En genética de poblaciones , la fórmula de muestreo de Ewens describe las probabilidades asociadas con los recuentos de cuántos alelos diferentes se observan una cantidad determinada de veces en la muestra .
Definición
La fórmula de muestreo de Ewens, introducida por Warren Ewens , establece que bajo ciertas condiciones (especificadas a continuación), si se toma una muestra aleatoria de n gametos de una población y se clasifica según el gen en un locus particular , entonces la probabilidad de que haya 1 alelos representados una vez en la muestra, y 2 alelos representados dos veces, y así sucesivamente, es
para algún número positivo θ que representa la tasa de mutación de la población , siempre que sea una secuencia de números enteros no negativos tales que
La frase "en determinadas condiciones" utilizada anteriormente se hace precisa mediante los siguientes supuestos:
- El tamaño de la muestra n es pequeño en comparación con el tamaño de toda la población; y
- La población está en equilibrio estadístico bajo mutación y deriva genética y el papel de la selección en el locus en cuestión es insignificante; y
- Cada alelo mutante es nuevo.
Se trata de una distribución de probabilidad en el conjunto de todas las particiones del entero n . Entre los probabilistas y estadísticos se la suele denominar distribución multivariante de Ewens .
Propiedades matemáticas
Cuando θ = 0, la probabilidad de que todos los n genes sean iguales es 1. Cuando θ = 1, la distribución es precisamente la de la partición entera inducida por una permutación aleatoria uniformemente distribuida . Como θ → ∞, la probabilidad de que no haya dos genes iguales se acerca a 1.
Esta familia de distribuciones de probabilidad disfruta de la propiedad de que si después de tomar la muestra de n , se eligen m de los n gametos sin reemplazo, entonces la distribución de probabilidad resultante en el conjunto de todas las particiones del entero más pequeño m es exactamente lo que daría la fórmula anterior si m se pusiera en lugar de n .
La distribución de Ewens surge de forma natural del proceso de restauración chino .
Véase también
- Distribución de mesas en restaurantes chinos
- Teoría coalescente
- Teoría neutral unificada de la biodiversidad
- Biomatemáticas
Notas
- Warren Ewens, "La teoría de muestreo de alelos selectivamente neutrales", Theoretical Population Biology , volumen 3, páginas 87–112, 1972.
- H. Crane. (2016) "The Ubiquitous Ewens Sampling Formula", Statistical Science , 31:1 (febrero de 2016). Este artículo presenta una serie de siete artículos sobre el muestreo de Ewens en un número especial de la revista.
- JFC Kingman, "Particiones aleatorias en genética de poblaciones", Actas de la Royal Society de Londres, Serie B, Ciencias Matemáticas y Físicas , volumen 361, número 1704, 1978.
- S. Tavare y WJ Ewens, "La distribución multivariada de Ewens" (1997, Capítulo 41 de la referencia siguiente).
- NL Johnson, S. Kotz y N. Balakrishnan (1997) Distribuciones multivariadas discretas , Wiley. ISBN 0-471-12844-9 .