Articulo de referencia

EFHC2

El dominio EF-hand (C-terminal) que contiene 2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen EFHC2 . [ 5 ] [ 6 ] Gene EFHC2 se localiza en la cadena negativa ( caden...

El dominio EF-hand (C-terminal) que contiene 2 es una proteína que en humanos está codificada por el gen EFHC2 . [ 5 ] [ 6 ]

Gene

EFHC2 se localiza en la cadena negativa ( cadena sentido ) del cromosoma X en p11.3. EFHC2 es uno de los pocos genes con evidencia in vitro que sugiere que escapa a la inactivación del cromosoma X. [ 7 ] EFHC2 abarca 195.796 pares de bases y está adyacente a NDP , el gen que codifica la proteína de la enfermedad de Norrie . Evidencia preliminar basada en estudios de asociación de genoma completo ha vinculado un SNP en el intrón entre los exones 13 y 14 de EFHC2 con la evitación del daño . [ 8 ]

El ARNm que codifica la proteína EFHC2 tiene 3269 pares de bases. Los primeros noventa pares de bases componen la región no traducida 5' y los últimos 1913 pares de bases componen la región no traducida 3' .

Proteína

El esquema muestra las características clave de la proteína codificada por el gen EFHC2 en humanos. "DUF" se refiere a "dominio de función desconocida".

El gen EFHC2 codifica una proteína de 749 aminoácidos que contiene tres dominios DM10 ( InterPro : IPR006602 ) y tres motivos EF-hand de unión a calcio. [ 5 ] 

Se estima que el punto isoeléctrico de EFHC2 es de 7,13 en humanos. [ 9 ] En relación con otras proteínas expresadas en humanos, EFHC2 tiene menos residuos de alanina y un mayor número de residuos de tirosina , y se predice que reside en el citoplasma. [ 10 ] [ 11 ]

Distribución tisular

EFHC2 se expresa ampliamente en el sistema nervioso central , así como en los tejidos periféricos. [ 12 ]

Importancia clínica

Una proteína relacionada, EFHC1, está codificada por un gen en el cromosoma 6. Se ha sugerido que ambas proteínas están involucradas en el desarrollo de la epilepsia [ 6 ] [ 13 ] y que este gen puede estar asociado con el reconocimiento del miedo en individuos con síndrome de Turner . [ 5 ]

Una mutación en EFHC2 que produce una sustitución de serina por tirosina en la posición 430 del aminoácido (S430Y) se ha asociado con epilepsia mioclónica juvenil en una población masculina alemana. [ 6 ] Además, un polimorfismo de un solo nucleótido en EFHC2 se correlaciona con una capacidad reducida de los pacientes con síndrome de Turner para reconocer el miedo en las expresiones faciales; [ 14 ] sin embargo, estos hallazgos siguen siendo controvertidos. [ 15 ]

Conservación en otras especies

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000183690 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000025038 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 3 "Gen Entrez: dominio EF-hand (C-terminal) que contiene 2" . Recuperado el 07-05-2012 .
  6. 1 2 3 Gu W, Sander T, Heils A, Lenzen KP, Steinlein OK (2005). "Un nuevo gen que contiene EF-hand, EFHC2, en Xp11.4: evidencia tentativa de asociación con la epilepsia mioclónica juvenil". Epilepsy Research . 66 ( 1–3 ): 91–8 . doi : 10.1016/j.eplepsyres.2005.07.003 . PMID 16112844. S2CID 25572315 .  
  7. Castagné R, Zeller T, Rotival M, Szymczak S, Truong V, Schillert A, Trégouët DA, Münzel T, Ziegler A, Cambien F, Blankenberg S, Tiret L (noviembre de 2011). "Influencia del sexo y la variabilidad genética en la expresión de genes ligados al cromosoma X en monocitos humanos" . Genomics . 98 (5): 320–6 . doi : 10.1016/j.ygeno.2011.06.009 . PMID 21763416 . 
  8. Blaya C, Moorjani P, Salum GA, Gonçalves L, Weiss LA, Leistner-Segal S, Manfro GG, Smoller JW (marzo de 2009). "Evidencia preliminar de asociación entre EFHC2, un gen implicado en el reconocimiento del miedo, y la evitación del daño". Neuroscience Letters . 452 (1): 84–6 . doi : 10.1016/j.neulet.2009.01.036 . PMID 19429002. S2CID 39604977 .  
  9. Wilkins MR, Gasteiger E, Bairoch A, Sanchez JC, Williams KL, Appel RD, Hochstrasser DF (1999). "Herramientas de identificación y análisis de proteínas en el servidor ExPASy". Protocolos de análisis de proteoma 2D . Métodos en biología molecular. Vol. 112. págs. 531–52 . doi : 10.1385/1-59259-584-7:531 . ISBN   1-59259-584-7. PMID 10027275 . 
  10. Brendel V, Bucher P, Nourbakhsh IR, Blaisdell BE, Karlin S (marzo de 1992). "Métodos y algoritmos para el análisis estadístico de secuencias de proteínas" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (6): 2002– 6. Bibcode : 1992PNAS...89.2002B . doi : 10.1073/pnas.89.6.2002 . PMC 48584. PMID 1549558 .  
  11. Horton P, Nakai K (1997). "Mejor predicción de los sitios de localización celular de proteínas con el clasificador de k vecinos más cercanos". Actas. Conferencia Internacional sobre Sistemas Inteligentes para Biología Molecular . 5 : 147–52 . PMID 9322029 . 
  12. Weiss LA, Purcell S, Waggoner S, Lawrence K, Spektor D, Daly MJ, Sklar P, Skuse D (enero de 2007). "Identificación de EFHC2 como un locus de rasgo cuantitativo para el reconocimiento del miedo en el síndrome de Turner" . Human Molecular Genetics . 16 (1): 107–13 . doi : 10.1093/hmg/ddl445 . PMID 17164267 . 
  13. ^ Suzuki T, Delgado-Escueta AV, Aguan K, Alonso ME, Shi J, Hara Y, Nishida M, Numata T, Medina MT, Takeuchi T, Morita R, Bai D, Ganesh S, Sugimoto Y, Inazawa J, Bailey JN, Ochoa A, Jara-Prado A, Rasmussen A, Ramos-Peek J, Cordova S, Rubio-Donnadieu F, Inoue Y, Osawa M, Kaneko S, Oguni H, Mori Y, Yamakawa K (agosto de 2004). "Las mutaciones en EFHC1 provocan epilepsia mioclónica juvenil". Genética de la Naturaleza . 36 (8): 842– 9. doi : 10.1038/ng1393 . PMID 15258581 . S2CID 32916803 .  
  14. Rodriguez-Revenga L, Madrigal I, Alkhalidi LS, Armengol L, González E, Badenas C, Estivill X, Milà M (mayo de 2007). "Deleción contigua de los genes NDP, MAOA, MAOB y EFHC2 en un paciente con enfermedad de Norrie, retraso psicomotor severo y epilepsia mioclónica". Revista Estadounidense de Genética Médica, Parte A. 143A (9): 916– 20. doi : 10.1002/ajmg.a.31521 . PMID 17431911 . S2CID 36917690 .  
  15. Zinn AR, Kushner H, Ross JL (junio de 2008). "El SNP rs7055196 de EFHC2 no está asociado con el reconocimiento del miedo en el síndrome de Turner 45,X". American Journal of Medical Genetics Part B. 147B ( 4): 507–9 . doi : 10.1002/ajmg.b.30625 . PMID 17948898. S2CID 36643937 .  
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