Articulo de referencia

Fórmula de muestreo de Ewens

En genética de poblaciones , la fórmula de muestreo de Ewens describe las probabilidades asociadas con los recuentos de cuántos alelos diferentes se observan una cantidad determ...

En genética de poblaciones , la fórmula de muestreo de Ewens describe las probabilidades asociadas con los recuentos de cuántos alelos diferentes se observan una cantidad determinada de veces en la muestra .

Definición

La fórmula de muestreo de Ewens, introducida por Warren Ewens , establece que bajo ciertas condiciones (especificadas a continuación), si se toma una muestra aleatoria de n gametos de una población y se clasifica según el gen en un locus particular , entonces la probabilidad de que haya 1 alelos representados una vez en la muestra, y 2 alelos representados dos veces, y así sucesivamente, es

Pr ( a 1 , , a norte ; θ ) = norte ! θ ( θ + 1 ) ( θ + norte 1 ) yo = 1 norte θ a yo yo a yo a yo ! , {\displaystyle \operatorname {Pr} (a_{1},\puntos ,a_{n};\theta )={n! \sobre \theta (\theta +1)\cdots (\theta +n-1)}\prod _{j=1}^{n}{\theta ^{a_{j}} \sobre j^{a_{j}}a_{j}!},}

para algún número positivo θ que representa la tasa de mutación de la población , siempre que sea una secuencia de números enteros no negativos tales que a 1 , , a norte {\displaystyle a_{1},\ldots ,a_{n}}

a 1 + 2 a 2 + 3 a 3 + + norte a norte = i = 1 norte i a i = norte . {\displaystyle a_{1}+2a_{2}+3a_{3}+\cdots +na_{n}=\sum _{i=1}^{n}ia_{i}=n.\,}

La frase "en determinadas condiciones" utilizada anteriormente se hace precisa mediante los siguientes supuestos:

  • El tamaño de la muestra n es pequeño en comparación con el tamaño de toda la población; y
  • La población está en equilibrio estadístico bajo mutación y deriva genética y el papel de la selección en el locus en cuestión es insignificante; y
  • Cada alelo mutante es nuevo.

Se trata de una distribución de probabilidad en el conjunto de todas las particiones del entero n . Entre los probabilistas y estadísticos se la suele denominar distribución multivariante de Ewens .

Propiedades matemáticas

Cuando θ  = 0, la probabilidad de que todos los n genes sean iguales es 1. Cuando θ  = 1, la distribución es precisamente la de la partición entera inducida por una permutación aleatoria uniformemente distribuida . Como θ  → ∞, la probabilidad de que no haya dos genes iguales se acerca a 1.

Esta familia de distribuciones de probabilidad disfruta de la propiedad de que si después de tomar la muestra de n , se eligen m de los n gametos sin reemplazo, entonces la distribución de probabilidad resultante en el conjunto de todas las particiones del entero más pequeño m es exactamente lo que daría la fórmula anterior si m se pusiera en lugar de  n .

La distribución de Ewens surge de forma natural del proceso de restauración chino .

Véase también

Notas

  • Warren Ewens, "La teoría de muestreo de alelos selectivamente neutrales", Theoretical Population Biology , volumen 3, páginas 87–112, 1972.
  • H. Crane. (2016) "The Ubiquitous Ewens Sampling Formula", Statistical Science , 31:1 (febrero de 2016). Este artículo presenta una serie de siete artículos sobre el muestreo de Ewens en un número especial de la revista.
  • JFC Kingman, "Particiones aleatorias en genética de poblaciones", Actas de la Royal Society de Londres, Serie B, Ciencias Matemáticas y Físicas , volumen 361, número 1704, 1978.
  • S. Tavare y WJ Ewens, "La distribución multivariada de Ewens" (1997, Capítulo 41 de la referencia siguiente).
  • NL Johnson, S. Kotz y N. Balakrishnan (1997) Distribuciones multivariadas discretas , Wiley. ISBN  0-471-12844-9 .
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