Los elementos promotores distales son secuencias de ADN reguladoras que pueden estar a muchos kilobases de distancia del gen que regulan. [ 1 ]
Pueden ser potenciadores (aumentando la expresión) o silenciadores (disminuyendo la expresión). Actúan uniéndose a proteínas activadoras o represoras ( factores de transcripción ) y el ADN intermedio se curva de tal manera que las proteínas unidas entran en contacto con el promotor central y la ARN polimerasa . [ 1 ]
En el desarrollo de las células T
El desarrollo y la activación de las células T están controlados por la ubicación complementaria de los promotores lck proximales y distales . El entorno generado en ratones Lck-PROX, al ser expuestos al promotor proximal, muestra una proteína lck máxima y un desarrollo tímico normal, mientras que los promotores distales dan lugar a una proteína lck deficiente y niveles tímicos anormales. [ 2 ]
Investigaciones posteriores en la etapa tardía del desarrollo de los timocitos revelan que el promotor distal de Lck con Cre impulsada dará como resultado que el promotor distal del gen lck impulse la expresión de Cre de manera limitada dentro de las células T de tipo innato. Existe una función específica del tipo celular en las células T de tipo innato basada en la Cre impulsada por el promotor distal de lck . [ 3 ]
En el cáncer
Diversos estudios han descubierto anomalías en los promotores distales de las células cancerosas. Por ejemplo, un promotor distal hiperactivo, situado a aproximadamente 1 kilobase del gen MUC5B, contribuye a la expresión atípica de este gen en células de cáncer gástrico. [ 4 ] De manera similar, algunos polimorfismos en el promotor distal de RUNX3 alteran su función, incrementando la actividad del factor de transcripción NF-κB y la expresión del gen IL1B. Estos polimorfismos se han correlacionado con una mayor vulnerabilidad al cáncer gástrico intestinal. [ 5 ]
Otro gen relacionado con el cáncer es EGLN2, ubicado en el cromosoma (región 19q13.2). Este gen codifica una enzima que reconoce residuos de prolina conservados y los hidroxila en la subunidad α del factor inducible por hipoxia (HIF). El polimorfismo funcional consiste en una inserción/deleción de 4 pb en los promotores distales, lo que puede afectar la expresión de EGLN2. [ 6 ]
En la ARN polimerasa II (RNAP2)
Los promotores distales en la ARN polimerasa II se unen a elementos potenciadores y pueden actuar como un marcador de secuencias reguladoras activas. [ 7 ]
Referencias
- 1 2 Roeder RG (noviembre de 1991). "Las complejidades de la iniciación de la transcripción eucariota: regulación del ensamblaje del complejo de preiniciación". Trends in Biochemical Sciences . 16 (11): 402– 408. doi : 10.1016/0968-0004(91)90164-Q . PMID 1776168 .
- ↑ Chiang YJ, Hodes RJ (octubre de 2016). "El desarrollo de las células T está regulado por la función coordinada de los promotores Lck proximales y distales activos en diferentes etapas del desarrollo" . European Journal of Immunology . 46 (10): 2401– 2408. doi : 10.1002/eji.201646440 . PMC 5183457. PMID 27469439 .
- ↑ Figueroa MG, Parker LM, Krol K, Zhao M (septiembre de 2021). " La Cre impulsada por el promotor distal Lck muestra una función específica del tipo celular en las células T de tipo innato" . ImmunoHorizons . 5 (9): 772– 781. doi : 10.4049/immunohorizons.2100079 . PMC 8612026. PMID 34583938 .
- ↑ Perrais, Michaël; Pigny, Pascal; Buisine, Marie-Pierre; Porchet, Nicole; Aubert, Jean-Pierre; Seuningen-Lempire, Isabelle Van (2001-01-01). "Expresión aberrante del gen de la mucina humana MUC5B en carcinoma gástrico y células cancerosas: IDENTIFICACIÓN Y REGULACIÓN DE UN PROMOTOR DISTAL *" . Journal of Biological Chemistry . 276 (18): 15386– 15396. doi : 10.1074/jbc.M010534200 . ISSN 0021-9258 . PMID 11278696 .
- ↑ Lim, Byungho; Ju, Hyoungseok; Kim, Minjin; Kang, Changwon (2011). "La mayor susceptibilidad genética al cáncer gástrico de tipo intestinal se asocia con una mayor actividad del promotor distal de RUNX3" . Cancer . 117 (22): 5161– 5171. doi : 10.1002/cncr.26161 . ISSN 1097-0142 . PMID 21523770 .
- ↑ Zhang, Shulong; Zhu, Kaihua; Zhang, Zuoliang; Wang, Hui; Wang, Xiaolong (octubre de 2019). " Asociación entre un polimorfismo indel dentro del promotor distal de EGLN2 y el riesgo de cáncer: un metaanálisis actualizado" . Molecular Genetics & Genomic Medicine . 7 (10): e00936. doi : 10.1002/mgg3.936 . PMC 6785434. PMID 31414584 .
- ↑ Savic, Daniel; Roberts, Brian S.; Carleton, Julia B.; Partridge, E. Christopher; White, Michael A.; Cohen, Barak A.; Cooper, Gregory M.; Gertz, Jason; Myers, Richard M. (diciembre de 2015). "La unión de la ARN polimerasa II distal al promotor discrimina los sitios de unión activos de los inactivos de la proteína beta de unión al potenciador/CCAAT" . Genome Research . 25 (12): 1791– 1800. doi : 10.1101/gr.191593.115 . ISSN 1549-5469 . PMC 4665001. PMID 26486725 .
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