EVA (referencia)

EVA fue un proyecto de referencia en funcionamiento continuo para evaluar la calidad y el valor de la predicción de la estructura de proteínas y los métodos de predicción de la estructura secundaria . Los métodos para predecir tanto la estructura secundaria como la estructura terciaria , incluidos el modelado de homología , el enhebrado de proteínas y la predicción del orden de contacto , se compararon con los resultados de las estructuras de proteínas recién resueltas de cada semana depositadas en el Protein Data Bank . El proyecto tenía como objetivo determinar la precisión de predicción que se esperaría de los usuarios no expertos de servidores web de predicción comunes y disponibles públicamente ; esto es similar al proyecto relacionado LiveBench y contrasta con el punto de referencia bianual CASP , que tiene como objetivo identificar la máxima precisión alcanzable por los expertos en predicción.

Referencias

Rost B, Eyrich VA. (2001). EVA: análisis a gran escala de la predicción de la estructura secundaria. Proteins Suppl 5:192-9. PMID 11835497
Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Fiser A, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2001). EVA: evaluación automática continua de servidores de predicción de la estructura de proteínas. Bioinformática 17(12):1242-3. PMID 11751240
Koh IY, Eyrich VA, Marti-Renom MA, Przybylski D, Madhusudhan MS, Eswar N, Grana O, Pazos F, Valencia A, Sali A, Rost B. (2003). EVA: Evaluación de servidores de predicción de la estructura de proteínas. Nucleic Acids Res 31(13):3311-5. PMID 12824315