Articulo de referencia

FOXRED1

La proteína 1 que contiene el dominio oxidorreductasa dependiente de FAD (FOXRED1), también conocida como H17 o FP634 , es una enzima que en humanos está codificada por el gen F...

La proteína 1 que contiene el dominio oxidorreductasa dependiente de FAD (FOXRED1), también conocida como H17 o FP634 , es una enzima que en humanos está codificada por el gen FOXRED1 . [ 5 ] [ 6 ] FOXRED1 es una oxidorreductasa y chaperona molecular específica del complejo I involucrada en el ensamblaje y estabilización de la NADH deshidrogenasa (ubiquinona), también conocida como complejo I , que se encuentra en la membrana interna mitocondrial y es el mayor de los cinco complejos de la cadena de transporte de electrones . [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] Las mutaciones en FOXRED1 se han asociado con el síndrome de Leigh [ 10 ] [ 11 ] y la encefalopatía mitocondrial de inicio infantil . [ 8 ]

Estructura

FOXRED1 se localiza en el brazo q del cromosoma 11 en la posición 14.2 y tiene 12 exones . [ 5 ] El gen FOXRED1 produce una proteína de 53.8 kDa compuesta por 486 aminoácidos . [ 12 ] [ 13 ] Se han observado variantes de transcripción con empalme alternativo para este gen. [ 5 ]

FOXRED1 contiene un dominio de unión a FAD oxidorreductasa y es homólogo a las proteínas de unión a FAD dimetilglicina deshidrogenasa , sarcosina deshidrogenasa , L-pipecol ácido oxidasa, sarcosina oxidasa peroxisomal y subunidad reguladora de la piruvato deshidrogenasa . Las similitudes estructurales de FOXRED1 con la sarcosina oxidasa (MSOX) predicen que los residuos de tirosina Y410 y Y411 forman el sitio de unión covalente de FAD. Además, se cree que una fracción fenilo en p.  359 es crítica para la función. [ 8 ] [ 10 ] Finalmente, FOXRED1 es una proteína dirigida a la matriz que se cree que se importa a través de la presencia de un potencial de membrana mitocondrial en lugar de a través de una señal de direccionamiento escindible. [ 10 ] Sin embargo, otros sugieren que contiene una secuencia de localización mitocondrial N-terminal de 23 aminoácidos y que esta secuencia se escinde al entrar para formar la proteína madura. [ 8 ]

Función

El gen FOXRED1 codifica una enzima que se localiza en las mitocondrias y que ayuda en el ensamblaje y estabilización de la NADH:ubiquinona oxidorreductasa, una enzima grande multisubunitaria en la cadena respiratoria mitocondrial . [ 5 ] [ 10 ] La NADH:ubiquinona oxidorreductasa (complejo I) está involucrada en varias actividades fisiológicas en la célula, incluido el transporte de metabolitos y la síntesis de ATP . El complejo I cataliza la transferencia de electrones de NADH a ubiquinona (coenzima Q) en el primer paso de la cadena respiratoria mitocondrial, lo que resulta en la translocación de protones a través de la membrana mitocondrial interna . [ 14 ] La proteína codificada por FOXRED1 es una oxidorreductasa y chaperona molecular específica del complejo I. Desempeña un papel en las etapas intermedias y tardías del ensamblaje intermedio del complejo I y es importante para el ensamblaje, la estabilización y la función del complejo I. Se propone que FOXRED1 funciona en un complejo con la subunidad central NDUFS3, así como con las subunidades accesorias NDUFA5 , NDUFA10 , NDUFB10 y NDUFS5 . [ 10 ]

Importancia clínica

Las mutaciones en FOXRED1 pueden provocar deficiencias mitocondriales y trastornos asociados. Un trastorno de la cadena respiratoria mitocondrial puede causar una amplia gama de manifestaciones clínicas, desde una enfermedad neonatal letal hasta trastornos neurodegenerativos de inicio en la edad adulta . Los fenotipos incluyen macrocefalia con leucodistrofia progresiva, encefalopatía no específica , cardiomiopatía , miopatía , enfermedad hepática , síndrome de Leigh , neuropatía óptica hereditaria de Leber y algunas formas de enfermedad de Parkinson . [ 9 ] Las mutaciones patogénicas de FOXRED1 han incluido c.1054C>T; p.R352W, c.694C>T; p.Q232X y c.1289A>G; p.N430S. Los síntomas debidos a estas mutaciones han incluido acidosis láctica , cardiomiopatía hipertrófica y atrofia óptica . Clínicamente, estas variantes se han asociado con el síndrome de Leigh [ 10 ] [ 11 ] y la encefalopatía mitocondrial de inicio infantil. [ 8 ] La supervivencia con mutaciones en FOXRED1 parece ser más común que en otras deficiencias del complejo I y la sobreexpresión de formas mutantes puede conducir a la recuperación de la actividad del complejo I, lo que indica que la actividad de FOXRED1 puede compensarse hasta cierto punto. [ 10 ]

Interacciones

FOXRED1 co-inmunoprecipita con las subunidades del complejo I NDUFB10 , NDUFS5 , NDUFA10 , NDUFA8 , NDUFS3 y NDUFA5 y puede estar asociado con la maquinaria de importación Tom20, Tom22 y MPP, así como con las chaperonas mtHsp70, Hsp60 y Hsp10 . [ 10 ] Además de los co-complejos y las posibles asociaciones, se ha confirmado que FOXRED1 tiene interacciones proteína-proteína con EXOSC10 . [ 15 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000110074 Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000039048 Ensembl , mayo de 2017
  3. "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 3 4 "Gen Entrez: FOXRED1 Dominio oxidorreductasa dependiente de FAD que contiene 1" .
  6. Oh JJ, Grosshans DR, Wong SG, Slamon DJ (octubre de 1999). "Identificación de genes expresados ​​diferencialmente asociados con la sobreexpresión de HER-2/neu en células de cáncer de mama humano" . Nucleic Acids Research . 27 (20): 4008– 4017. doi : 10.1093/nar/27.20.4008 . PMC 148668. PMID 10497265 .  
  7. Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). "18". Fundamentos de bioquímica: la vida a nivel molecular (4.ª ed.). Hoboken, NJ: Wiley. pp. 581–620 . ISBN   978-0-470-54784-7.
  8. 1 2 3 4 5 Fassone E, Duncan AJ, Taanman JW, Pagnamenta AT, Sadowski MI, Holand T, et al. (diciembre de 2010). "FOXRED1, que codifica una chaperona molecular específica del complejo I de la oxidorreductasa dependiente de FAD, está mutada en la encefalopatía mitocondrial de inicio infantil" . Human Molecular Genetics . 19 (24): 4837– 4847. doi : 10.1093 / hmg/ddq414 . PMC 4560042. PMID 20858599 .   
  9. 1 2 "FOXRED1 - Proteína 1 que contiene el dominio oxidorreductasa dependiente de FAD - Homo sapiens (Humano) - Gen y proteína FOXRED1" . uniprot.org . Consultado el 27 de julio de 2018 .
  10. 1 2 3 4 5 6 7 8 Formosa LE, Mimaki M, Frazier AE, McKenzie M, Stait TL, Thorburn DR, et al. (mayo de 2015). "Caracterización de FOXRED1 mitocondrial en el ensamblaje del complejo I de la cadena respiratoria" . Human Molecular Genetics . 24 (10): 2952– 2965. doi : 10.1093/hmg/ddv058 . hdl : 10536/DRO/DU:30112237 . PMID 25678554 .  
  11. 1 2 Calvo SE, Tucker EJ, Compton AG, Kirby DM, Crawford G, Burtt NP, et al. (octubre de 2010). "La secuenciación de alto rendimiento y agrupada identifica mutaciones en NUBPL y FOXRED1 en la deficiencia del complejo I humano" . Nature Genetics . 42 (10): 851– 858. doi : 10.1038/ng.659 . PMC 2977978. PMID 20818383 .   
  12. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, et al. (octubre de 2013). " Integración de la biología del proteoma cardíaco y la medicina mediante una base de conocimientos especializada" . Circulation Research . 113 (9): 1043– 1053. doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . PMC 4076475. PMID 23965338 .   
  13. Yao D. "Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB) — Información sobre proteínas" . amino.heartproteome.org . Consultado el 27 de julio de 2018 .
  14. Referencia GH. "Gen NDUFAF1" . Genetics Home Reference . Archivado del original el 16 de febrero de 2017. Consultado el 27 de julio de 2018 .
  15. "Se encontraron 7 interacciones binarias para el término de búsqueda FOXRED1" . Base de datos de interacciones moleculares IntAct . EMBL-EBI . Consultado el 25 de agosto de 2018 .

Lecturas adicionales

  • Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (noviembre de 2000). "Clonación de ADN mediante recombinación sitio-específica in vitro" . Genome Research . 10 (11): 1788– 1795. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .  
  • Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (septiembre de 2000). "Localización subcelular sistemática de nuevas proteínas identificadas mediante secuenciación de ADNc a gran escala" . EMBO Reports . 1 (3): 287– 292. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .  
  • Lehner B, Sanderson CM (julio de 2004). " Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano" . Genome Research . 14 (7): 1315– 1323. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147. PMID 15231747 .  
  • Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, et  al. (octubre de 2004). " Del ORFeoma a la biología: una vía de genómica funcional" . Genome Research . 14 (10B): 2136–2144 . doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930. PMID 15489336 .  
  • Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, et  al. (enero de 2006). " La base de datos LIFEdb en 2006" . Nucleic Acids Research . 34 (número especial sobre bases de datos): D415– D418. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501. PMID 16381901 .  

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .