óxido de trimetilamina (TMAO) y glicina . [ 2 ] A pesar de ser más activos en concentraciones relativamente altas, los osmolitos no muestran ningún efecto sobre los procesos celulares normales; por esta razón, también se les conoce comúnmente como "solutos compatibles". [ 1 ] Los osmolitos ejercen sus efectos de chaperona indirectamente al cambiar la interacción de la proteína con el solvente, en lugar de a través de una interacción directa con la proteína. Las interacciones desfavorables entre proteínas y osmolitos aumentan la solvatación de la proteína con agua. Esta mayor hidratación favorece conformaciones polipeptídicas más compactas, en las que los residuos hidrofóbicos quedan más aislados del disolvente polar. Por lo tanto, se cree que los osmolitos actúan estructurando intermedios parcialmente plegados y estabilizando termodinámicamente las conformaciones plegadas en mayor medida que las desplegadas. [ 2 ]

Compuestos hidrofóbicos

Los compuestos químicos con distintos grados de hidrofobicidad, pero solubles en medios acuosos, también pueden actuar como chaperonas químicas. Se cree que estos compuestos actúan uniéndose a segmentos hidrofóbicos expuestos al disolvente de proteínas desplegadas o mal plegadas, protegiéndolas así de la agregación. El 4-fenilbutirato (PBA) es un ejemplo destacado de este grupo de compuestos, junto con los ácidos lisofosfatídicos y otros lípidos y detergentes. [ 3 ]

chaperonas farmacológicas

Otra clase de chaperonas está compuesta por ligandos proteicos, cofactores, inhibidores competitivos y otras moléculas pequeñas que se unen específicamente a ciertas proteínas. Debido a que estas moléculas son activas solo en una proteína específica, se las denomina chaperonas farmacológicas. Estas moléculas pueden inducir estabilidad en una región específica de una proteína mediante interacciones de unión favorables, que reducen la flexibilidad conformacional inherente de la cadena polipeptídica. [ 2 ] Otra propiedad importante de las chaperonas farmacológicas es que pueden unirse a la proteína desplegada o mal plegada y luego disociarse una vez que la proteína se pliega correctamente, dejando una proteína funcional. [ 1 ]

Aplicaciones

Expresión de proteínas recombinantes

Además de sus aplicaciones clínicas, las chaperonas químicas han demostrado ser útiles en la producción in vitro de proteínas recombinantes.

Replegamiento de proteínas insolubles a partir de cuerpos de inclusión

La expresión recombinante de proteínas en Escherichia coli suele dar lugar a la formación de agregados proteicos insolubles denominados cuerpos de inclusión . Estos cuerpos proteicos requieren replegamiento in vitro una vez extraídos de las células de E. coli mediante un detergente fuerte. Se cree que las proteínas se despliegan durante el proceso de solubilización, y la posterior eliminación del detergente mediante dilución permite su replegamiento. Tanto los potenciadores del plegamiento como los supresores de la agregación se emplean a menudo durante la eliminación del desnaturalizante para facilitar el plegamiento a la estructura nativa y prevenir la agregación. Los potenciadores del plegamiento ayudan a la proteína a adoptar la estructura nativa lo antes posible cuando la concentración de detergente disminuye drásticamente de golpe, como en el proceso de dilución. Por otro lado, los supresores de la agregación impiden que los intermediarios del plegamiento proteico se agreguen incluso después de una exposición prolongada a un nivel intermedio de detergente, como se observa en la diálisis. Por ejemplo, se ha informado que la taurina aumenta significativamente el rendimiento del replegamiento in vitro de anticuerpos de fragmento Fab . [ 1 ]

Expresión periplásmica

El descubrimiento del efecto de las chaperonas químicas en el plegamiento de proteínas condujo a la expresión periplásmica de proteínas, especialmente para aquellas que requieren un ambiente oxidativo para formar enlaces disulfuro y lograr un plegamiento adecuado. El plegamiento de proteínas que resulta difícil en el citoplasma puede potenciarse en el periplasma , donde la presión osmótica se puede controlar fácilmente. La presión osmótica del espacio periplásmico se puede modificar simplemente cambiando la del medio, ya que los osmolitos penetran libremente la membrana externa. Las proteínas se secretan a este espacio cuando se les une una secuencia señal apropiada en su extremo. Un buen ejemplo de potenciación del plegamiento mediante la expresión periplásmica es la variante del activador del plasminógeno (rPA) que contiene enlaces disulfuro. Se ha demostrado que el plegamiento de rPA aumenta cuando se añaden potenciadores del plegamiento o arginina al medio de cultivo. [ 1 ]

Uso de halófilos en la producción de proteínas

Los halófilos son un tipo de extremófilos que se han adaptado a soluciones salinas extremas. Se clasifican en dos categorías: 1) arqueas extremadamente halófilas y 2) bacterias moderadamente halófilas . Las arqueas extremadamente halófilas se han adaptado para requerir altas concentraciones de sal (2,5 M) en su entorno vital, incorporando dicha concentración a sus células. Por otro lado, las bacterias moderadamente halófilas logran vivir en un amplio rango de concentraciones de sal mediante la síntesis o incorporación de compuestos orgánicos. Muchas bacterias y arqueas halófilas son fáciles de mantener, y su alta presión osmótica celular se ha aprovechado en la producción de proteínas recombinantes. El entorno celular de los halófilos puede ajustarse con precisión para facilitar el plegamiento de la proteína de interés, modificando la concentración de osmolitos en el medio de cultivo. Se ha informado de la expresión y el plegamiento exitosos de la proteína de nucleación de hielo, GFP, α-amilasa, nucleótido difosfato quinasa y serina racemasa en halófilos. [ 1 ]

Enfermedades relacionadas con el plegamiento de proteínas

Dado que las chaperonas químicas promueven la conservación de la estructura nativa de las proteínas, se han explorado las posibilidades de desarrollar chaperonas químicas para aplicaciones clínicas en diversas enfermedades relacionadas con el plegamiento de proteínas.

Fibrosis quística

La fibrosis quística (FQ) es una enfermedad que resulta de una alteración en el mantenimiento del nivel del regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística (CFTR), que funciona como un canal de cloruro en los tejidos pulmonares. Se ha encontrado una mutación puntual ΔF508 en la proteína CFTR que interfiere con la maduración de la proteína en varios pacientes con FQ. Se ha observado que la CFTR mutante generalmente no se transporta a la membrana celular y se degrada en el RE; sin embargo, las que logran llegar a la membrana celular son completamente funcionales. Como resultado, se ha demostrado que varias chaperonas químicas promueven el transporte de la CFTR ΔF508 a la membrana plasmática. [ 4 ]

Amiloidosis por transtiretina

La transtiretina (TTR) parcialmente desnaturalizada puede promover la formación de fibrillas amiloides en las células, y esta agregación puede provocar toxicidad celular y diversas patologías humanas. Se han descubierto muchos inhibidores de moléculas pequeñas de la formación de amiloide por TTR que actúan estabilizando cinéticamente el tetrámero de TTR. Esto previene el plegamiento incorrecto del monómero al dificultar la disociación del tetrámero de TTR. [ 5 ] Tafamidis es una de estas moléculas pequeñas que ha sido aprobada por varias agencias reguladoras internacionales para el tratamiento de la polineuropatía amiloide familiar por transtiretina. [ 6 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 Rajan, R; Tsumoto, K; Tokunaga, M; Tokunaga, H; Kita, Y; Arakawa, T. (2011). "Chaperonas químicas y farmacológicas: aplicación para la producción de proteínas recombinantes y enfermedades del plegamiento de proteínas". Curr. Med. Chem . 18 (1): 1– 15. doi : 10.2174/092986711793979698 . PMID 21110818 . 
  2. 1 2 3 Leandro, P; Gomes, C (2008). "Plegamiento incorrecto de proteínas en trastornos conformacionales: rescate de defectos de plegamiento y chaperonas químicas". Mini-Rev. Med. Chem . 8 (9): 901– 911. CiteSeerX 10.1.1.642.9075 . doi : 10.2174/138955708785132783 . PMID 18691147 .  
  3. Papp, E; Csermely, P (2006). "Chaperonas químicas: mecanismos de acción y uso potencial". Mol. Chaperones Heal. Dis . Handbook of Experimental Pharmacology. 2006 (172): 405– 416. doi : 10.1007/3-540-29717-0_16 . ISBN 978-3-540-25875-9. PMID 16610368 . 
  4. Welch, WJ; Brown, CR (1996). "Influencia de las chaperonas moleculares y químicas en el plegamiento de proteínas" . Cell Stress & Chaperones . 1 (2): 109– 15. doi : 10.1379/1466-1268(1996)001 < 0109: iomacc > 2.3.co ; 2. PMC 248462. PMID 9222596 .  
  5. Connelly, S.; Choi, S.; Johnson, SM; Kelly, JW; Wilson, IA (2010). "Diseño basado en la estructura de estabilizadores cinéticos que mejoran las amiloidosis por transtiretina" . Curr . Opin. Struct. Biol . 20 (1): 54– 62. doi : 10.1016/j.sbi.2009.12.009 . PMC 2830738. PMID 20133122 .  
  6. "Vyndaqel® (Tafamidis) de Pfizer, primera terapia aprobada en la Unión Europea para la enfermedad neurodegenerativa rara y mortal polineuropatía amiloide familiar por transtiretina (TTR-FAP)" . www.businesswire.com . 17 de noviembre de 2011. Consultado el 12 de diciembre de 2014 .
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