La pirofosfatasa DUTP , también conocida como DUT , es una enzima que en los humanos está codificada por el gen DUT en el cromosoma 15. [ 5 ]
Este gen codifica una enzima esencial del metabolismo de los nucleótidos . La proteína codificada forma una enzima homotrimérica ubicua que hidroliza el dUTP a dUMP y pirofosfato. Esta reacción cumple dos funciones celulares: proporcionar un precursor (dUMP) para la síntesis de nucleótidos de timina necesarios para la replicación del ADN y limitar las reservas intracelulares de dUTP. Los niveles elevados de dUTP conducen a una mayor incorporación de uracilo al ADN, lo que induce una reparación por escisión extensa mediada por la uracilo glicosilasa . Este proceso de reparación, que resulta en la eliminación y reincorporación de dUTP, es contraproducente y conduce a la fragmentación del ADN y la muerte celular . El empalme alternativo de este gen da lugar a diferentes isoformas que se localizan en la mitocondria o el núcleo . Un pseudogén relacionado se encuentra en el cromosoma 19. [ 5 ]
Estructura
En los seres humanos, este gen codifica una enzima homotrimérica con dos isoformas caracterizadas por sus distintas localizaciones subcelulares : la isoforma nuclear (DUT-N) y la isoforma mitocondrial (DUT-M). [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ]
Gene
El análisis Northern blot revela transcritos de ARNm distintos para DUT-N (1,1 kb) y DUT-M (1,4 kb). [ 7 ] Las isoformas se producen por empalme alternativo en diferentes exones 5' , con el primer exón de DUT-N ubicado 767 pares de bases corriente abajo del primer exón de DUT-M. [ 7 ] [ 8 ] Se ha propuesto que la regulación en diferentes promotores explica la expresión diferencial de estas isoformas. [ 7 ]
Proteína
Las formas maduras de DUT-N (22 kDa) y DUT-M (23 kDa) son casi idénticas, excepto por una corta región N-terminal presente en DUT-M. El precursor de DUT-M (31 kDa) contiene una secuencia de direccionamiento mitocondrial rica en arginina de 69 residuos que sufre una escisión postraduccional para efectuar la importación mitocondrial. [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Mientras tanto, la secuencia NLS monopartita es crítica para la función y la localización nuclear de DUT-N, que de otro modo se acumularía en el citoplasma . [ 6 ] [ 8 ] Aunque ambas isoformas contienen la NLS, la secuencia en DUT-M está secuestrada lejos de las carioferinas cognadas . [ 6 ] Los puntos isoeléctricos de DUT-N (6,0) y DUT-M (8,1) corresponden al pH de sus respectivos compartimentos subcelulares. [ 7 ]
DUT es un homotrímero con tres sitios activos formados por cada una de sus tres subunidades. [ 8 ] Típicamente, cada subunidad forma un barril de ocho hebras que intercambia hebras β C-terminales con las otras subunidades para ensamblarse en la estructura del trímero. Además del intercambio de hebras β, estas subunidades interactúan a través de interfaces bimoleculares extendidas y un canal central triple. [ 9 ] Como miembro de la familia de las dUTPasas , DUT requiere la presencia de un ion metálico divalente como Mg2+ para su función enzimática. [ 10 ] DUT-N también contiene un sitio de fosforilación de consenso de la quinasa dependiente de ciclina que se fosforila en la serina como parte de su regulación del ciclo celular. [ 7 ]
Función
DUT es un miembro de la familia dUTPasa, conocida por catalizar la pirofosforálisis de dUTP en dUMP y pirofosfato inorgánico . Esta función contribuye a la replicación y reparación del ADN a través de la biosíntesis de timidilato de novo , ya que el producto dUMP es metilado por la timidilato sintasa (TS) para formar dTMP, que luego se fosforila a dTTP . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 11 ] DUT también es crucial para mantener la integridad del genoma al reducir los niveles celulares de dUTP, previniendo así los ciclos repetidos de incorporación errónea de uracilo en el ADN y las roturas de cadena mediadas por la reparación del ADN que conducirían a la muerte celular . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 10 ] [ 11 ]
Además de sus diferentes localizaciones, las dos isoformas de DUT muestran diferentes patrones de expresión: mientras que DUT-M se expresa constitutivamente, DUT-N está bajo el control del ciclo celular y se regula positivamente de forma notable durante la fase S. [ 6 ] [ 7 ] Estos patrones de expresión se corresponden con sus funciones en el ciclo de replicación del ADN de sus respectivos genomas y, por lo tanto , indican diferentes mecanismos reguladores que afectan a cada isoforma. [ 7 ]
Mecanismo
El ciclo de hidrólisis de dUTP se puede describir en los siguientes cuatro pasos enzimáticos: (i) unión rápida del sustrato, (ii) isomerización del complejo enzima- sustrato a la conformación catalíticamente competente, (iii) hidrólisis del sustrato y (iv) liberación rápida y desordenada de los productos. [ 12 ]
Importancia clínica
Dado que muchos agentes quimioterapéuticos como el 5-fluorouracilo tratan enfermedades neoplásicas , incluyendo cáncer de cabeza y cuello , cáncer de mama y cáncer gastrointestinal , al dirigirse a TS en el metabolismo del timidilato, DUT puede proteger contra los efectos secundarios citotóxicos al contrarrestar la acumulación de dUTP. [ 7 ] [ 8 ] [ 11 ] [ 13 ] [ 14 ] Al mismo tiempo, los altos niveles de DUT-N se han asociado con quimiorresistencia y progresión tumoral más rápida, y por lo tanto, también podrían servir como un marcador pronóstico para la supervivencia general y la respuesta a la quimioterapia. [ 7 ] [ 8 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] De manera similar, DUT está significativamente sobreexpresado en el carcinoma hepatocelular y puede servir como un marcador pronóstico para el cáncer. [ 15 ] Cabe destacar que la expresión de DUT está regulada por el gen supresor de tumores p53 para promover la apoptosis de las células tumorales.<pmid19015155/> Se ha especulado que la expresión y localización anormales de DUT promueven la transformación cancerosa. [ 8 ]
Interacciones
DUT interactúa con dUTP para catalizar su hidrólisis en dUMP y pirofosfato. [ 5 ] E2F y Sp1 potencian la expresión de DUT al unirse a su promotor, mientras que p53 inhibe la transcripción de DUT al unirse a su promotor. También se identificó un posible sitio de unión de NF-κB en el promotor de DUT. [ 14 ]
Referencias
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Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
- Genes en el cromosoma 15 humano