DIALIGN-TX

DIALIGN-TX es un programa de alineación de secuencias múltiples escrito por Amarendran R. Subramanian y representa una mejora sustancial de DIALIGN-T al combinar estrategias de alineación voraz y progresiva en un nuevo algoritmo.

DIALIGN-T original es una reimplementación del programa de alineamiento múltiple DIALIGN. Gracias a varias mejoras algorítmicas, produce alineamientos significativamente mejores en conjuntos de secuencias relacionadas local y globalmente que las versiones anteriores de DIALIGN. Sin embargo, al igual que la implementación original del programa, DIALIGN-T utiliza un enfoque voraz directo para ensamblar alineamientos múltiples a partir de similitudes de secuencias locales por pares. Estos enfoques voraces pueden ser vulnerables a similitudes aleatorias espurias y, por lo tanto, pueden conducir a resultados subóptimos. DIALIGN-TX es una mejora sustancial de DIALIGN-T que combina el algoritmo voraz anterior con un enfoque de alineamiento progresivo.

• DIALIGN-T
• Software de alineación de secuencias
• Clustal

• Subramanian AR, Kaufmann M, Morgenstern B. DIALIGN-TX: Enfoques voraces y progresivos para el alineamiento múltiple de secuencias basado en segmentos. Algorithms for Molecular Biology 2008, 3:6
• Subramanian AR, Weyer-Menkhoff J, Kaufmann M, Morgenstern B. DIALIGN-T: Un algoritmo mejorado para el alineamiento múltiple de secuencias basado en segmentos. BMC Bioinformatics 2005, 6:66

• Sitio web oficial archivado el 28/10/2011 en Wayback Machine.