Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

GABARAP

La proteína asociada al receptor del ácido gamma-aminobutírico es una proteína que en los humanos está codificada por el gen GABARAP . [ 5 ] Función Los receptores del ácido gam...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La proteína asociada al receptor del ácido gamma-aminobutírico es una proteína que en los humanos está codificada por el gen GABARAP . [ 5 ]

Función

Los receptores del ácido gamma-aminobutírico A [receptores GABA(A)] son ​​canales de cloruro regulados por ligando que median la neurotransmisión inhibitoria. Este gen codifica la proteína asociada al receptor GABA(A), que presenta una alta carga positiva en su extremo N-terminal y comparte similitud de secuencia con la cadena ligera 3 de las proteínas 1A y 1B asociadas a microtúbulos. Esta proteína agrupa los receptores de neurotransmisores al mediar la interacción con el citoesqueleto. [ 6 ]

Además, GABARAP tiene una función importante en la autofagia mediada por autofagosomas , ya que es crucial para la formación de autofagosomas y el secuestro de carga citosólica en vesículas de doble membrana, lo que conduce a la degradación posterior tras la fusión con los lisosomas. [ 7 ] Adicionalmente, GABARAP puede mediar la autofagia selectiva porque se une a los llamados receptores autofágicos (por ejemplo, p62, NBr1), que se unen y reclutan carga específica.

Interacciones

Se ha demostrado que GABARAP interactúa con TFRC , [ 8 ] ULK1 [ 9 ] [ 10 ] y GABRG2 . [ 5 ] [ 11 ] [ 12 ] Se ha derivado computacionalmente una estructura ligada para GABARAP a GABRG2 consistente con las observaciones experimentales. [ 13 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000170296 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000018567 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Wang H, Bedford FK, Brandon NJ, Moss SJ, Olsen RW (enero de 1999). "La proteína asociada al receptor GABA(A) vincula los receptores GABA(A) y el citoesqueleto". Nature . 397 ( 6714): 69– 72. doi : 10.1038/16264 . PMID 9892355. S2CID 204990449 .  
  6. ↑ "Entrez Gene: GABARAP Proteína asociada al receptor GABA(A)" .
  7. ↑ Szalai P, Hagen LK, Sætre F, Luhr M, Sponheim M, Øverbye A, Mills IG, Seglen PO, Engedal N (2015). "El secuestro autofágico masivo de carga citosólica es independiente de LC3, pero requiere GABARAPs". Experimental Cell Research . 333 (1): 21– 38. doi : 10.1016/j.yexcr.2015.02.003 . PMID 25684710 . 
  8. ↑ Green F, O'Hare T, Blackwell A, Enns CA (mayo de 2002). "Asociación del receptor de transferrina humana con GABARAP" ( PDF) . FEBS Letters . 518 ( 1–3 ): 101–106 . doi : 10.1016/S0014-5793(02)02655-8 . PMID 11997026. S2CID 29391940 .  
  9. ↑ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Mapeo a gran escala de interacciones proteína-proteína humanas mediante espectrometría de masas" . Biología de sistemas moleculares . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .  
  10. ↑ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (dic. 2000). "Interacción de la quinasa similar a Unc-51 y las proteínas relacionadas con la cadena ligera 3 de la proteína asociada a microtúbulos en el cerebro: posible papel del transporte vesicular en la elongación axonal". Brain Research. Molecular Brain Research . 85 ( 1–2 ): 1–12 . doi : 10.1016/S0169-328X(00)00218-7 . PMID 11146101 . 
  11. ↑ Nymann-Andersen J, Wang H, Chen L, Kittler JT, Moss SJ, Olsen RW (marzo de 2002). "Especificidad de subunidades y dominio de interacción entre la proteína asociada al receptor GABA(A) (GABARAP) y los receptores GABA(A)". Journal of Neurochemistry . 80 (5): 815– 823. doi : 10.1046 / j.0022-3042.2002.00762.x . PMID 11948245. S2CID 38049055 .  
  12. ↑ Coyle JE, Qamar S, Rajashankar KR, Nikolov DB (enero de 2002). "Estructura de GABARAP en dos conformaciones: implicaciones para la localización del receptor GABA(A) y la unión a la tubulina" . Neuron . 33 ( 1): 63–74 . doi : 10.1016/S0896-6273(01)00558-X . PMID 11779480. S2CID 14487823 .  
  13. ↑ Irwin BW, Vukovic S, Payne MC, ElGamacy M, Chau PL (dic. 2018). "Predicción de la interacción de GABARAP con el receptor GABA tipo A" . Proteins . 86 ( 12): 1251– 1264. doi : 10.1002/prot.25589 . PMC 6492159. PMID 30218455 .  

Lecturas adicionales

  • Kanematsu T, Hirata M (abril de 2002). " [ Análisis de la interacción proteína-proteína con especial referencia a PRIP-1 ] " . Nihon Yakurigaku Zasshi. Folia Pharmacologica Japonica . 119 (4): 241–6 . doi : 10.1254/fpj.119.241 . PMID 11979730 . 
  • Paz Y, Elazar Z, Fass D (agosto de 2000). "Estructura de GATE-16, modulador del transporte de membrana y ortólogo de mamíferos del factor de autofagocitosis Aut7p" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (33): 25445– 25450. doi : 10.1074/jbc.C000307200 . PMID 10856287 . 
  • Wang H, Olsen RW (agosto de 2000). "La unión de la proteína asociada al receptor GABA(A) (GABARAP) a los microtúbulos y microfilamentos sugiere la participación del citoesqueleto en la interacción del receptor GABARAP-GABA(A)" . Journal of Neurochemistry . 75 (2): 644– 655. doi : 10.1046/j.1471-4159.2000.0750644.x . PMID 10899939. S2CID 86634862 .  
  • Kneussel M, Haverkamp S, Fuhrmann JC, Wang H, Wässle H, Olsen RW, Betz H (julio de 2000). "La proteína GABARAP asociada al receptor de ácido gamma-aminobutírico tipo A (GABAAR) interactúa con la gefirina, pero no participa en el anclaje del receptor en la sinapsis" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (15): 8594–8599 . Bibcode : 2000PNAS...97.8594K . doi : 10.1073/pnas.97.15.8594 . PMC 26993. PMID 10900017 .  
  • Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R, Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (agosto de 2000). "Perfil de expresión génica en el eje hipotálamo-hipófisis-suprarrenal humano y clonación de ADNc de longitud completa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (17): 9543– 9548. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .  
  • Chen L, Wang H, Vicini S, Olsen RW (octubre de 2000). "La proteína asociada al receptor del ácido gamma-aminobutírico tipo A (GABAA) (GABARAP) promueve la agrupación del receptor GABAA y modula la cinética del canal" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 97 (21): 11557– 11562. Bibcode : 2000PNAS...9711557C . doi : 10.1073 / pnas.190133497 . PMC 17239. PMID 10984509 .  
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente no definidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+" . Genome Research . 10 (10): 1546–1560 . doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934. PMID 11042152 .  
  • Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (dic. 2000). "Interacción de la quinasa similar a Unc-51 y las proteínas relacionadas con la cadena ligera 3 de la proteína asociada a microtúbulos en el cerebro: posible papel del transporte vesicular en la elongación axonal". Brain Research. Molecular Brain Research . 85 ( 1–2 ): 1–12 . doi : 10.1016/S0169-328X(00)00218-7 . PMID 11146101 . 
  • Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (junio de 2001). "Clonación, patrones de expresión y localización cromosómica de tres homólogos humanos y dos de ratón de la proteína asociada al receptor GABA(A)". Genomics . 74 (3): 408– 413. doi : 10.1006/geno.2001.6555 . PMID 11414770 . 
  • Kittler JT, Rostaing P, Schiavo G, Fritschy JM, Olsen R, Triller A, Moss SJ (julio de 2001). "La distribución subcelular de GABARAP y su capacidad para interactuar con NSF sugieren un papel para esta proteína en el transporte intracelular de los receptores GABA(A)". Neurociencias moleculares y celulares . 18 (1): 13– 25. doi : 10.1006/mcne.2001.1005 . PMID 11461150. S2CID 43244403 .  
  • Stangler T, Mayr LM, Dingley AJ, Luge C, Willbold D (octubre de 2001). "Asignaciones de resonancia 1H, 13C y 15N específicas de secuencia de la proteína asociada al receptor GABA humano". Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 183–4 . doi : 10.1023/A:1012416810974 . PMID 11727985. S2CID 31757286 .  
  • Harris R, McAlister MS, Sankar A, Phelan JP, Moss SJ, Keep NH, Driscoll PC (octubre de 2001). "Asignaciones de resonancia de 1H, 13C y 15N del esqueleto para una proteína de 14 kD, proteína asociada al receptor GABA(A) (GABARAP)". Journal of Biomolecular NMR . 21 (2): 185–6 . doi : 10.1023/A:1012473609468 . PMID 11727986. S2CID 82224217 .  
  • Knight D, Harris R, McAlister MS, Phelan JP, Geddes S, Moss SJ, Driscoll PC, Keep NH (febrero de 2002). "La estructura cristalina por rayos X y las supuestas propiedades de unión de péptidos derivados de ligandos de la proteína asociada al receptor del ácido gamma-aminobutírico tipo A" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5556– 5561. doi : 10.1074/jbc.M109753200 . PMID 11729197 . 
  • Coyle JE, Qamar S, Rajashankar KR, Nikolov DB (enero de 2002). "Estructura de GABARAP en dos conformaciones: implicaciones para la localización del receptor GABA(A) y la unión a la tubulina" . Neuron . 33 ( 1): 63–74 . doi : 10.1016/S0896-6273(01)00558-X . PMID 11779480. S2CID 14487823 .  
  • Tanida I, Tanida-Miyake E, Komatsu M, Ueno T, Kominami E (abril de 2002). "El homólogo humano Apg3p/Aut1p es una enzima E2 auténtica para múltiples sustratos, GATE-16, GABARAP y MAP-LC3, y facilita la conjugación de hApg12p a hApg5p" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13739–13744 . doi : 10.1074/jbc.M200385200 . PMID 11825910 . 
  • Stangler T, Mayr LM, Willbold D (abril de 2002). "Estructura en solución de la proteína GABARAP asociada al receptor GABA(A) humano: implicaciones para la función biológica y su regulación" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (16): 13363–13366 . doi : 10.1074/jbc.C200050200 . PMID 11875056 . 
  • Kouno T, Miura K, Kanematsu T, Shirakawa M, Hirata M, Kawano K (enero de 2002). "Asignaciones de resonancia 1H, 13C y '5N de GABARAP, proteína asociada al receptor GABAA". Revista de RMN biomolecular . 22 (1): 97– 98. doi : 10.1023/A:1013884402033 . PMID 11885988 . S2CID 82980835 .  
  • Tanida I, Tanida-Miyake E, Nishitani T, Komatsu M, Yamazaki H, Ueno T, Kominami E (marzo de 2002). "La Apg12p murina tiene una preferencia de sustrato por la Apg7p murina sobre tres homólogos de Apg8p". Biochemical and Biophysical Research Communications . 292 (1): 256– 262. doi : 10.1006/bbrc.2002.6645 . PMID 11890701 . 
  • Nymann-Andersen J, Wang H, Chen L, Kittler JT, Moss SJ, Olsen RW (marzo de 2002). "Especificidad de subunidades y dominio de interacción entre la proteína asociada al receptor GABA(A) (GABARAP) y los receptores GABA(A)". Journal of Neurochemistry . 80 (5): 815– 823. doi : 10.1046/j.0022-3042.2002.00762.x . PMID 11948245. S2CID 38049055 .