En biología molecular, el dominio EMI , denominado inicialmente por su presencia en proteínas de la familia EMILIN, es un pequeño dominio proteico rico en cisteína de aproximadamente 75 aminoácidos . El dominio EMI se encuentra con mayor frecuencia en el extremo N-terminal de proteínas extracelulares de metazoos que forman o son compatibles con la formación de multímeros . [ 1 ] Se encuentra asociado con otros dominios, como C1q , tipo laminina EGF , tipo colágeno, FN3 , WAP , ZP o FAS1 . [ 2 ] Se ha sugerido que el dominio EMI podría ser un módulo de interacción proteína-proteína , ya que se encontró que el dominio EMI de EMILIN-1 interactúa con el dominio C1q de EMILIN-2 . [ 1 ]
El dominio EMI posee seis residuos de cisteína altamente conservados , que probablemente forman enlaces disulfuro . Otras características clave del dominio EMI son el patrón CCxG-[WYFH], una posición hidrofóbica justo antes de la primera cisteína (Cys1) del dominio y un grupo de residuos hidrofóbicos entre Cys3 y Cys4. El dominio EMI podría estar formado por dos subdominios, cuyo plegamiento comparte similitudes con el submódulo C-terminal característico de los dominios tipo EGF . [ 2 ]
Entre las proteínas que se sabe que contienen un dominio EMI se incluyen:
- Emilinas de vertebrados , glicoproteínas de la matriz extracelular .
- Multimerinas de vertebrados, glicoproteínas de la matriz extracelular.
- Proteínas de emú vertebrado, que podrían interactuar con varios componentes diferentes de la matriz extracelular y servir para conectar e integrar la función de múltiples moléculas asociadas .
- Beta-IG-H3 de vertebrados .
- Factor 2 específico de osteoblastos de vertebrados (OSF-2).
- Proteínas NEU1 /NG3 de mamíferos .
- Fasciclina de la línea media de Drosophila .
- Ced-1 de Caenorhabditis elegans , un receptor transmembrana que media la fagocitosis de cadáveres celulares .
Referencias
- 1 2 Doliana R, Bot S, Bonaldo P, Colombatti A (noviembre de 2000). "EMI, un nuevo dominio rico en cisteína de las EMILIN y otras proteínas extracelulares, interactúa con los dominios gC1q y participa en la multimerización" . FEBS Lett . 484 (2): 164–8 . doi : 10.1016/S0014-5793( 00 )02140-2 . PMID 11068053. S2CID 38531447 .
- 1 2 Callebaut I, Mignotte V, Souchet M, Mornon JP (enero de 2003). "Los dominios EMI están ampliamente distribuidos y revelan los probables ortólogos de la proteína CED-1 de Caenorhabditis elegans". Biochem. Biophys. Res. Commun . 300 (3): 619– 23. doi : 10.1016/S0006-291X(02)02904-2 . PMID 12507493 .
- dominios de proteínas