La probable ARN helicasa dependiente de ATP DDX41 es una enzima que en humanos está codificada por el gen DDX41 . [ 5 ] [ 6 ]
Las proteínas DEAD box , caracterizadas por el motivo conservado Asp - Glu - Ala -Asp (DEAD), son presuntas helicasas de ARN . Están implicadas en varios procesos celulares que implican la alteración de la estructura secundaria del ARN , como la iniciación de la traducción , el empalme nuclear y mitocondrial , y el ensamblaje de ribosomas y espliceosomas . Basándose en sus patrones de distribución, se cree que algunos miembros de la familia de proteínas DEAD box participan en la embriogénesis , la espermatogénesis y el crecimiento y la división celular . Este gen codifica un miembro de esta familia. La función de este miembro no se ha determinado. Según estudios en Drosophila , el gen es ampliamente requerido durante la expresión génica postranscripcional . [ 6 ] Las mutaciones de la línea germinal DDX41 definen un subtipo único de neoplasias mieloides. [ 7 ]
Función
Se cree que DDX41 participa en varias funciones celulares. Se concentra principalmente en el núcleo de la célula, pero también puede expresarse en el citoplasma. [ 8 ] [ 9 ] En el citoplasma participa en la vía de producción de interferón I al reconocer ADN citoplasmático extraño y señalizar STING . [ 10 ] Se ha observado que las mutaciones hipomórficas de DDX41 perjudican la respuesta del sistema inmunitario a las infecciones virales y bacterianas . En el núcleo, se cree que DDX41 regula el proceso de elongación transcripcional , señalizando a Pol II para ralentizar la elongación mientras se lleva a cabo el proceso de empalme. Se ha demostrado que la subexpresión y la inhibición de DDX41 conducen a la formación de un bucle R que resulta en errores transcripcionales sin patrones específicos. [ 8 ] También se cree que DDX41 participa en el proceso de biogénesis de ribosomas , dadas sus implicaciones en el procesamiento de snoRNA . [ 11 ]
Se ha demostrado que las mutaciones de la línea germinal DDX41 están asociadas con el síndrome mielodisplásico y la leucemia mieloide aguda . [ 12 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000183258 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000021494 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Irion U, Leptin M (diciembre de 1999). "Funciones biológicas celulares y del desarrollo de la proteína abstrakt de la caja DEAD de Drosophila" . Current Biology . 9 (23): 1373– 1381. Bibcode : 1999CBio....9.1373I . doi : 10.1016/S0960-9822(00)80082-2 . PMID 10607561. S2CID 16448276 .
- 1 2 "Gen Entrez: DDX41 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) caja polipéptido 41" .
- ↑ Makishima H, Saiki R, Nannya Y, Korotev S, Gurnari C, Takeda J, et al. (febrero de 2023). " Las mutaciones de la línea germinal DDX41 definen un subtipo único de neoplasias mieloides" . Blood . 141 (5): 534– 549. doi : 10.1182/blood.2022018221 . PMC 10935555. PMID 36322930. S2CID 253266118 .
- 1 2 Shinriki S, Hirayama M, Nagamachi A, Yokoyama A, Kawamura T, Kanai A, et al. (noviembre de 2022). " DDX41 coordina el empalme de ARN y la elongación transcripcional para prevenir el estrés de replicación del ADN en células hematopoyéticas" . Leukemia . 36 (11): 2605– 2620. doi : 10.1038/s41375-022-01708-9 . PMC 9613458. PMID 36229594 .
- ↑ Jiang Y, Zhu Y, Qiu W, Liu YJ, Cheng G, Liu ZJ, et al. (enero de 2017). " Análisis estructural y funcional del dominio DEAD de DDX41 humano" . Protein & Cell . 8 (1): 72–76 . doi : 10.1007/s13238-016-0351-9 . PMC 5233616. PMID 27928732 .
- ^ Omura H, Oikawa D, Nakane T, Kato M, Ishii R, Ishitani R, et al. (octubre de 2016). "Análisis estructural y funcional de DDX41: un receptor inmunológico biespecífico para ADN y dinucleótido cíclico" . Informes científicos . 6 (1) 34756. Código bibliográfico : 2016NatSR...634756O . doi : 10.1038/srep34756 . PMC 5056382 . PMID 27721487 .
- ^ Tungalag S, Shinriki S, Hirayama M, Nagamachi A, Kanai A, Inaba T, et al. (junio de 2023). "El análisis de perfiles de ribosomas revela las funciones de DDX41 en la regulación traslacional". Revista Internacional de Hematología . 117 (6): 876– 888. doi : 10.1007/s12185-023-03558-2 . PMID 36780110 . S2CID 256826641 .
- ↑ Churpek J (1993). "Síndrome mielodisplásico familiar asociado a DDX41 y leucemia mieloide aguda" . NIH . Gene Reviews. PMID 34723452 .
Lecturas adicionales
- Kim K, Ong F, Sasaki K (enero de 2023). " Comprensión actual de las mutaciones DDX41 en neoplasias mieloides" . Cancers . 15 (2): 344. doi : 10.3390/cancers15020344 . PMC 9857085. PMID 36672294 .
- Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–156 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (abril de 2002). "Purificación y caracterización de espliceosomas nativos adecuados para el análisis estructural tridimensional" . RNA . 8 ( 4): 426– 439. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266. PMID 11991638 .
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, et al. (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130– 12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073 / pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, et al. (enero de 2005). "Dinámica del proteoma nucleolar". Nature . 433 ( 7021): 77– 83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413. S2CID 4344740 .
- Abdul-Ghani M, Hartman KL, Ngsee JK (julio de 2005). "Abstrakt interactúa con y regula la expresión de sorting nexin-2" . Journal of Cellular Physiology . 204 (1): 210– 218. doi : 10.1002/jcp.20285 . PMC 2963638. PMID 15690390 .
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (abril de 2006). "Análisis del fosfoproteoma del huso mitótico humano" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (14): 5391– 5396. Bibcode : 2006PNAS..103.5391N . doi : 10.1073/pnas.0507066103 . PMC 1459365. PMID 16565220 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, et al. (noviembre de 2006). " Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635– 648. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573 .
- Genes en el cromosoma 5 humano
- Fragmentos de genes del cromosoma 5 humano