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Articulo de referencia

Haplogrupo O-M268

En genética humana, el haplogrupo O-M268 , también conocido como O1b (anteriormente haplogrupo O2), es un haplogrupo de ADN del cromosoma Y. El haplogrupo O-M268 es un subclado ...

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En genética humana, el haplogrupo O-M268 , también conocido como O1b (anteriormente haplogrupo O2), es un haplogrupo de ADN del cromosoma Y. El haplogrupo O-M268 es un subclado primario del haplogrupo O-F265, a su vez una rama descendiente primaria del haplogrupo O-M175 .

Origen

En un artículo publicado en 2011 por un grupo de investigadores chinos afiliados a la Universidad de Fudan , se sugirió que China es el origen de la expansión del haplogrupo O-P31 (denominado allí haplogrupo O2-M268). [4]

Distribución

El haplogrupo O-P31 se distingue por las peculiaridades de su distribución geográfica. Como todos los clados del haplogrupo O-M175, el haplogrupo O-P31 se encuentra solo entre los varones de las poblaciones modernas de Eurasia oriental . Sin embargo, el haplogrupo O-P31 se encuentra generalmente con alta frecuencia solo entre ciertas poblaciones, como los pueblos austroasiáticos de la India, Bangladesh y el sudeste asiático, los nicobareses de las islas Nicobar en el océano Índico, los coreanos y los japoneses .

Además de su distribución generalizada y desigual, el haplogrupo O1b-P31 también es notable por el hecho de que se puede dividir en dos subclados principales que muestran una distribución casi completamente disyunta: O1b1-M1304/K18 y O1b2-M176/P49. Uno de estos subclados, O1b1-M1304/K18 (también conocido como O-F2320), se puede dividir principalmente en dos subclados, O1b1a1-PK4 (anteriormente O2a) y O1b1a2-CTS4040 (anteriormente O2*(xM95,M176)). O1b1a1-PK4 se encuentra principalmente entre las poblaciones del sudeste asiático y algunas poblaciones tribales de la India (como los remo , juang y nicobareses ), pero también es común entre los grupos étnicos minoritarios del sur de China, y se encuentra con baja frecuencia en toda China, así como en Japón. O1b1a2-CTS4040 es relativamente raro y se distribuye principalmente en el este de Asia, especialmente en China , donde representa aproximadamente el 3,22% de la población masculina nacional. [5] El otro subclado primario del haplogrupo O1b-P31, es decir, el haplogrupo O1b2-M176 (anteriormente O2b), se encuentra en aproximadamente un tercio de los varones japoneses y coreanos actuales y con baja frecuencia (aproximadamente el 0,70% [6] ) en los varones chinos .

Filogenética

Historia filogenética

Antes de 2002, existían en la literatura académica al menos siete sistemas de denominación para el árbol filogenético del cromosoma Y, lo que generó una considerable confusión. En 2002, los principales grupos de investigación se unieron y formaron el Consorcio del Cromosoma Y (YCC, por sus siglas en inglés). Publicaron un documento conjunto que creó un único árbol nuevo que todos acordaron utilizar. Más tarde, un grupo de científicos ciudadanos interesados ​​en la genética de poblaciones y la genealogía genética formó un grupo de trabajo para crear un árbol amateur que apuntaba a ser, sobre todo, oportuno. La siguiente tabla reúne todos estos trabajos en el punto del emblemático Árbol YCC de 2002. Esto permite que un investigador que revise la literatura publicada más antigua pueda moverse rápidamente entre nomenclaturas.

Publicaciones de investigación originales

Los siguientes equipos de investigación por sus publicaciones estuvieron representados en la creación del Árbol YCC.

  • α Jobling y Tyler-Smith 2000 y Kaladjieva 2001
  • β Bajo la colina 2000
  • Martillo gamma 2001
  • El Karafet 2001
  • ε Semino 2000
  • El 19 de diciembre de 1999
  • Por Capelli 2001

Árboles filogenéticos

Este árbol filogenético de los subclados del haplogrupo O se basa en el árbol YCC 2008 (Karafet 2008) y en investigaciones publicadas posteriormente.

  • O-P31 (P31, M268)
    • O-K18
      • O-CTS4040 Se encuentra principalmente en chinos Han y ocasionalmente en chinos (Dai), Manchú, Tailandia ( Phuan , Tai Yuan , Thai ), Vietnam, Filipinas, Kalimantan Occidental , Qatar , Hazara , Japón, Corea.
      • O-PK4
        • O-F838 Encontrado en chinos Han [4] [7] y en un espécimen del sur de Kazajstán medieval atribuido a los turcos ; [8] probablemente también presente en Tailandia ( Kaleun , Phuan , Thai ), [9] Hanoi , [7] Ambon , [7] Región de Ayeyarwady , [10] y el condado de Xinlong [11]
        • O-M95 (M95)
          • O-CTS350
            • O-CTS350* Encontrado en Japón
            • O-CTS10007 encontrado en chino Han en Hunan
          • O-M1310
            • O-F1252
              • O-SK1630/F5504 China ( Shaanxi ), [3] Rusia ( Óblast de Riazán ) [3]
                • O-SK1636
              • O-F2924
                • O-CTS5854 Se encuentra en China (Han, Dai ), Laos, Tailandia, Japón y Filipinas.
                • O-M88 (M88, M111) Encontrado en Vietnam, Laos, Tailandia, Camboya, Myanmar, China (Dai, Buyi, Zhuang, Li, Shui, She, Miao, Yao, De'ang, Bulang, Qiang, Tujia, Lisu, Achang, Nu, Lahu, Jinuo, Hani, Yi, Bai, Han), Taiwán (Han, Bunun, Yami), Java, Borneo, Malasia, Filipinas
            • O-F789/M1283 Se encuentra en China, Vietnam, Camboya, Singapur (Malayo), [12] Indonesia, Laos, Tailandia, Myanmar, Bután, [13] Bangladesh e India.
    • O-P49 (M176, SRY465, P49, 022454) Japón, [14] Corea del Sur, [14] China, [14] Mongolia, [14] Vietnam, [14] Micronesia [14]
      • O-P49*(xPage92) Japón, Corea del Sur
      • O-Página 92
        • O-Página 90 Japón ( Hiroshima ), Jilin [3]
        • O-CTS9259
          • O-CTS562 Pekín ( Han ), [3] Corea del Sur , [15] Japón (Fukushima) [3]
          • O-K10/F1204
            • O-K10* Japón (Tokio [3] )
            • O-CTS10687 Japón, [14] Mongolia [14]
            • O-K7/CTS11723/47z Se encuentra en aproximadamente el 24 % de los hombres japoneses y con menor frecuencia en Corea y China.
              • O-BY130355 Sichuan [3]
              • O-K2/CTS713
                • O-K2* Japón (Tokio, [3] Aomori [3] ), Corea del Sur [3]
                • O-CTS203 Japón (Tokio, [3] Miyagi [3] ), Henan [3]
                • O-K14
                  • O-K14* Shanxi [3]
                  • O-M776 Japón (Tokio [3] )
                  • O-Z24594
                    • O-Z24594* Corea del Sur [3]
                    • O-CTS56 Japón (Tokio, [3] Kumamoto [3] )
                • O-Y178266 Japón (Tokio [3] ), Pekín [3]
                • O-Z24599
                  • O-Z24599* Japón (Tokio, [3] Yamaguchi [3] )
                  • O-K473 Japón (Tokio [3] )
                  • O-Y181118 Corea del Sur (Busan [3] ), Hebei [3]
            • OK-K4
              • O-K3/F940 Hunan ( Han ), Jiangxi, Henan (Han)
                • O-F940* Hunan, [3] Jiangxi [3]
                • O-K481 Hunan (Han) [3]
              • O-L682 Se encuentra en aproximadamente el 19% de los hombres de Corea del Sur [16] y con menor frecuencia en Japón y China.
                • O-L682* Shanxi [3]
                • O-K485
                  • O-K485* Japón (Tokio) [3]
                  • O-CTS723
                    • O-CTS723* Corea del Sur [3]
                    • O-A23652
                      • O-A23652* Japonés [3]
                      • O-A23653
                        • O-A23653* Japonés, [3] Corea del Sur [3]
                        • O-A23658
                          • O-A23658* Corea del Sur [3]
                          • O-Y165475 Corea del Sur [3]
                    • O-Y24057
                      • O-Y24057* Shandong [3]
                      • O-A12448
                        • O-A12448* Corea del Sur (incl. Daegu [3] )
                        • O-PH40 Pekín (Han), [3] Shandong, [3] Corea del Sur, [3] Japón [14]
                      • O-MF14220 Corea del Sur [3]
                      • O-Y26376/CTS7620 Japón, [14] Corea del Sur [14]
                        • O-MF14346 Corea del Sur [3]
                        • O-Y26377
                          • O-Y26377* Japón (Okayama), [3] Hezhen [3]
                          • O-CTS1175 Japón (Kochi, [3] Tokio [3] )

Véase también

Genética

Subclados O del ADN-Y

Árbol de la estructura principal del ADN-Y

Referencias

  1. ^ G. David Poznik, Yali Xue, Fernando L. Mendez, et al. , "Ráfagas puntuadas en la demografía masculina humana inferidas a partir de 1244 secuencias del cromosoma Y en todo el mundo". Nat Genet. Junio ​​de 2016; 48(6): 593–599. doi:10.1038/ng.3559.
  2. ^ por Monika Karmin, Rodrigo Flores, Lauri Saag, Georgi Hudjashov, Nicolas Brucato, Chelzie Crenna-Darusallam, Maximilian Larena, Phillip L Endicott, Mattias Jakobsson, J Stephen Lansing, Herawati Sudoyo, Matthew Leavesley, Mait Metspalu, François-Xavier Ricaut y Murray P Cox, "Episodios de diversificación y aislamiento en linajes masculinos de islas del sudeste asiático y de Oceanía cercana", Molecular Biology and Evolution , Volumen 39, Número 3, marzo de 2022, msac045, https://doi.org/10.1093/molbev/msac045
  3. ^ abcdefghijklmnopqrstu vwxyz aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar como en au av aw YFull Haplogroup YTree v5.04 el 16 de mayo de 2017
  4. ^ ab Shi Yan, Chuan-Chao Wang, Hui Li, Shi-Lin Li, Li Jin y The Genographic Consortium, "Un árbol actualizado del haplogrupo O del cromosoma Y y posiciones filogenéticas revisadas de las mutaciones P164 y PK4". European Journal of Human Genetics (2011) 19, 1013–1015; doi:10.1038/ejhg.2011.64
  5. ^ "O-Cts4040 no es un buen ejemplo de esto".
  6. ^ "O-P49 no tiene precio".
  7. ^ abc Jean A Trejaut, Estella S Poloni, Ju-Chen Yen, et al. (2014), "Variación del ADN del cromosoma Y de Taiwán y su relación con las islas del sudeste asiático". BMC Genetics 2014, 15:77. http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
  8. ^ Peter de Barros Damgaard, Nina Marchi, Simon Rasmussen, et al. (2018), "137 genomas humanos antiguos de las estepas euroasiáticas". Nature , volumen 557, páginas 369-374 (2018). https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
  9. ^ Wibhu Kutanan, Jatupol Kampuansai, Metawee Srikummool, Andrea Brunelli, Silvia Ghirotto, Leonardo Arias, Enrico Macholdt, Alexander Hübner, Roland Schröder y Mark Stoneking, "Contrastes entre las historias genéticas paternas y maternas de las poblaciones tailandesas y laosianas". Mol. Biol. Evol. Publicación de acceso anticipado el 12 de abril de 2019. doi :10.1093/molbev/msz083
  10. ^ Min-Sheng Peng, Jun-Dong He, Long Fan, et al. (2013), "Recuperación de árboles de haplogrupos del cromosoma Y utilizando datos de GWAS". Revista Europea de Genética Humana (2013), 1–5. doi:10.1038/ejhg.2013.272
  11. ^ Wang CC, Wang LX, Shrestha R, Zhang M, Huang XY, et al. (2014), "Estructura genética de las poblaciones qiangicas que residen en el corredor occidental de Sichuan". PLoS ONE 9(8): e103772. doi:10.1371/journal.pone.0103772
  12. ^ Monika Karmin, Lauri Saag, Mário Vicente y col. , "Un reciente cuello de botella en la diversidad del cromosoma Y coincide con un cambio global en la cultura". Investigación del genoma 25:1–8; ISSN 1088-9051/15; www.genoma.org
  13. ^ Pille Hallast, Chiara Batini, Daniel Zadik, et al. (2015), "El árbol del cromosoma Y se transforma en hojas: 13 000 SNP de alta confianza que cubren la mayoría de los clados conocidos". Molecular Biology and Evolution 2015 Mar;32(3):661-73. doi:10.1093/molbev/msu327
  14. ^ abcdefghijk Haploárbol de ADN-Y en Family Tree DNA
  15. ^ Proyecto del haplogrupo Y en Family Tree DNA
  16. ^ So Yeun Kwon, Hwan Young Lee, Eun Young Lee, Woo Ick Yang y Kyoung-Jin Shin, "Confirmación de las topologías de los árboles de haplogrupos Y con los nuevos SNP Y sugeridos para los subaplogrupos C2, O2b y O3a". Forensic Science International: Genetics 19 (2015) 42–46. https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003

Notas al pie

Obras citadas

Revistas

  • Su, Bing; Xiao, Junhua; Underhill, Peter; Deka, Ranjan; Zhang, Weiling; Akey, Joshua; Huang, Wei; Shen, Di; et al. (1999). "Evidencia del cromosoma Y de una migración hacia el norte de los humanos modernos hacia Asia oriental durante la última Edad de Hielo". The American Journal of Human Genetics . 65 (6): 1718–24. doi :10.1086/302680. PMC  1288383 . PMID  10577926.

Sitios web

  • "Descripciones de haplogrupos de ADN-Y". Archivado desde el original el 19 de marzo de 2009.

Fuentes para las tablas de conversión

  • Capelli, Cristian; Wilson, James F.; Richards, Martin; Stumpf, Michael PH; et al. (febrero de 2001). "Una herencia paterna predominantemente indígena para los pueblos de habla austronesia del sudeste asiático insular y Oceanía". The American Journal of Human Genetics . 68 (2): 432–443. doi :10.1086/318205. PMC  1235276 . PMID  11170891.
  • Hammer, Michael F.; Karafet, Tatiana M.; Redd, Alan J.; Jarjanazi, Hamdi; et al. (1 de julio de 2001). "Patrones jerárquicos de la diversidad global del cromosoma Y humano". Biología molecular y evolución . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 . PMID  11420360.
  • Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris (2000), "Nuevos usos para nuevos haplotipos", Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi :10.1016/S0168-9525(00)02057-6, PMID  10904265
  • Kaladjieva, Luba; Calafell, Francesc; Jobling, Mark A; Angelicheva, Dora; et al. (febrero de 2001). "Patrones de diversidad genética inter e intragrupo en Vlax Roma según lo revelado por el cromosoma Y y los linajes de ADN mitocondrial". Revista europea de genética humana . 9 (2): 97-104. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200597 . PMID  11313742. S2CID  21432405.
  • Karafet, Tatiana; Xu, Liping; Du, Ruofu; Wang, William; et al. (septiembre de 2001). "Historia de la población paterna de Asia oriental: fuentes, patrones y procesos microevolutivos". The American Journal of Human Genetics . 69 (3): 615–628. doi :10.1086/323299. PMC  1235490 . PMID  11481588.
  • Karafet, TM; Mendez, FL; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, SL; Hammer, MF (2008), "Nuevos polimorfismos binarios remodelan y aumentan la resolución del árbol de haplogrupos del cromosoma Y humano", Genome Research , 18 (5): 830–8, doi :10.1101/gr.7172008, PMC  2336805 , PMID  18385274
  • Semino, O.; Passarino, G; Oefner, PJ; Lin, AA; et al. (2000), "El legado genético del Homo sapiens sapiens paleolítico en los europeos actuales: perspectiva del cromosoma AY", Science , 290 (5494): 1155–9, Bibcode :2000Sci...290.1155S, doi :10.1126/science.290.5494.1155, PMID  11073453
  • Underhill, Peter A.; Shen, Peidong; Lin, Alice A.; Jin, Li; et al. (noviembre de 2000). "Variación de la secuencia del cromosoma Y y la historia de las poblaciones humanas". Nature Genetics . 26 (3): 358–361. doi :10.1038/81685. PMID  11062480. S2CID  12893406.

Lectura adicional

  • Firasat, Sadaf; Khaliq, Shagufta; Mohyuddin, Aisha; Papaioannou, Myrto; Tyler-Smith, Chris; Underhill, Peter A; Ayub, Qasim (2006). "Evidencia del cromosoma Y de una contribución griega limitada a la población Pathan de Pakistán". Revista Europea de Genética Humana . 15 (1): 121–6. doi :10.1038/sj.ejhg.5201726. PMC  2588664 . PMID  17047675.
  • Fornarino, Simona; Pala, María; Battaglia, Vincenza; Maranta, Ramona; Aquiles, Alejandro; Modiano, Guido; Torroní, Antonio; Semino, Ornella; Santachiara-Benerecetti, Silvana A (2009). "Diversidad mitocondrial y del cromosoma Y de Tharus (Nepal): un reservorio de variación genética". Biología Evolutiva del BMC . 9 (1): 154. Código bibliográfico : 2009BMCEE...9..154F. doi : 10.1186/1471-2148-9-154 . PMC  2720951 . PMID  19573232.
  • Hurles, M; Sykes, B; Jobling, M; Forster, P (2005). "El origen dual de los malgaches en las islas del sudeste asiático y el este de África: evidencia de linajes maternos y paternos". The American Journal of Human Genetics . 76 (5): 894–901. doi :10.1086/430051. PMC  1199379 . PMID  15793703.
  • Karafet, Tatiana M.; Lansing, JS; Redd, Alan J.; Watkins, Joseph C.; Surata, SPK; Arthawiguna, WA; Mayer, Laura; Bamshad, Michael; et al. (2005). "Perspectiva balinesa del cromosoma Y en el poblamiento de Indonesia: contribuciones genéticas de los cazadores-recolectores preneolíticos, los agricultores austronesios y los comerciantes indios". Biología humana . 77 (1): 93–114. doi :10.1353/hub.2005.0030. hdl : 1808/13586 . PMID  16114819. S2CID  7953854.
  • Sahoo, Sanghamitra; Kashyap, VK (2006). "La filogeografía del ADN mitocondrial y los haplogrupos del cromosoma Y revelan un flujo genético asimétrico en poblaciones de la India oriental". American Journal of Physical Anthropology . 131 (1): 84–97. doi :10.1002/ajpa.20399. PMID  16485297.
  • Trivedi, Rajni; Sitalaximi, T.; Banerjee, Jheelam; Singh, Anamika; Sircar, PK; Kashyap, VK (2006). "Información molecular sobre los orígenes de los Shompen, una población en declive del archipiélago de Nicobar". Journal of Human Genetics . 51 (3): 217–26. doi : 10.1007/s10038-005-0349-2 . PMID  16453062.
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