GLD-2 (que significa Desarrollo de la Línea Germinal 2 ) es una poli(A) polimerasa citoplasmática (citoPAPs) que agrega monómeros de AMP sucesivos al extremo 3' de ARN específicos, formando una cola de poli(A), que es un proceso conocido como poliadenilación .
Para la especificidad del ARN, GLD-2 se asocia con una proteína de unión al ARN , generalmente GLD-3, para formar un heterodímero que actúa como una PAP citoplasmática. Esta proteína tiene una función enzimática y pertenece a una familia (familia tipo B de la ADN polimerasa) que incluye varias enzimas similares, como GLD-1, GLD-3 y GLD-4.
Esta familia de PAP citoplasmáticas se ha descrito en diversas especies, como Homo sapiens , Caenorhabditis elegans , Xenopus , Mus musculus y Drosophila . Además, al ser una PAP citoplasmática, difiere de las PAP nucleares en algunos aspectos. Mientras que las PAP nucleares contienen un dominio catalítico y un dominio de unión a ARN, los miembros de la familia GLD-2 solo poseen un dominio catalítico.
Localización
GLD-2 es una proteína común y abundante, aunque todavía bastante desconocida, que se ha encontrado en los cinco reinos . En el reino animal, se ha detectado especialmente en Homo sapiens, Drosophila , Xenopus y Mus musculus . Sin embargo, también se ha observado su presencia en Arabidopsis thaliana , perteneciente al reino vegetal; Escherichia coli, en Monera; y Candida albicans, en hongos.
En los seres humanos, se expresa principalmente en el cerebro y, dentro de él, en el cerebelo, el hipocampo y el bulbo raquídeo. También se puede encontrar en otros tejidos, como fibroblastos , células HeLa, células MCF-7, líneas celulares de melanoma y timo . Dentro de estas células, se localiza en el núcleo y la mitocondria, ya que su función principal está relacionada con la poliadenilación del ADN, y estos orgánulos celulares son los únicos donde se encuentra el ADN. Sin embargo, también existe GLD-2 soluble en el citosol; aún se desconoce el motivo de su presencia.
En Escherichia coli , esta proteína enzimática se encuentra en la membrana celular y en el citosol , mientras que en Drosophila melanogaster predomina en el núcleo y el citoplasma del cerebro, así como en las células del ovocito, el ovario y el testículo. Finalmente, en Arabidopsis thaliana , se localiza en el núcleo de la flor, la raíz, el tallo y las hojas.
Funciones relacionadas
GLD-2 estabiliza principalmente los ARNm cuya traducción está reprimida y, además, promueve fuertemente la poliadenilación masiva. Sorprendentemente, estas funciones parecen tener poco impacto en la dinamización de la traducción eficiente del ARNm diana, ya que es una poli(A) polimerasa eficiente que contribuye al desarrollo de la actividad de poliadenilación. Esta actividad se estimula mediante su interacción con una proteína de unión a ARN putativa: GLD-3. Algunos estudios proponen que GLD-3 estimula a GLD-2 reclutándola al ARN. De ser así, entonces la unión de GLD-2 al ARN por otros medios también debería estimular su actividad.
Función molecular
unión de ATP
La GLD-2, como poli(A) polimerasa (PAP), actúa incorporando ATP en el extremo 3' de los ARNm de manera independiente de la plantilla.
Actividad enzimática: Actividad de polinucleótido adenililtransferasa
Se ha descubierto que esta proteína posee actividad catalítica; en otras palabras, tiene la capacidad de acelerar reacciones químicas que de otro modo no se producirían con tanta rapidez. Se sabe que cataliza la siguiente reacción (que requiere el siguiente cofactor: Mg(2+)):
ATP + ARN(n) ⇄ difosfato + ARN(n+1)
Dependiendo del entorno, el pH óptimo varía desde 8 en el citoplasma hasta 8,3 en el núcleo.
Proceso biológico
Diferenciación de células progenitoras hematopoyéticas
La proteína GLD-2, junto con otras 136 proteínas, participa en el proceso molecular de diferenciación de las células progenitoras hematopoyéticas en el proteoma humano. Este proceso consiste en la adquisición, por parte de una célula precursora, de las características especializadas de una célula progenitora hematopoyética, un tipo celular que incluye células progenitoras mieloides y linfoides.
Procesamiento del ARNm mediante poliadenilación del ARN
La actividad de poliadenilación de GLD-2, como mencionamos anteriormente, es estimulada por la interacción física con una proteína de unión a ARN, GLD-3. Para comprobar si GLD-3 podría estimular a GLD-2 reclutándola al ARN, algunos estudios anclaron GLD-2 de C. elegans a ARNm en ovocitos de Xenopus utilizando la proteína de cubierta MS2. La GLD-2 anclada añade poli(A) y estimula la traducción del ARNm, demostrando que el reclutamiento es suficiente para estimular la actividad de poliadenilación. Heterodímero PAP en el que GLD-2 contiene el sitio activo y GLD-3 proporciona especificidad de unión al ARN. La proteína de cubierta MS2 se unió a GLD-2 para reclutarla a un ARN.
Además, la actividad de GLD-2 también es importante para mantener o aumentar la abundancia de muchos ARNm, ya que la poliadenilación citoplasmática desempeña un papel esencial en la activación de la traducción del ARNm materno durante el desarrollo temprano. En los vertebrados , esta reacción requiere CPEB, una proteína de unión al ARN, y la poli(A) polimerasa GLD-2.
La enzima de Xenopus , que existe en dos formas estrechamente relacionadas, poliadenila los ARN a los que se une y potencia su traducción. Asimismo, interactúa con factores de poliadenilación citoplasmáticos, como el factor de especificidad de escisión y poliadenilación y CPEB , y con los ARNm diana. Estos hallazgos confirman y amplían un informe reciente que indicaba que una enzima GLD-2 es la PAP largamente buscada responsable de la poliadenilación citoplasmática en los ovocitos.
Además, se cree que la formación de la memoria a largo plazo carece de control traslacional de los ARNm localizados. En mamíferos, los ARNm dendríticos se mantienen en un estado reprimido y se activan tras una estimulación repetitiva. Se piensa que varias proteínas reguladoras necesarias para el control traslacional en el desarrollo temprano son necesarias para la formación de la memoria, lo que sugiere mecanismos moleculares similares. En un experimento con Drosophila , se detectó la enzima responsable de la elongación de poli(A) en el cerebro y se demostró que su actividad es necesaria específicamente para la memoria a largo plazo. Estos hallazgos proporcionan evidencia sólida de que la poliadenilación citoplasmática es fundamental para la formación de la memoria y que GLD2 es la enzima responsable.
Implicaciones médicas
También se ha descubierto que la GLD2 tiene usos médicos.
Por ejemplo, esta enzima se sobreexpresa en pacientes con cáncer ; por ello, puede utilizarse como factor pronóstico para la detección precoz del cáncer de mama. Además, la actividad de la PAP se emplea para medir el efecto de fármacos anticancerígenos como el etopósido y la cordicepina en dos líneas celulares de carcinoma : HeLa , que corresponde al carcinoma epitelioide de cuello uterino humano, y MCF-7 (cáncer de mama humano). Sin embargo, a pesar de su utilidad, también puede estar implicada en la expresión de diversas enfermedades comunes como la leucemia , la cirrosis hepática , las lesiones cerebrales , la hepatitis y, en algunos casos, la infertilidad en pacientes masculinos.
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000164329 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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Lecturas adicionales
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- Genes en el cromosoma 5 humano
- expresión génica
- ARN