Articulo de referencia

Gradiente de pH inmovilizado

Estructura general de la inmobilina. [ 1 ] En la química de reacciones ácido-base , los geles de gradiente de pH inmovilizado ( IPG ) son matrices de gel de acrilamida copolimer...

Estructura general de la inmobilina. [ 1 ]

En la química de reacciones ácido-base , los geles de gradiente de pH inmovilizado ( IPG ) son matrices de gel de acrilamida copolimerizadas con el gradiente de pH , lo que da como resultado gradientes completamente estables excepto para los valores de pH más alcalinos (>12). El gradiente de pH inmovilizado se obtiene mediante el cambio continuo en la proporción de Immobilinas . Una Immobilina es un ácido o base débil definido por su valor de pK. [ 2 ] Los gradientes de pH inmovilizados (IPG) se elaboran mezclando dos tipos de acrilamida, una con Immobilina con propiedades amortiguadoras ácidas y otra con propiedades amortiguadoras básicas. [ 3 ] Las concentraciones de los amortiguadores en las dos soluciones definen el rango y la forma del gradiente de pH producido. Ambas soluciones contienen monómeros de acrilamida y catalizadores. Durante la polimerización, la porción de acrilamida de los amortiguadores se copolimeriza con los monómeros de acrilamida y bisacrilamida para formar un gel de poliacrilamida. Estos geles polimerizados están reforzados con un soporte a base de plástico que facilita su manipulación y mejora el rendimiento de los IPG. El gel se lava posteriormente para eliminar los catalizadores y los monómeros no polimerizados , que interfieren con la separación isoeléctrica. La IPG aumentó la reproducibilidad [ 4 ] [ 5 ] del enfoque isoeléctrico y la electroforesis en gel 2D . Otras ventajas son una mayor resolución [ 6 ] , una separación reproducible de proteínas alcalinas [ 7 ] y una mayor capacidad de carga (hasta 10 mg) [ 8 ] . 

Este método alternativo elimina los problemas de inestabilidad del gradiente y la baja capacidad de carga de la muestra asociados con el gradiente de pH del anfolito portador . [ 9 ] Hay geles IPG prefabricados disponibles comercialmente.

Referencias

  1. Görg, Angelika; Weiss, Walter; Dunn, Michael J. (1 de diciembre de 2004). "Tecnología actual de electroforesis bidimensional para proteómica". Proteomics . 4 (12): 3665– 3685. doi : 10.1002/pmic.200401031 . ISSN 1615-9853 . PMID 15543535 .  
  2. Barnes et al., Electroforesis en la práctica: Guía de teoría y práctica. Página 44. VCH Publishers Inc, 1993 (EE. UU.)
  3. Görg, Angelika; Weiss, Walter; Dunn, Michael J. (1 de diciembre de 2004). "Tecnología actual de electroforesis bidimensional para proteómica". Proteomics . 4 (12): 3665– 3685. doi : 10.1002/pmic.200401031 . ISSN 1615-9853 . PMID 15543535 .  
  4. Corbett, JM; Dunn, MJ; Posch, A.; Görg, A. (1994-09-01). "Reproducibilidad posicional de manchas de proteínas en electroforesis bidimensional en gel de poliacrilamida utilizando enfoque isoeléctrico con gradiente de pH inmovilizado en la primera dimensión: una comparación interlaboratorio". Electrophoresis . 15 ( 8– 9): 1205– 1211. doi : 10.1002/elps.11501501182 . ISSN 0173-0835 . PMID 7532129 .  
  5. Blomberg, A.; Blomberg, L.; Norbeck, J.; Fey, SJ; Larsen, PM; Larsen, M.; Roepstorff, P.; Degand, H.; Boutry, M. (1995-10-01). "Reproducibilidad interlaboratorial de patrones de proteínas de levadura analizados mediante electroforesis bidimensional en gel con gradiente de pH inmovilizado". Electrophoresis . 16 (10): 1935– 1945. doi : 10.1002/elps.11501601320 . ISSN 0173-0835 . PMID 8586069 .  
  6. Wildgruber, R.; Harder, A.; Obermaier, C.; Boguth, G.; Weiss, W.; Fey, SJ; Larsen, PM; Görg, A. (2000-07-01). "Hacia una mayor resolución: electroforesis bidimensional de proteínas de Saccharomyces cerevisiae utilizando gradientes de pH inmovilizados estrechos superpuestos". Electrophoresis . 21 (13): 2610– 2616. doi : 10.1002/1522-2683(20000701)21:13 < 2610::AID-ELPS2610 > 3.0.CO ; 2-H . ISSN 0173-0835 . PMID 10949137 .  
  7. Wildgruber, Robert; Reil, Gerold; Drews, Oliver; Parlar, Harun; Görg, Angelika (2002-06-01). "Base de datos bidimensional basada en la web de proteínas de Saccharomyces cerevisiae utilizando gradientes de pH inmovilizados de pH 6 a pH 12 y espectrometría de masas de tiempo de vuelo con desorción/ionización láser asistida por matriz". Proteomics . 2 (6): 727– 732. doi : 10.1002/1615-9861(200206)2:6 < 727::AID-PROT727 > 3.0.CO ; 2-2 . ISSN 1615-9853 . PMID 12112855 .  
  8. Görg, A.; Postel, W.; Friedrich, C.; Kuick, R.; Strahler, JR; Hanash, SM (1991-09-01). "Variabilidad posicional de puntos dependiente de la temperatura en patrones polipeptídicos bidimensionales". Electrophoresis . 12 (9): 653– 658. doi : 10.1002/elps.1150120910 . ISSN 0173-0835 . PMID 1752246 .  
  9. Wilkins et al., Investigación del proteoma: Nuevas fronteras en la genómica funcional. Página 14. Springer, 1997 (Alemania)