Hispanopedia WikiDIALIGN-TX es un programa de alineamiento de secuencias múltiples escrito por Amarendran R. Subramanian y es una mejora sustancial de DIALIGN-T al combinar estrategias de alineamiento progresivo y codicioso en un nuevo algoritmo.
El DIALIGN-T original es una reimplementación del programa de alineamiento múltiple DIALIGN. Debido a varias mejoras algorítmicas, produce alineamientos significativamente mejores en conjuntos de secuencias relacionadas local y globalmente que las versiones anteriores de DIALIGN. Sin embargo, al igual que la implementación original del programa, DIALIGN-T utiliza un enfoque voraz sencillo para ensamblar alineamientos múltiples a partir de similitudes de secuencias locales por pares. Estos enfoques voraces pueden ser vulnerables a similitudes aleatorias espurias y, por lo tanto, pueden conducir a resultados subóptimos. DIALIGN-TX es una mejora sustancial de DIALIGN-T que combina el algoritmo voraz anterior con un enfoque de alineamiento progresivo.
Véase también
Referencias
- Subramanian AR, Kaufmann M, Morgenstern B. DIALIGN-TX: Enfoques voraces y progresivos para el alineamiento de secuencias múltiples basado en segmentos. Algoritmos para biología molecular 2008, 3:6
- Subramanian AR, Weyer-Menkhoff J, Kaufmann M, Morgenstern B. DIALIGN-T: Un algoritmo mejorado para la alineación de secuencias múltiples basada en segmentos. BMC Bioinformatics 2005, 6:66
Enlaces externos
- Sitio web oficial Archivado el 28 de octubre de 2011 en Wayback Machine.