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Philip Bourne

Philip Eric Bourne (nacido en 1953) es un bioinformático australiano , [10] escritor de no ficción, [7] y hombre de negocios. [9] Actualmente es presidente de la Cátedra Stephen...

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Philip Eric Bourne (nacido en 1953) es un bioinformático australiano , [10] escritor de no ficción, [7] y hombre de negocios. [9] Actualmente es presidente de la Cátedra Stephenson de Ciencia de Datos y director de la Escuela de Ciencia de Datos y profesor de Ingeniería Biomédica [11] y fue el primer director asociado de Ciencia de Datos en los Institutos Nacionales de Salud , donde sus proyectos incluyen la gestión de la iniciativa Big Data to Knowledge , y anteriormente fue vicerrector asociado en la UCSD . [12] Ha contribuido a libros de texto y es un firme defensor de la literatura y el software de acceso abierto. Sus diversos intereses han abarcado la biología estructural , la informática médica , la tecnología de la información , la bioinformática estructural , la comunicación académica y las ciencias farmacéuticas . [10] Sus artículos son muy citados y tiene un índice h superior a 80. [13] [14] [5]

Educación

Bourne se formó como químico físico a mediados y finales de la década de 1970 y obtuvo su doctorado en 1979 [6] en la Universidad Flinders .

Carrera e investigación

Después de su doctorado, Bourne se trasladó a la Universidad de Sheffield para realizar una investigación postdoctoral durante 1979-1981, [15] seguido de un traslado a la Universidad de Columbia , Nueva York, en 1981. En 1995 se trasladó a la Universidad de California, San Diego , donde fue profesor en el Departamento de Farmacología. En 2014, se trasladó a los NIH para convertirse en su director asociado de Ciencia de Datos. En enero de 2017, se anunció que había aceptado un puesto como director del Instituto de Ciencia de Datos de la Universidad de Virginia . [16]

Es conocido por escribir el libro Unix for VMS Users (1990) [7] y por ser co-desarrollador del algoritmo Combinatorial Extension para la alineación tridimensional de estructuras de proteínas , [17] junto con I. Shindyalov (1998). En 1999 se convirtió en codirector del Protein Data Bank . [18] Fue presidente de la ISCB (2002-2003). [19] Es miembro de la American Medical Informatics Association desde 2002. [20] Es editor en jefe fundador de PLoS Computational Biology (2005-). En 2007 cofundó SciVee . [9] Bourne es editor de la popular serie de editoriales Ten Simple Rules publicadas en la revista PLoS Computational Biology . [21] Se ha desempeñado como Vicerrector Asociado de Innovación y Alianzas Industriales [12] y profesor de farmacología en la Escuela Skaggs de Farmacia y Ciencias Farmacéuticas de la Universidad de California, San Diego (UCSD). [22] [23] Es asesor del proyecto Hypothes.is [24] y director asociado de Ciencia de Datos en los Institutos Nacionales de Salud , donde sus proyectos incluyen la gestión de la iniciativa Big Data to Knowledge . [25] [26]

Publicaciones

Bourne es autor de numerosos artículos científicos y capítulos de libros y editor del libro de texto Structural Bioinformatics . [27] [28] y Pharmacy Informatics [29] Otras publicaciones [5] incluyen:

  • Bioinformática estructural 1.ª edición [27]
  • Bioinformática estructural 2da edición [28]
  • Informática Farmacéutica [29]
  • Unix para usuarios de máquinas virtuales [7]
  • Bourne, Philip E. (1 de enero de 1997). Un libro de recetas para servir Internet a UNIX . Prentice Hall. ISBN 9780135199923.
  • Hart, David L.; Bourne, Philip E. (12 de agosto de 1998). Libro de recetas para servidores web de Mac OS 8 (1.ª edición). Prentice Hall PTR. ISBN 9780135200162.
  • Bourne, Philip E. (1 de enero de 2000). Guía subterránea de Unix . Prentice Hall. ISBN 9780131844582.
  • Berman, HM; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, TN; Weissig, H.; Shindyalov, IN; Bourne, PE (1 de enero de 2000). "El banco de datos de proteínas". Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi :10.1093/nar/28.1.235. ISSN  0305-1048. PMC  102472 . PMID  10592235.

Premios y honores

Bourne fue elegido miembro de la AAAS en Ciencias Farmacéuticas en 2011 [1] y miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) en 2011. [2] En 2010 ganó el premio Jim Gray e-Science de Microsoft [3] y en 2009 ganó el premio Benjamin Franklin (2009). [4] [30]

Vida personal

Bourne está casado desde 1983 con Roma Chalupa y tienen dos hijos: Scott Bourne (1985-) y Melanie Bourne (1997-). [ cita requerida ] Sus intereses incluyen las motocicletas, [31] volar y hacer senderismo.

Referencias

  1. ^ ab "El Dr. Phil Bourne fue elegido miembro de la AAAS en el área de Ciencias Farmacéuticas". Pharmacy.ucsd.edu . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
  2. ^ ab "Becarios de la ISCB". Archivado desde el original el 28 de marzo de 2015. Consultado el 15 de agosto de 2011 .
  3. ^ ab "Philip E. Bourne gana el premio Jim Gray eScience Award de Microsoft en 2010". Eurekalert.org. 18 de octubre de 2010. Consultado el 27 de febrero de 2011 .
  4. ^ ab "Premio Benjamin Franklin". Bioinformatics.org . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
  5. ^ abc Publicaciones de Philip Bourne indexadas por Google Scholar
  6. ^ ab Bourne, Philip Eric (1979). Análisis de la estructura cristalina: complejos metálicos de interés biológico y estereoquímica de fonilbiciclooctanos sustituidos (tesis doctoral). Flinders University. OCLC  708090572.
  7. ^ abcd Bourne, Phil E (1990). Unix para usuarios de VMS . Digital Press Newton, MA, EE. UU. ISBN 1-55558-034-3.
  8. ^ Berman, HM ; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T.; Weissig, H.; Shindyalov, I.; Bourne, P. (2000). "El banco de datos de proteínas". Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi :10.1093/nar/28.1.235. PMC 102472 . PMID  10592235. 
  9. ^ abc Fink, JL; Bourne, PE (2007). "Reinventar la comunicación académica para la era electrónica". CTWatch Quarterly . 3 (3).
  10. ^ Publicaciones de Philip Bourne indexadas en la base de datos bibliográfica Scopus . (requiere suscripción)
  11. ^ "Philip E. Bourne". 6 de julio de 2017.
  12. ^ ab "Copia archivada" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 2012-07-31 . Consultado el 2012-07-02 .{{cite web}}: CS1 maint: copia archivada como título ( enlace )
  13. ^ página en la Universidad de Virginia
  14. ^ Antiguo sitio web de Bournes
  15. ^ Clegg, GA; Stansfield, RFD; Bourne, PE; Harrison, PM (1980). "Empaquetamiento de hélice y conformación de subunidades en la apoferritina del bazo de caballo". Nature . 288 (5788): 298–300. Bibcode :1980Natur.288..298C. doi :10.1038/288298a0. PMID  7432529. S2CID  4335735.
  16. ^ "UVA nombra a un investigador del NIH como nuevo director del Instituto de Ciencia de Datos". 11 de enero de 2017.
  17. ^ Shindyalov, IN; Bourne, PE (1998). "Alineación de la estructura de proteínas mediante extensión combinatoria incremental (CE) de la ruta óptima". Diseño e ingeniería de proteínas . 11 (9): 739–747. doi : 10.1093/protein/11.9.739 . PMID  9796821.
  18. ^ Berman, HM ; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T.; Weissig, H.; Shindyalov, I.; Bourne, P. (2000). "El banco de datos de proteínas". Investigación de ácidos nucleicos . 28 (1): 235–242. doi :10.1093/nar/28.1.235. PMC 102472 . PMID  10592235. 
  19. ^ "ISCB — Expresidentes". Archivado desde el original el 28 de agosto de 2015 . Consultado el 3 de septiembre de 2015 .
  20. ^ Greenes, RA; Madsen, E.; Miller, RA (2003). "Asociados internacionales y miembros del Colegio Americano de Informática Médica, 2002". Revista de la Asociación Americana de Informática Médica . 10 (3): 281–286. doi :10.1197/jamia.M1326. PMC 400512 . 
  21. ^ Diez reglas simples
  22. ^ http://www.sdsc.edu/pb/ La página web del laboratorio Bourne
  23. ^ http://www.sdsc.edu/~bourne/CV.pdf CV del doctor Philip E. Bourne
  24. ^ Sitio web oficial de Hypothes.is
  25. ^ NIH nombra al Dr. Philip E. Bourne como primer director asociado de ciencia de datos
  26. ^ Margolis, R.; Derr, L.; Dunn, M.; Huerta, M.; Larkin, J.; Sheehan, J.; Guyer, M.; Green, ED (2014). "La iniciativa Big Data to Knowledge (BD2K) de los Institutos Nacionales de Salud: capitalización de los macrodatos biomédicos". Revista de la Asociación Estadounidense de Informática Médica . 21 (6): 957–8. doi :10.1136/amiajnl-2014-002974. ISSN  1067-5027. PMC 4215061 . PMID  25008006. 
  27. ^ ab Bourne, Philip E.; Weissig, Helga (2003). Bioinformática estructural . John Wiley & Sons.
  28. ^ ab Gu, Jenny; Bourne, Philip E. (marzo de 2009). Bioinformática estructural (2.ª ed.). Wiley-Blackwell. ISBN 978-0-470-18105-8.
  29. ^ ab Anderson, Philip O.; Bourne, Philip E. (diciembre de 2009). Informática farmacéutica . CRC Press. ISBN 978-1-4200-7175-7.
  30. ^ "El premio Bourne: un evangelista del acceso abierto gana el premio Benjamin Franklin 2009". Bio-itworld.com . Consultado el 27 de febrero de 2011 .
  31. ^ OFL | Philip Bourne | Blog de viajes
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