Helen M. Berman

Helen Miriam Berman es una química estadounidense que ostenta el título de Profesora Distinguida de Biología Cuantitativa y Computacional en la Facultad de Letras, Artes y Ciencias Dornsife de la USC . También es Profesora Emérita de Química y Biología Química de la Junta de Gobernadores de la Universidad de Rutgers y exdirectora del Banco de Datos de Proteínas RCSB (una de las organizaciones miembro del Banco Mundial de Datos de Proteínas ). Como bióloga estructural, su trabajo incluye el análisis estructural de complejos proteína-ácido nucleico y el papel del agua en las interacciones moleculares. También es fundadora y directora de la Base de Datos de Ácidos Nucleicos y dirigió la Base de Conocimientos de Genómica Estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas. ^{[ 1 ] [ 2 ] [ 3 ]} Es miembro de la Academia Estadounidense de las Artes y las Ciencias y miembro de la Academia Nacional de Ciencias.

Berman nació en Chicago, Illinois, y creció en Brooklyn, Nueva York. Su padre, David Bernstein, era médico y su madre, Dorothy Bernstein (de soltera Skupsky), administraba su consultorio. Inspirada por su padre, un hombre trabajador y erudito, desde niña se interesó por la ciencia y soñaba con ser científica o médica. Su madre, muy involucrada en la comunidad y el voluntariado, la impulsó a participar en actividades comunitarias a lo largo de su vida.

Durante su etapa en el instituto, Berman trabajó en el laboratorio de Ingrith Deyrup en el Barnard College . Deyrup la animó a estudiar en Barnard. Mientras estudiaba allí, trabajó en un laboratorio del Colegio de Médicos y Cirujanos de la Universidad de Columbia con Barbara Low . Allí, Berman aprendió sobre cristalografía , que se convertiría en una pasión para toda la vida. Se graduó en Barnard con una licenciatura en química en 1964.

Tras graduarse de la universidad, Berman cursó estudios de posgrado en la Universidad de Pittsburgh , que eligió por ser la única del país con un departamento de cristalografía y una de las pocas donde se ofrecía esta disciplina como asignatura. Allí trabajó con George A. Jeffrey en la estructura de los carbohidratos, obteniendo su doctorado en 1967. Berman permaneció en la Universidad de Pittsburgh dos años más como investigadora postdoctoral .

En 1969, Berman se trasladó al Centro Oncológico Fox Chase en Filadelfia, donde trabajó en el laboratorio de Jenny P. Glusker antes de iniciar su propio programa de investigación independiente como miembro del profesorado en 1973. En Fox Chase, Berman se interesó por las estructuras de los ácidos nucleicos y la bioinformática. Sabía que la organización lógica de los datos los haría útiles para diversos científicos.

En junio de 1971, Berman asistió a un simposio en el Laboratorio Cold Spring Harbor , donde varios científicos acordaron que los datos sobre el creciente número de estructuras proteicas debían archivarse en una base de datos. ^{[ 4 ]} Esa reunión condujo a la creación del Protein Data Bank (PDB) en el Laboratorio Nacional Brookhaven . ^{[ 5 ] [ 6 ]}

En 1989, Berman se trasladó a Rutgers y en 1992, junto con otros científicos, cofundó la Base de Datos de Ácidos Nucleicos (NDB) para recopilar y difundir información sobre la estructura de los ácidos nucleicos. ^{[ 7 ]} En Rutgers, continuó estudiando los ácidos nucleicos, sus interacciones con las proteínas, ^{[ 8 ]} y también investigó la estructura del colágeno en colaboración con Barbara Brodsky y Jordi Bella. ^{[ 9 ]} Figura como depositaria de 38 estructuras en la PDB desde 1992 hasta 2011, de complejos proteína/ácido nucleico y sus componentes (por ejemplo, 1RUN, 3SSX, 2B1B), fragmentos de colágeno (por ejemplo, 1CGD, 1EI8) y otras macromoléculas.

En 1998, Berman y Philip Bourne compitieron juntos por el contrato del Protein Data Bank y lo ganaron. La base de datos se trasladó de Brookhaven a los auspicios del Research Collaboratory for Structural Bioinformatics (RCSB), actualmente una colaboración entre Rutgers y la Universidad de California, San Diego. Junto con sus colegas, Berman rediseñó el sistema de gestión de datos, añadió nuevas herramientas para el usuario e hizo que la base de datos fuera consultable. ^{[ 10 ]} Desde 2003, el archivo PDB ha sido gestionado por el Banco Mundial de Datos de Proteínas (wwPDB), una asociación fundada por Berman que consta de organizaciones que actúan como centros de depósito, procesamiento y distribución de datos para los datos PDB: el RCSB, el PDBe en Europa y el PDBj en Japón. ^{[ 11 ]} Berman fue Directora Emérita del PDB después de haber sido su Directora (1998-2014). ^{[ 12 ]} En 2006, el banco de datos BioMagResData (BMRB) para estructuras de resonancia magnética nuclear (RMN) ^{[ 13 ]} se convirtió en el cuarto miembro del wwPDB. ^{[ 14 ]} A julio de 2018, el NDB contiene más de 9600 estructuras de ácidos nucleicos y el PDB contiene más de 142 000 estructuras macromoleculares.

También liderada por el RCSB, la base de datos de conocimiento de genómica estructural de la Iniciativa de Estructura de Proteínas (PSI) se lanzó en la primavera de 2008 para proporcionar un portal continuamente actualizado a datos de investigación y otros recursos de los esfuerzos de la PSI. ^{[ 15 ]}

Berman también ha participado activamente en la comunidad científica, desempeñándose como presidenta de la Asociación Cristalográfica Estadounidense en 1988, asesorando a los Institutos Nacionales de Salud y a la Fundación Nacional de Ciencias, y formando parte del consejo editorial de varias revistas. Su trabajo ha sido ampliamente publicado en revistas científicas revisadas por pares . ^{[ 8 ] [ 9 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]}

Berman fue el productor ejecutivo y creador de la serie documental Target Zero, que se centra en los aspectos médicos y sociales del tratamiento y la prevención del VIH. ^{[ 19 ]} Los tres cortometrajes entrelazan historias reales de pacientes, entrevistas con médicos, profesionales sanitarios y científicos destacados, y animaciones moleculares de vanguardia. Estos relatos ilustran la compleja historia del control de la epidemia del VIH y revelan la necesidad constante de una atención compasiva y centrada en el paciente, así como una comprensión profunda, a nivel celular, de la ciencia que sustenta los tratamientos. ^{[ 20 ]}

• Mujer Destacada de Nueva Jersey (1993)
• Miembro de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia (1996)
• Premio a la Científica Destacada, Asociación de Mujeres en la Ciencia , Capítulo de Nueva York (1999)
• Profesor distinguido, Sigma Xi : La Sociedad de Investigación Científica (2007–2009) ^{[ 21 ]}
• Premio al Servicio Distinguido, Sociedad Biofísica (2000)
• Miembro de la Sociedad Biofísica (2001) ^{[ 22 ]}
• Premio MJ Buerger, Asociación Cristalográfica Americana (2006) ^{[ 23 ]}
• Premio a exalumnos del Departamento de Química de la Universidad de Pittsburgh (2010)
• Miembro de la Asociación Cristalográfica Americana (2011)
• Premio Carl Brändén de la Sociedad de Proteínas (2012)
• Premio DeLano de Biociencias Computacionales de la Sociedad Estadounidense de Bioquímica y Biología Molecular (2013) ^{[ 24 ]}
• Premio Benjamin Franklin al Acceso Abierto en las Ciencias de la Vida (2014)
• Miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (2016)
• Miembro de la Academia Estadounidense de Artes y Ciencias (2018)
• Miembro de la Academia Nacional de Ciencias (2023)

Berman se ha casado dos veces: con el ingeniero Victor Berman en la década de 1960 y con el biólogo molecular Peter Young desde 1976 hasta 1999. De su segundo matrimonio tiene un hijo, Jason Asher Young (nacido en 1979), físico.

Durante la década de 1980, a Berman le diagnosticaron cáncer de mama. Esta experiencia la impulsó a centrarse más en su vida y en su carrera, y a interesarse por apoyar a otras mujeres que se enfrentan al mismo diagnóstico.

• Transcripción de la entrevista de historia oral realizada a Helen M. Berman el 28 de abril de 2020 en el Instituto Americano de Física, Biblioteca y Archivos Niels Bohr.