Articulo de referencia

difosfatasa de dUTP

En enzimología , una dUTP difosfatasa ( EC 3.6.1.23 ) es una enzima que cataliza la reacción química dUTP + H 2 O ⇌ {\displaystyle \rightleftharpoons } dUMP + difosfato Así , lo...

En enzimología , una dUTP difosfatasa ( EC 3.6.1.23 ) es una enzima que cataliza la reacción química

dUTP + H 2 O{\displaystyle \rightleftharpoons }dUMP + difosfato

Así , los dos sustratos de esta enzima son dUTP y H2O , mientras que sus dos productos son dUMP y difosfato .

Esta enzima pertenece a la familia de las hidrolasas , específicamente a aquellas que actúan sobre anhídridos ácidos en anhídridos que contienen fósforo. El nombre sistemático de esta clase de enzimas es dUTP nucleotidohidrolasa . Otros nombres de uso común incluyen desoxiuridina-trifosfatasa , dUTPasa , dUTP pirofosfatasa , desoxiuridina 5'-trifosfato nucleotidohidrolasa y desoxiuridina 5'-trifosfatasa . Esta enzima participa en el metabolismo de las pirimidinas .

Esta enzima tiene una doble función: por un lado, elimina el dUTP del conjunto de desoxinucleótidos , lo que reduce la probabilidad de que esta base se incorpore al ADN mediante las ADN polimerasas ; por otro lado, produce el precursor del dTTP, el dUMP . La falta o inhibición de la acción de la dUTPasa provoca alteraciones perjudiciales en el conjunto de nucleótidos, lo que resulta en un aumento del contenido de uracilo en el ADN que activa un ciclo hiperactivo e inútil de reparación del ADN. [ 1 ] [ 2 ]

Estudios estructurales

A finales de 2007, se habían resuelto 48 estructuras para esta clase de enzimas, con códigos de acceso PDB PDB : 1DUC ​,PDB : 1DUD ​,PDB : 1DUN ​,PDB : 1DUP ​,PDB : 1DUT ​,PDB : 1EU5 ​,PDB : 1EUW ​,PDB : 1F7D ​,PDB : 1F7K ​,PDB : 1F7N ​,PDB : 1F7O ​,PDB : 1F7P ​,PDB : 1F7Q ​,PDB : 1F7R ​,PDB : 1MQ7 ​,PDB : 1OGH ​,PDB : 1OGK ​,PDB : 1OGL ​,PDB : 1PKH ​,PDB : 1PKJ ​,PDB : 1PKK ​,PDB : 1RN8 ​,PDB : 1RNJ ​,PDB : 1SEH ​,PDB : 1SIX ​,PDB : 1SJN ​,PDB : 1SLH ​,PDB : 1SM8 ​,PDB : 1SMC ​,PDB : 1SNF ​,PDB : 1SYL ​,PDB : 1VYQ ​,PDB : 1W2Y ​,PDB : 2BSY ​,PDB : 2BT1 ​,PDB : 2CJE ​,PDB : 2D4L, PDB : 2D4M ​,PDB : 2D4N ​,PDB : 2HQU ​,PDB : 2HR6 ​,PDB : 2HRM ​,PDB : 2OKB ​,PDB : 2OKD ​,PDB : 2OKE ​,PDB : 2OL0 ​,PDB : 2OL1​ yPDB : 2PY4 ​.

Existen al menos dos familias estructuralmente distintas de dUTPasas. La estructura cristalina de la dUTPasa humana revela que cada subunidad del trímero de dUTPasa se pliega en un barril beta de ocho hebras con estructura de rollo de gelatina, con las hebras beta C-terminales intercambiadas entre las subunidades . La estructura es similar a la de la enzima de Escherichia coli , a pesar de la baja homología de secuencia entre ambas enzimas . [ 3 ]

La segunda familia tiene un nuevo plegamiento totalmente alfa ; los miembros de esta familia no están relacionados con el plegamiento totalmente beta que se encuentra en las dUTPasas de la mayoría de los organismos . [ 4 ]

Véase también

  • DUT , el gen que codifica esta enzima en los humanos.
  • DnaS o dut , el gen que codifica esta enzima en E. coli.

Referencias

  1. Vertessy BG, Toth J (2009). "Manteniendo el uracilo fuera del ADN" . Accounts of Chemical Research . 42 (1): 97– 106. doi : 10.1021/ar800114w . PMC 2732909. PMID 18837522 .  
  2. Vassylyev DG, Morikawa K (1996). "Exclusión del uracilo del ADN" . Estructura . 4 (12): 1381– 5. doi : 10.1016/S0969-2126(96)00145-1 . PMID 8994964 . 
  3. Mol CD, Harris JM, McIntosh EM, Tainer JA (septiembre de 1996). "Pirofosfatasa de dUTP humana: reconocimiento de uracilo por una horquilla beta y sitios activos formados por tres subunidades separadas" . Structure . 4 (9): 1077–92 . doi : 10.1016/S0969-2126(96)00114-1 . PMID 8805593 . 
  4. Moroz, OV; Harkiolaki, M.; Galperin, MY; Vagin, AA; González-Pacanowska, D.; Wilson, KS (2004). "La estructura cristalina de un complejo de dUTPasa de Campylobacter jejuni con un análogo del sustrato arroja luz sobre el mecanismo y sugiere el "módulo básico" para las d(C/U)TPasas diméricas". Journal of Molecular Biology . 342 (5): 1583– 1597. doi : 10.1016/j.jmb.2004.07.050 . PMID 15364583 . 

Lecturas adicionales

  • Bertani Le.; Haeggmark A.; Reichard P.; Interconversión de fosfatos de desoxiuridina (1963). "Síntesis enzimática de desoxirribonucleótidos. II. Formación" . J. Biol. Chem . 238 (10): 3407–13 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)48681-4 . PMID 14085395 . 
  • Giroir LE, Deutsch WA (1987). "Drosophila deoxiuridina trifosfatasa. Purificación y caracterización" . J. Biol. Chem . 262 (1): 130–4 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)75898-0 . PMID 3025197 . 
  • Greenberg G, Somerville R (1962). "Actividad de la desoxiuridilato quinasa y desoxiuridinetrifosfatasa en Escherichia coli" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 48 (2): 247– 57. Bibcode : 1962PNAS...48..247G . doi : 10.1073 / pnas.48.2.247 . PMC 220766. PMID 13901467 .  
  • Grindey GR, Nichol CA (1971). "Desoxiuridina 5'-trifosfato pirofosfatasa de mamíferos". Biochim. Biophys. Acta . 240 (2): 180– 3. doi : 10.1016/0005-2787(71)90655-1 . PMID 5105331 . 
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