Haloferacales es un orden de arqueas halófilas , quimioorganótrofas o heterótrofas dentro de la clase Haloarchaea . [ 3 ] El género tipo de este orden es Haloferax . [ 4 ]
El nombre Haloferacales deriva del término latino Haloferax, que hace referencia al género tipo del orden, y del sufijo "-ales", una terminación utilizada para denotar un orden. En conjunto, Haloferacales se refiere a un orden cuyo tipo nomenclatural es el género Haloferax .
Características bioquímicas y firmas moleculares
Los miembros son halófilos y pueden ser quimioorganótrofos o heterótrofos, y se aíslan de ambientes con alta salinidad, como las salinas marinas y el Mar Muerto . Algunos miembros son móviles y contienen vesículas de gas. Su morfología es variable, incluyendo formas de bastón, coco o cuadradas planas. Los miembros de este orden crecen de forma óptima en pH neutro. El contenido de G+C del ADN para este orden oscila entre el 55 y el 66 % molar. [ 3 ]
Este orden se puede distinguir de manera fiable de otras Halobacteria por la presencia de cinco proteínas características conservadas (CSP) y cuatro inserciones/deleciones características conservadas (CSI) presentes en las siguientes proteínas: ADN girasa B, prolil ARNt sintetasa, acil-CoA sintetasa y subunidad B de la aspartil/glutamil-ARNt amidotransferasa. [ 3 ]
Sistemática histórica y taxonomía actual
A partir de 2021, Haloferacales contiene dos familias, Haloferacaceae y Halorubraceae . [ 4 ] Los miembros de este orden se delimitaron de la clase Halobacteria , anteriormente un gran grupo de especies filogenéticamente no relacionadas con características bioquímicas distintas y diferentes nichos ecológicos. [ 5 ] [ 6 ] La diversa gama de características morfológicas y fisiológicas hizo difícil aclarar la relación evolutiva dentro de la clase más allá del nivel de género.
En 2015, Gupta et al. propusieron la división de la clase Halobacteria en los órdenes Halobacteriales , Haloferacales y Natrialbales basándose en análisis genómicos comparativos y el patrón de ramificación de varios árboles filogenéticos construidos a partir de diferentes conjuntos de datos de proteínas conservadas y secuencias de ARNr 16S. También se identificaron marcadores moleculares, específicamente indels característicos conservados , específicos de este orden como evidencia que respalda la división independientemente de los árboles filogenéticos. [ 3 ] Cada orden puede distinguirse de manera confiable de los demás y de otras especies basándose en la presencia de estos CSI.
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 2 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 1 ]
Referencias
- 1 2 Sayers; et al. "Haloferacales" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Recuperado el 17 de mayo de 2023 .
- 1 2 J.P. Euzéby. "Haloferacales" . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Recuperado el 17 de mayo de 2023 .
- 1 2 3 4 Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Panadero, Sheridan (1 de marzo de 2015). "Análisis filogenómicos y firmas moleculares para la clase Halobacteria y sus dos clados principales: una propuesta para la división de la clase Halobacteria en un orden modificado Halobacteriales y dos nuevos órdenes, Haloferacales ord. nov. y Natrialbales ord. nov., que contienen las nuevas familias Haloferacaceae fam. nov. y Natrialbaceae fam. nov" . Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 65 (Pt_3): 1050– 1069. doi : 10.1099/ijs.0.070136-0 . ISSN 1466-5026 .
- 1 2 "Orden: Haloferacales" . lpsn.dsmz.de. Consultado el 27 de junio de 2021 .
- ^ Conceder, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (14 de septiembre de 2015). "Clase de halobacterias. noviembre" . Manual de sistemática de arqueas y bacterias de Bergey : 1– 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 .
- ↑ Oren, Aharon (1 de febrero de 2012). "Taxonomía de la familia Halobacteriaceae: un paradigma para cambiar conceptos en la sistemática de procariotas" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263– 271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 .
- ↑ "El LTP" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ↑ "Notas de la versión LTP_06_2022" (PDF) . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ↑ "GTDB versión 08-RS214" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ↑ "ar53_r214.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2023 .
- Haloarqueas
- Taxones descritos en 2015