El factor 3 de unión al potenciador de interleucina es una proteína que en humanos está codificada por el gen ILF3 . [ 5 ] [ 6 ]
Función
El factor nuclear de células T activadas (NFAT) es un factor de transcripción necesario para la expresión de interleucina 2 en las células T. NFAT se une a una secuencia en el potenciador de IL2 conocida como elemento de respuesta del receptor de antígeno 2. Además, NFAT puede unirse al ARN y es un componente esencial para la encapsidación y la activación de la proteína de la polimerasa del virus de la hepatitis B. NFAT es un heterodímero de proteínas de 45 kDa y 90 kDa, siendo la mayor de ellas el producto de este gen. La proteína codificada, que se localiza principalmente en los ribosomas, probablemente regula la transcripción a nivel de la elongación del ARNm. Se han encontrado al menos tres variantes de transcripción que codifican tres isoformas diferentes para este gen. [ 7 ]
Interacciones
Se ha demostrado que ILF3 interactúa con:
Los ARN pequeños asociados a NF90/ILF3 (snaR) (de aproximadamente 120 nucleótidos de longitud) interactúan con los motivos de unión a ARN de doble cadena de ILF3. [ 17 ] snaR-A es abundante en el testículo humano y se ha demostrado que se asocia con los ribosomas en células HeLa. snaR-A está presente en humanos y gorilas, pero no en chimpancés. Otros ARN snaR se encuentran en los grandes simios africanos (incluidos el chimpancé y el bonobo). [ 18 ]
ILF2 e ILF3 han sido identificados como autoantígenos en ratones con lupus inducido, [ 19 ] [ 20 ] en la enfermedad autoinmune reumática sistémica canina, [ 21 ] y como un hallazgo raro en humanos con enfermedad autoinmune. [ 22 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000129351 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000032178 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- ↑ Kao PN, Chen L, Brock G, Ng J, Kenny J, Smith AJ, Corthésy B (agosto de 1994). "Clonación y expresión del factor nuclear de células T activadas sensibles a ciclosporina A y FK506: NF45 y NF90" . The Journal of Biological Chemistry . 269 (32): 20691–9 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32048-3 . PMID 7519613 .
- ↑ Matsumoto-Taniura N, Pirollet F, Monroe R, Gerace L, Westendorf JM (septiembre de 1996). "Identificación de nuevas fosfoproteínas de la fase M mediante clonación por expresión" . Biología molecular de la célula . 7 (9): 1455– 69. doi : 10.1091/mbc.7.9.1455 . PMC 275994. PMID 8885239 .
- ↑ "Entrez Gene: ILF3 factor de unión al potenciador de interleucina 3, 90kDa" .
- ↑ Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (enero de 1998). "La proteína quinasa dependiente de ADN interactúa con las proteínas de unión al elemento de respuesta del receptor de antígeno NF90 y NF45" . The Journal of Biological Chemistry . 273 (4): 2136– 45. CiteSeerX 10.1.1.615.1747 . doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054. S2CID 8781571 .
- 1 2 Saunders LR, Perkins DJ, Balachandran S, Michaels R, Ford R, Mayeda A, Barber GN (agosto de 2001). "Caracterización de dos fosfoproteínas nucleares de empalme alternativo conservadas evolutivamente, NFAR-1 y -2, que funcionan en el procesamiento del ARNm e interactúan con la proteína quinasa dependiente de ARN de doble cadena, PKR" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (34): 32300– 12. doi : 10.1074/jbc.M104207200 . PMID 11438536 .
- ↑ Tang J, Kao PN, Herschman HR (junio de 2000). "La proteína arginina metiltransferasa I, la proteína arginina metiltransferasa predominante en las células, interactúa con el factor 3 de unión al potenciador de la interleucina y es regulada por él" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (26): 19866–76 . doi : 10.1074/jbc.M000023200 . PMID 10749851 .
- ↑ Lee J, Bedford MT (marzo de 2002). "PABP1 identificado como un sustrato de arginina metiltransferasa utilizando matrices de proteínas de alta densidad" . EMBO Reports . 3 (3): 268– 73. doi : 10.1093/embo-reports/kvf052 . PMC 1084016. PMID 11850402 .
- ↑ Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (mayo de 1999). "Factor nuclear-90 de las células T activadas: una proteína de unión a ARN de doble cadena y sustrato para la proteína quinasa dependiente de ARN de doble cadena, PKR". Biochemistry . 38 (19): 6361–8 . doi : 10.1021/bi982410u . PMID 10320367 .
- ↑ Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (agosto de 2001). "El factor nuclear 90 es un sustrato y regulador de la proteína quinasa activada por ARN bicatenario del factor de iniciación 2 eucariótico" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 32522–30 . doi : 10.1074/jbc.M104408200 . PMID 11438540 .
- ↑ Patel RC, Vestal DJ, Xu Z, Bandyopadhyay S, Guo W, Erme SM, Williams BR, Sen GC (julio de 1999). "DRBP76, una proteína nuclear de unión a ARN de doble cadena, es fosforilada por la proteína quinasa inducida por interferón, PKR" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (29): 20432–7 . doi : 10.1074/jbc.274.29.20432 . PMID 10400669 .
- ↑ Brownawell AM, Macara IG (enero de 2002). "Exportina-5, una nueva carioferina, media la exportación nuclear de proteínas de unión a ARN de doble cadena" . The Journal of Cell Biology . 156 (1): 53– 64. doi : 10.1083/jcb.200110082 . PMC 2173575. PMID 11777942 .
- ↑ Chu L, Su MY, Maggi LB, Lu L, Mullins C, Crosby S, Huang G, Chng WJ, Vij R, Tomasson MH (agosto de 2012). "La translocación cromosómica asociada al mieloma múltiple activa el snoRNA huérfano ACA11 para suprimir el estrés oxidativo" . The Journal of Clinical Investigation . 122 (8): 2793– 806. doi : 10.1172/jci63051 . PMC 3408744. PMID 22751105 .
- ↑ Parrott AM, Mathews MB (2007). "Nuevos ARN de homínidos de rápida evolución se unen al factor nuclear 90 y muestran una distribución restringida a los tejidos" . Nucleic Acids Research . 35 (18): 6249– 58. doi : 10.1093/nar/gkm668 . PMC 2094060. PMID 17855395 .
- ↑ Parrott AM, Tsai M, Batchu P, Ryan K, Ozer HL, Tian B, Mathews MB (marzo de 2011). "La evolución y expresión de la familia snaR de ARN pequeños no codificantes" . Nucleic Acids Research . 39 (4): 1485– 500. doi : 10.1093 / nar/gkq856 . PMC 3045588. PMID 20935053 .
- ↑ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (diciembre de 1999). "Los autoanticuerpos definen una familia de proteínas con dominios de unión a ARN de doble cadena conservados, así como actividad de unión al ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598– 604. doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923 .
- ↑ Kuroda Y, Ono N, Akaogi J, Nacionales DC, Yamasaki Y, Barker TT, Reeves WH, Satoh M (febrero de 2006). "Inducción de autoanticuerpos específicos relacionados con el lupus por inflamación no específica causada por una inyección intraperitoneal de n-hexadecano en ratones BALB/c". Toxicology . 218 ( 2–3 ): 186–96 . Bibcode : 2006Toxgy.218..186K . doi : 10.1016/j.tox.2005.10.011 . PMID 16309812 .
- ^ Bremer HD, Landegren N, Sjöberg R, Hallgren Å, Renneker S, Lattwein E, Leonard D, Eloranta ML, Rönnblom L, Nordmark G, Nilsson P, Andersson G, Lilliehöök I, Lindblad-Toh K, Kämpe O, Hansson-Hamlin H (marzo de 2018). "ILF2 e ILF3 son autoantígenos en la enfermedad autoinmune sistémica canina" . Informes científicos . 8 (1) 4852. Código Bib : 2018NatSR...8.4852B . doi : 10.1038/s41598-018-23034-w . PMC 5859008 . PMID 29556082 .
- ↑ Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (diciembre de 1999). "Los autoanticuerpos definen una familia de proteínas con dominios de unión a ARN de doble cadena conservados, así como actividad de unión al ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598– 604. doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923 .
Lecturas adicionales
- St Johnston D, Brown NH, Gall JG, Jantsch M (noviembre de 1992). "Un dominio conservado de unión a ARN de doble cadena" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 89 (22): 10979– 83. Bibcode : 1992PNAS...8910979S . doi : 10.1073/pnas.89.22.10979 . PMC 50466. PMID 1438302 .
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (abril de 1996). "Un método de "doble adaptador" para la construcción mejorada de bibliotecas de secuenciación aleatoria". Analytical Biochemistry . 236 (1): 107–13 . doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (septiembre de 1996). "Normalización y sustracción: dos enfoques para facilitar el descubrimiento de genes" . Genome Research . 6 (9): 791– 806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (abril de 1997). "Secuenciación de ADNc por concatenación a gran escala" . Genome Research . 7 (4): 353–8 . doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146. PMID 9110174 .
- Ting NS, Kao PN, Chan DW, Lintott LG, Lees-Miller SP (enero de 1998). "La proteína quinasa dependiente de ADN interactúa con las proteínas de unión al elemento de respuesta del receptor de antígeno NF90 y NF45" . The Journal of Biological Chemistry . 273 (4): 2136– 45. CiteSeerX 10.1.1.615.1747 . doi : 10.1074/jbc.273.4.2136 . PMID 9442054. S2CID 8781571 .
- Marcoulatos P, Avgerinos E, Tsantzalos DV, Vamvakopoulos NC (mayo de 1998). "Mapeo del gen del factor de unión potenciador de interleucina 3 (ILF3) al cromosoma 19 humano (19q11-qter y 19p11-p13.1) mediante amplificación por reacción en cadena de la polimerasa de plantillas de ADN híbrido de células somáticas humanas-roentes". Journal of Interferon & Cytokine Research . 18 (5): 351– 5. doi : 10.1089/jir.1998.18.351 . PMID 9620363 .
- Aoki Y, Zhao G, Qiu D, Shi L, Kao PN (diciembre de 1998). "El regulador transcripcional de caja de purina sensible a CsA en células epiteliales bronquiales contiene NF45, NF90 y Ku". The American Journal of Physiology . 275 (6 Pt 1): L1164–72. doi : 10.1152/ajplung.1998.275.6.L1164 . PMID 9843854. S2CID 4401714 .
- Langland JO, Kao PN, Jacobs BL (mayo de 1999). "Factor nuclear-90 de las células T activadas: una proteína de unión a ARN de doble cadena y sustrato para la proteína quinasa dependiente de ARN de doble cadena, PKR". Biochemistry . 38 (19): 6361–8 . doi : 10.1021/bi982410u . PMID 10320367 .
- Patel RC, Vestal DJ, Xu Z, Bandyopadhyay S, Guo W, Erme SM, Williams BR, Sen GC (julio de 1999). "DRBP76, una proteína nuclear de unión a ARN de doble cadena, es fosforilada por la proteína quinasa inducida por interferón, PKR" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (29): 20432–7 . doi : 10.1074/jbc.274.29.20432 . PMID 10400669 .
- Satoh M, Shaheen VM, Kao PN, Okano T, Shaw M, Yoshida H, Richards HB, Reeves WH (diciembre de 1999). "Los autoanticuerpos definen una familia de proteínas con dominios conservados de unión a ARN de doble cadena, así como actividad de unión al ADN" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34598– 604. doi : 10.1074/jbc.274.49.34598 . PMID 10574923 .
- Xu YH, Grabowski GA (diciembre de 1999). "Clonación molecular y caracterización de una proteína inhibidora de la traducción que se une a secuencias codificantes de la beta-glucosidasa ácida humana y otros ARNm". Molecular Genetics and Metabolism . 68 (4): 441– 54. doi : 10.1006/mgme.1999.2934 . PMID 10607473 .
- Coolidge CJ, Patton JG (marzo de 2000). "Una nueva proteína de unión a ARN de doble cadena que interactúa con PKR" . Nucleic Acids Research . 28 (6): 1407–17 . doi : 10.1093/nar/28.6.1407 . PMC 111047. PMID 10684936 .
- Tang J, Kao PN, Herschman HR (junio de 2000). "La proteína arginina metiltransferasa I, la proteína arginina metiltransferasa predominante en las células, interactúa con el factor 3 de unión al potenciador de la interleucina y es regulada por él" . The Journal of Biological Chemistry . 275 (26): 19866–76 . doi : 10.1074/jbc.M000023200 . PMID 10749851 .
- Saunders LR, Jurecic V, Barber GN (enero de 2001). "Las proteínas NFAR humanas de 90 y 110 kDa se traducen a partir de dos ARNm con empalme diferencial codificados en el cromosoma 19p13". Genomics . 71 (2): 256–9 . doi : 10.1006/geno.2000.6423 . PMID 11161820 .
- Duchange N, Pidoux J, Camus E, Sauvaget D (diciembre de 2000). "Empalme alternativo en el gen del factor de unión al potenciador de interleucina 3 (ILF3) humano". Gene . 261 (2): 345– 53. doi : 10.1016/S0378-1119(00)00495-9 . PMID 11167023 .
- Saunders LR, Perkins DJ, Balachandran S, Michaels R, Ford R, Mayeda A, Barber GN (agosto de 2001). "Caracterización de dos fosfoproteínas nucleares de empalme alternativo conservadas evolutivamente, NFAR-1 y -2, que funcionan en el procesamiento del ARNm e interactúan con la proteína quinasa dependiente de ARN de doble cadena, PKR" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (34): 32300– 12. doi : 10.1074/jbc.M104207200 . PMID 11438536 .
- Parker LM, Fierro-Monti I, Mathews MB (agosto de 2001). "El factor nuclear 90 es un sustrato y regulador de la proteína quinasa activada por ARN bicatenario del factor de iniciación 2 eucariótico" . The Journal of Biological Chemistry . 276 (35): 32522–30 . doi : 10.1074/jbc.M104408200 . PMID 11438540 .
- Reichman TW, Muñiz LC, Mathews MB (enero de 2002). "La proteína de unión al ARN factor nuclear 90 funciona como regulador tanto positivo como negativo de la expresión génica en células de mamíferos" . Biología Molecular y Celular . 22 (1): 343– 56. doi : 10.1128/MCB.22.1.343-356.2002 . PMC 134226. PMID 11739746 .
Enlaces externos
- ILF3+proteína,+humana en los Encabezamientos de Materias Médicas (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU.
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público .
- Genes en el cromosoma 19 humano
- Factores de transcripción