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Erez Lieberman Aiden

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Erez Lieberman Aiden (nacido en 1980, de soltera Erez Lieberman) es un científico investigador estadounidense activo en múltiples campos relacionados con las matemáticas aplicadas . [ 1 ] Es jefe del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular en la Rama Médica de la Universidad de Texas , profesor de Biociencias en la Universidad Rice y anteriormente fue miembro de la Sociedad de Becarios de Harvard y profesor visitante en Google . Utilizando enfoques matemáticos y computacionales, ha estudiado la evolución en diversos contextos, incluyendo el de redes a través de la teoría de grafos evolutiva y los lenguajes en el campo de la culturomics . Ha publicado artículos científicos en diversas disciplinas.

Lieberman Aiden ha ganado premios como el Premio Lemelson-MIT para Estudiantes y el Premio de la Sociedad Estadounidense de Física a la Investigación de Tesis Doctoral Sobresaliente en Física Biológica. En 2009, Lieberman Aiden fue nombrado uno de los 35 innovadores más destacados menores de 35 años por Technology Review y en 2011 fue uno de los galardonados con el Premio Presidencial a la Trayectoria Temprana para Científicos e Ingenieros .

Primeros años y educación

Lieberman creció en Brooklyn con tres hermanos. Comenzó a programar computadoras a los siete años. [ 3 ] Su padre, Aharon Lieberman, era un empresario tecnológico y propietario de una fábrica en Nueva Jersey . [ 4 ] [ 5 ] De niño, Lieberman Aiden hablaba hebreo y húngaro , por lo que el inglés se convirtió en su tercer idioma. [ 5 ]

Lieberman Aiden estudió matemáticas, física y filosofía en Princeton y obtuvo una maestría en Historia en la Universidad Yeshiva . Posteriormente completó un doctorado conjunto en matemáticas y bioingeniería en la División de Ciencias de la Salud y Tecnología de Harvard-MIT , donde fue asesorado por [ 2 ] Eric Lander y Martin Nowak . [ 6 ]

Investigación y carrera

Lieberman Aiden contribuyó a la fundación de la teoría de grafos evolutivos junto con su director de tesis doctoral, Martin Nowak . [ 7 ] [ 8 ] Desde entonces, ha participado en la investigación de la estructura tridimensional del genoma humano y en el campo de la culturomía .

El modelo de glóbulo fractal ( izquierda ) de la estructura tridimensional del genoma, propuesto por Lieberman Aiden y colaboradores, contrasta con un modelo de equilibrio ( derecha ) (las imágenes pequeñas muestran secciones transversales).

Estructura del genoma en 3D

Lieberman Aiden formó parte de un equipo de científicos de la Facultad de Medicina de la Universidad de Massachusetts y del MIT que sugirió por primera vez que el ADN humano se pliega en un glóbulo fractal en lugar de un glóbulo de equilibrio. [ 4 ] Este hallazgo explica cómo el genoma de cada célula puede compactarse fuertemente sin formar un nudo . Lieberman Aiden y sus colaboradores inventaron una variante de la captura de conformación cromosómica llamada "Hi-C", que produce una medida de probabilidades de contacto en todo el genoma que apunta a una estructura genómica tridimensional. Esta técnica combina la metodología de captura cromosómica existente con la secuenciación de próxima generación , lo que permite una medida de todos contra todos los contactos de la cromatina. [ 9 ]

En 2009, este trabajo fue publicado en la revista Science y apareció como ilustración de portada. [ 10 ] Tras la publicación, Lieberman Aiden declaró: [ 11 ]

Desde hace tiempo sabemos que, a pequeña escala, el ADN es una doble hélice… Pero si la doble hélice no se plegara más, el genoma de cada célula tendría dos metros de longitud. Los científicos no han comprendido del todo cómo se pliega la doble hélice para caber en el núcleo de una célula humana, que tiene apenas una centésima de milímetro de diámetro. Este nuevo enfoque nos permitió investigar precisamente esa cuestión. [ 11 ]

En 2014, fue autor principal de un artículo en Cell que describía un método refinado de Hi-C que su equipo utilizó para describir la organización fundamental del ADN. [ 12 ]

Erez Lieberman Aiden impartiendo una conferencia sobre culturomía en la Universidad de Harvard en 2011.

Culturómica

Lieberman Aiden participó en el análisis de un corpus de aproximadamente 5 millones de libros digitalizados, aplicando técnicas de minería de datos para impulsar el nuevo campo de la culturomía. [ 13 ] [ 14 ] En 2004, Lieberman Aiden participó en un proyecto para digitalizar textos anglosajones , cuyo análisis proporcionó evidencia que respalda la regularización verbal, un proceso por el cual los verbos irregulares se vuelven cada vez más regulares con el tiempo. [ 15 ]

Tras el anuncio de Google Books , Lieberman Aiden se puso en contacto con Peter Norvig, director de investigación de Google, y obtuvo permiso para analizar estadísticamente sus datos. [ 16 ] Su trabajo contribuyó al Google Ngram Viewer , lanzado en diciembre de 2010, que utiliza ideas de la culturomía para producir tendencias históricas normalizadas para cualquier secuencia de letras. [ 13 ] Este proyecto publicó varios hallazgos en la revista Science , incluyendo la dinámica cambiante de la fama y casos de censura literaria durante la Segunda Guerra Mundial . [ 17 ]

Premios y distinciones

En 2008, Lieberman Aiden recibió el Premio Lemelson-MIT para Estudiantes por su trabajo en el iShoe, diseñado para ayudar a las personas mayores con problemas de equilibrio y prevenir caídas que podrían causar lesiones. [ 18 ] [ 19 ] Al año siguiente, el iShoe fue incluido en la lista de "20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina" de Popular Mechanics . [ 20 ] Un año después, Lieberman Aiden fue nombrado uno de los 35 principales innovadores menores de 35 años ( TR35 ) por la revista Technology Review del MIT . [ 21 ]

En 2010, la Sociedad Estadounidense de Física otorgó a Lieberman Aiden el Premio a la Investigación Sobresaliente de Tesis Doctoral en Física Biológica por su tesis titulada "Evolución y el surgimiento de la estructura". [ 22 ] Su tesis doctoral también fue galardonada con el Premio Hertz a la Tesis. [ 23 ] Lieberman Aiden también recibió el Premio al Nuevo Innovador del Director de los NIH y fue nombrado, junto con otros 95 investigadores estadounidenses , como receptor del Premio Presidencial a la Trayectoria Temprana para Científicos e Ingenieros en 2011. [ 24 ]

En 2014, Lieberman Aiden fue nombrado Académico Emérito McNair en el Baylor College of Medicine.

Vida personal

Erez Lieberman se casó con Aviva Presser en 2005; tras la boda, ambos añadieron a sus apellidos "Aiden", que significa Edén en hebreo y, en gaélico, pequeño fuego. [ 13 ] Tienen un hijo llamado Gabriel Galileo, una hija llamada Maayan Amara y otro niño llamado Judah Avraham. [ 4 ] [ 10 ] Además de sus intereses científicos, Lieberman Aiden participó en una colaboración de arte moderno con Nicholas Kahn y Richard Selesnick que se exhibió en galerías de Estados Unidos y Europa. [ 18 ]

Lieberman Aiden y su esposa fundaron Bears Without Borders, una organización sin fines de lucro que distribuye juguetes de peluche al mundo en desarrollo. [ 6 ] [ 13 ]

Referencias

  1. 1 2 Publicaciones de Erez Lieberman Aiden indexadas por Google Académico
  2. 1 2 Erez Lieberman Aiden en el Proyecto de Genealogía Matemática
  3. Karagianis, Liz (2010). "Celebrando la innovación" . Spectrvm . MIT . Recuperado el 4 de enero de 2013 .
  4. 1 2 3 Yong, Ed (8 de junio de 2011). "El hombre del Renacimiento: Cómo convertirse en científico una y otra vez" . Not Exactly Rocket Science . Discover Magazine. Archivado del original el 1 de enero de 2013. Recuperado el 3 de enero de 2013 .
  5. 1 2 Kaiser, Jocelyn (6 de junio de 2012). "Hombre del Renacimiento" . Princeton Alumni Weekly . Princeton . Recuperado el 4 de enero de 2013 .
  6. 1 2 Barth, Amy (24 de marzo de 2010). "5 preguntas para el hombre que puso las tres D en el ADN" . Discover Magazine . Recuperado el 4 de enero de 2013 .
  7. Forrest, Sara. "El pionero de la computación Erez Lieberman explica cómo evoluciona la web y el spam" . Computerworld . Archivado del original el 2 de marzo de 2007. Consultado el 4 de enero de 2013 .
  8. Lieberman, E.; Hauert, C.; Nowak, MA (2005). "Dinámica evolutiva en grafos". Nature . 433 (7023): 312– 316. Bibcode : 2005Natur.433..312L . CiteSeerX 10.1.1.398.4515 . doi : 10.1038/nature03204 . PMID 15662424 . S2CID 4386820 .   
  9. ^ Lieberman-Aiden, E.; Van Berkum, Países Bajos; Williams, L.; Imakaev, M.; Ragoczy, T.; Contando, A.; Amit, yo; Lajoie, BR; Sabo, PJ; Dorschner, MO; Sandstrom, R.; Bernstein, B.; Bender, MA; Groudine, M.; Gnürke, A.; Stamatoyannopoulos, J .; Mirny, Luisiana; Lander, ES; Dekker, J. (2009). "El mapeo completo de interacciones de largo alcance revela principios plegables del genoma humano" . Ciencia . 326 (5950): 289– 293. Bibcode : 2009Sci...326..289L . doi : 10.1126/ciencia.1181369 . PMC 2858594 . PMID 19815776 .  
  10. 1 2 Keim, Brandom (20 de agosto de 2012). "El biofísico más conectado del mundo" . Wired . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  11. 1 2 "Científico de UMMS ayuda a descifrar la estructura 3D del genoma humano" . Focus UMMS . 12 (4). Noviembre de 2009. Archivado del original el 26 de enero de 2013. Recuperado el 29 de enero de 2013 .
  12. Rao, SSP; Huntley, MH; Durand, NC; Stamenova, EK; Bochkov, ID; Robinson, JT; Sanborn, AL; Machol, I.; Omer, AD; Lander, ES; Aiden, EL (2014). "Un mapa 3D del genoma humano con resolución de kilobases revela principios del bucle de cromatina" . Cell . 159 ( 7): 1665– 1680. doi : 10.1016/j.cell.2014.11.021 . PMC 5635824. PMID 25497547 .  
  13. 1 2 3 4 Hand, Eric (2011). "Culturomics: Word play" . Nature . 474 (7352): 436– 440. doi : 10.1038/474436a . PMID 21697925 . 
  14. Michel, J. -B.; Shen, YK; Aiden, AP; Veres, A.; Gray, MK; Google Books, JP; Pickett, D.; Hoiberg, D.; Clancy, P.; Norvig, J.; Orwant, S.; Pinker, MA; Nowak, EL; Aiden, EL (2011). "Análisis cuantitativo de la cultura utilizando millones de libros digitalizados" . Science . 331 (6014): 176– 182. Bibcode : 2011Sci...331..176M . doi : 10.1126 /science.1199644 . PMC 3279742. PMID 21163965 .  {{cite journal}}: |last6=tiene nombre genérico ( ayuda )
  15. Holmes, Bob (11 de octubre de 2007). "Las 'mutaciones' del lenguaje afectan a las palabras menos usadas" . New Scientist . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  16. Cohen, Patricia (16 de diciembre de 2010). "En 500 mil millones de palabras, una nueva ventana a la cultura" . New York Times . Consultado el 7 de enero de 2013 .
  17. Hotz, Robert Lee (17 de diciembre de 2010). "Se lanza la World Wide Web" . The Wall Street Journal . Consultado el 29 de enero de 2013 .
  18. 1 2 "Erez Lieberman-Aiden: Ganador del Premio Estudiantil Lemelson-MIT 2010" . Lemelson-MIT. 2010. Archivado del original el 10 de marzo de 2010. Recuperado el 4 de enero de 2013 .
  19. ScienceDaily (24 de julio de 2008). ¿Problemas de equilibrio? Ponte el IShoe , Science Daily .
  20. Wenner, Melinda (18 de diciembre de 2009). "20 nuevos avances biotecnológicos que cambiarán la medicina" . Popular Mechanics . Consultado el 4 de enero de 2013 .
  21. ^ MIT (10 de septiembre de 2009). 2009 Jóvenes innovadores menores de 35 años, Erez Lieberman-Aiden, 29 años, Universidad de Harvard/MIT. , Revisión de tecnología .
  22. "Premio a la mejor investigación de tesis doctoral en física biológica" . Sociedad Estadounidense de Física. 2010. Consultado el 4 de enero de 2013 .
  23. Fundación Hertz. "Becarios de la Fundación Hertz: Erez Lieberman Aiden" . Archivado del original el 2 de noviembre de 2014. Consultado el 23 de enero de 2013 .
  24. Oficina del Secretario de Prensa (23 de julio de 2012). "El presidente Obama honra a científicos jóvenes destacados" . whitehouse.gov . Recuperado el 29 de enero de 2013 a través de los Archivos Nacionales .