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Halobacteriaceae

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Halobacteriaceae , del griego antiguo ἅλς ( háls ), que significa "sal" y "bacteria", es una familia del orden Halobacteriales y del dominio Archaea . [ 1 ] Halobacteriaceae representa una gran parte de las arqueas halófilas , junto con miembros de otras dos familias metanogénicas, Methanosarcinaceae y Methanocalculaceae . [ 2 ] La familia consta de muchos géneros diversos que pueden sobrevivir en nichos ambientales extremos. [ 3 ] Lo más común es que Halobacteriaceae se encuentre en lagos hipersalinos e incluso puede tolerar sitios contaminados por metales pesados. [ 4 ] Incluyen neutrófilos , acidófilos (ej. Halarchaeum acidiphilum ), alcalófilos (ej. Natronobacterium ), e incluso se han descubierto especies psicotolerantes (ej. Hrr. lacusprofundi ). [ 3 ] Se sabe que algunos miembros viven aeróbicamente, así como anaeróbicamente, y presentan muchas morfologías diferentes . [ 3 ] Estas diversas morfologías incluyen bacilos en el género Halobacterium , cocos en Halococcus , discos aplanados o copas en Haloferax , y otras formas que van desde triángulos aplanados en Haloarcula hasta cuadrados en Haloquadratum y Natronorubrum . [ 5 ] [ 6 ] La mayoría de las especies de Halobacteriaceae son mejor conocidas por su alta tolerancia a la sal y miembros pigmentados de rojo-rosa (debido a los carotenoides bacterioruberina [ 5 ] ), pero también hay especies no pigmentadas y aquellas que requieren condiciones de sal moderadas. [ 3 ] [ 7 ] Se ha demostrado que algunas especies de Halobacteriaceae exhiben actividades de solubilización de fósforo que contribuyen al ciclo del fósforo en ambientes hipersalinos. [ 8 ] Técnicas como el análisis del ARNr 16S y la hibridación ADN-ADNhan sido importantes contribuyentes a la clasificación taxonómica en Halobacteriaceae, en parte debido a la dificultad de cultivar arqueas halófilas. [ 7 ] [ 3 ] [ 2 ]

Descripción general

Las halobacteriaceae se encuentran en aguas saturadas o casi saturadas de sal. También se las denomina halófilas , aunque este nombre también se usa para otros organismos que viven en aguas saladas con una concentración algo menor. Son comunes en la mayoría de los entornos donde hay grandes cantidades de sal, humedad y materia orgánica. Las grandes floraciones presentan un color rojizo debido al pigmento bacteriorrodopsina . Este pigmento se utiliza para absorber la luz, que proporciona energía para crear ATP . Las halobacterias también poseen un segundo pigmento, la halorodopsina , que bombea iones cloruro en respuesta a los fotones, creando un gradiente de voltaje y ayudando en la producción de energía a partir de la luz. El proceso no está relacionado con otras formas de fotosíntesis que implican el transporte de electrones, y las halobacterias son incapaces de fijar el carbono del dióxido de carbono .

Las halobacterias pueden sobrevivir en ambientes salinos porque, aunque son aerobias , poseen un mecanismo distinto para generar energía mediante la luz. Partes de sus membranas son de color púrpura y contienen pigmento retinal . Esto les permite crear un gradiente de protones a través de la membrana celular, el cual utilizan para generar ATP .

Poseen ciertas adaptaciones para vivir en ambientes salinos. Por ejemplo, su maquinaria celular está adaptada a altas concentraciones de sal gracias a la presencia de aminoácidos cargados en su superficie, lo que permite a la célula mantener las moléculas de agua alrededor de estos componentes. La presión osmótica y estos aminoácidos ayudan a controlar la cantidad de sal dentro de la célula. Sin embargo, debido a estas adaptaciones, si la célula se coloca en un ambiente húmedo y menos salino, es probable que reviente inmediatamente debido a la presión osmótica.

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 9 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 1 ]

Entre las familias estrechamente relacionadas se incluyen Halococcaceae y Haloarculaceae . Algunas fuentes pueden optar por utilizar una ubicación no filogenética de los géneros entre Halobacteriaceae y estas familias (véase también la nota 1). [ 10 ]

Nota 1: * Halobacteriaceae polifiléticas Nota 2: Halobacteriaceae no asignadas

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Sayers; et  al. "Halobacteriaceae" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Recuperado el 15 de agosto de 2023 .
  2. 1 2 Oren, Aharon (septiembre de 2014). "Taxonomía de las arqueas halófilas: estado actual y desafíos futuros". Extremophiles . 18 (5): 825– 834. Bibcode : 2014Extmo..18..825O . doi : 10.1007/s00792-014-0654-9 . PMID 25102811 . S2CID 5395569 .  
  3. 1 2 3 4 5 Oren, Aharon (1 de febrero de 2012). "Taxonomía de la familia Halobacteriaceae: un paradigma para cambiar conceptos en la sistemática de procariotas" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 62 (2): 263– 271. Bibcode : 2012IJSEM..62..263O . doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . PMID 22155757 . 
  4. ↑ Naik, Sanika; Furtado, Irene (2017). Contaminación marina y remediación microbiana . Singapur: Springer Nature. pp. 143–152 . ISBN  978-981-10-1044-6.
  5. 1 2 Oren, Aharon; Arahal, David; Ventosa, Antonio (2009). "Descripciones enmendadas de géneros de la familia Halobacteriaceae" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 59 (3): 637– 642. Bibcode : 2009IJSEM..59..637O . doi : 10.1099/ijs.0.008904-0 . PMID 19244452 . 
  6. ↑ Tully, Benjamin; Emerson, Joanne; Andrade, Karen; Brocks, Jochen; Allen, Eric; Banfield, Jillian; Heidelberg, Karla (16 de septiembre de 2014). " Secuencias de novo de Haloquadratum walsbyi del lago Tyrrell, Australia, revelan un paisaje genómico variable" . Archaea . 2015 875784. doi : 10.1155/2015/875784 . PMC 4330952. PMID 25709557 .  
  7. ^ Ventosa , A.; Márquez, M.; Sánchez-Porro, C.; Haba, R. (2012). Avances en la comprensión de la biología de los microorganismos halófilos ([Ed. actualizado]. ed.). Dordrecht: Springer, Dordrecht. doi : 10.1007/978-94-007-5539-0_3 . ISBN  978-94-007-5538-3.
  8. ↑ Yadav, Ajar Nath; Sharma, Divya; Gulati, Sneha; Singh, Surender; Dey, Rinku; Pal, Kamal Krishna; Kaushik, Rajeev; Saxena, Anil Kumar (28 de julio de 2015). "Haloarqueas dotadas de atributos de solubilización de fósforo implicadas en el ciclo del fósforo" . Scientific Reports . 5 (1) 12293. Bibcode : 2015NatSR...512293Y . doi : 10.1038/srep12293 . PMC 4516986. PMID 26216440 .  
  9. ↑ JP Euzéby. "Halobacteriaceae" . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de agosto de 2023 .
  10. ↑ Zhu, LR; Mao, YL; Hu, Y; Sun, YP; Hou, J; Cui, HL (mayo de 2025). "Taxonomía basada en el genoma de la familia Haloarculaceae, propuesta de Natronomonadaceae fam. nov. y descripción de cuatro nuevas arqueas halófilas de dos lagos salinos y una salina solar marina". Systematic and Applied Microbiology . 48 (3) 126592. Bibcode : 2025SyApM..4826592Z . doi : 10.1016/j.syapm.2025.126592 . PMID 40036997 . 
  11. ↑ "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  12. ↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  13. ↑ "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  14. ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  15. ↑ "ar53_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
  16. ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .

Lecturas adicionales

Revistas científicas

  • Wright, A-DG (2006). "Relaciones filogenéticas dentro del orden Halobacteriales inferidas a partir de secuencias del gen ARNr 16S" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 56 (Pt 6): 1223–1227 . doi : 10.1099/ijs.0.63776-0 . PMID 16738095 . 
  • Judicial, Comisión del Comité Internacional de Sistemática de Procariotas (2005). "Los tipos nomenclaturales de los órdenes Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales y Verrucomicrobiales son los géneros Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus y Verrucomicrobium, respectivamente. Opinión 79" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 55 (Pt 1): 517–518 . doi : 10.1099/ijs.0.63548-0 . PMID 15653928 . 
  • Euzeby JP, Tindall BJ (2001). "Tipo nomenclatural de órdenes: correcciones necesarias según las Reglas 15 y 21a del Código Bacteriológico (Revisión de 1990) y designación de tipos nomenclaturales apropiados de clases y subclases. Solicitud de opinión" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 51 (Pt 2): 725–727 . doi : 10.1099/00207713-51-2-725 . PMID 11321122 . 
  • Oren A, Ventosa A (2000). "Subcomité del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática sobre la taxonomía de Halobacteriaceae. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sídney, Australia" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407 . doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 . 

Libros científicos

  • Grant WD, Larsen H (1989). "Grupo III. Arqueobacterias extremadamente halófilas. Orden Halobacteriales ord. nov." En JT Staley, MP Bryant, N Pfennig, JG Holt (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volumen 3 (1.ª  ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. pág.  169.
  • Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae fam. nov." En RE Buchanan y NE Gibbons (eds.). Manual de bacteriología determinativa de Bergey (8.ª  ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co.
  • Blum P, ed. (2008). Archaea: New Models for Prokaryotic Biology . Caister Academic Press . ISBN 978-1-904455-27-1..
  • Nombres correctos de los taxones dentro de la familia Halobacteriaceae