LiveBench es un proyecto de referencia en funcionamiento continuo para evaluar la calidad de la predicción de la estructura de proteínas y los métodos de predicción de la estructura secundaria . LiveBench se centra principalmente en el modelado de homología y el enhebrado de proteínas , pero también incluye la predicción de la estructura secundaria , comparando la salida del servidor web disponible públicamente con las estructuras de proteínas recientemente depositadas en el Protein Data Bank . Al igual que el proyecto EVA y a diferencia de los experimentos CASP y CAFASP relacionados , LiveBench tiene como objetivo estudiar la precisión de las predicciones que obtendrían los usuarios no expertos de los métodos de predicción disponibles públicamente. Una ventaja importante de LiveBench y EVA sobre los proyectos CASP, que se ejecutan una vez cada dos años, es su conjunto de datos comparativamente grande.
Referencias
- Bujnicki JM, Elofsson A, Fischer D, Rychlewski L. (2001). LiveBench-1: evaluación comparativa continua de servidores de predicción de la estructura de proteínas. Protein Sci 10(2):352-61. PMID 11266621
- Rychlewski L, Fischer D. (2005). LiveBench-8: la evaluación continua a gran escala de la predicción automatizada de la estructura de las proteínas. Protein Sci 14(1):240-5. PMID 15608124
Enlaces externos
- Sitio principal de LiveBench