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células KBM-7

Las células KBM-7 son una línea celular de leucemia mieloide crónica (LMC) utilizada para la investigación biomédica. Como todas las líneas celulares cancerosas , es inmortal y ...

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Las células KBM-7 son una línea celular de leucemia mieloide crónica (LMC) utilizada para la investigación biomédica. Como todas las líneas celulares cancerosas , es inmortal y puede dividirse indefinidamente. Un aspecto único de la línea celular KBM-7 es que es casi haploide , lo que significa que contiene solo una copia de la mayoría de sus cromosomas. [ 1 ] Los cromosomas humanos son típicamente diploides, lo que significa que hay dos copias de cada cromosoma.

Origen

Las células KBM-7 se derivaron de un hombre de 39 años con leucemia mieloide crónica en crisis blástica. [ 1 ] La línea celular original contenía clones casi haploides e hiperdiploides. La subclonación posterior produjo una línea celular casi haploide pura (subclon P1-55). [ 2 ] El análisis del genoma ha revelado que, además del cromosoma 8 disómico, un fragmento de 30 megabases del cromosoma 15 está presente en dos copias. [ 3 ] Al igual que otras líneas celulares de LMC (p. ej., K562 ), las células KBM-7 son positivas para el cromosoma Filadelfia que alberga la fusión oncogénica BCR-ABL.

Cariotipo

El subclón P1-55 ha sido descrito con un cariotipo de "25,XY,+8,Ph(+)", lo que significa que tiene 25 cromosomas, incluyendo una copia de cada uno de los cromosomas del 1 al 22, X e Y, una copia extra del 8, y que tiene el reordenamiento de Filadelfia. [ 2 ] Según las reglas del Sistema Internacional de Nomenclatura Citogenómica Humana de 2024, esto debería escribirse como 25,X,+Y,t(9;22)(q34;q11). [ 4 ] Teniendo en cuenta otras variaciones conocidas, el cariotipo completo es ish 25,X,+Y,+8,t(9;22)(q34;q11),ins(19;15)(p13.1;q22q25). [ 5 ] seq inv(12)(12q14.2), arr[GRCh37] 8 × 2,15q(61109318_89880624) × 2,11p(46442526_46578400) × 0. [ 3 ] : Supp.Fig.8,Supp.Tbl.1 Esta notación describe la inserción de una parte del cromosoma 15 en el cromosoma 19; una inversión en el cromosoma 12 detectada por secuenciación (que afecta a PPM1H y SRGAP1 ); duplicación del cromosoma 8 y una parte del cromosoma 15 detectada por microarray; y deleción de una parte del cromosoma 11 detectada por microarray (que incluye AMBRA1 ). [ 3 ]

La pérdida del cromosoma Y ocurre con frecuencia. [ 3 ]

Líneas celulares derivadas

Las células KBM-7 se han reprogramado para generar la línea celular HAP1 . Esta tiene un fenotipo similar al de los fibroblastos , no expresa marcadores de células sanguíneas y ha perdido la copia adicional del cromosoma 8 y la única copia del cromosoma Y. [ 6 ]

Cultivo y aplicaciones

Las células KBM-7 crecen en suspensión y se mantienen en medio de cultivo Iscove's Modified Dulbecco's Medium (IMDM) suplementado con 10 % de suero fetal bovino . Se dividen aproximadamente cada 24 horas.

KBM-7 ha encontrado aplicaciones en diversos estudios de investigación genómica; la línea celular se ha examinado en experimentos de silenciamiento génico , se ha reprogramado para convertirse en una línea de células madre y ha servido como modelo de prueba para nuevos fármacos candidatos. [ 7 ]

Significado

Un método para estudiar la función génica consiste en "inactivar" el gen mediante la inducción de una mutación. Esto provoca que el producto génico resultante sea no funcional, y los investigadores pueden observar cómo afecta esto a la función celular en su conjunto. Muchos procedimientos de edición genética tienen una eficiencia muy baja, y a menudo es necesario inactivar ambas copias de los cromosomas de los mamíferos para observar un efecto fenotípico. Disponer de una línea celular casi haploide como KBM-7 aumenta considerablemente la eficiencia de estos estudios, ya que solo es necesario inactivar un gen. [ 8 ]

Referencias

  1. 1 2 Andersson, BS, Beran, M., Pathak, S., Goodacre, A., Barlogie, B., y McCredie, KB (1987). "Leucemia mieloide crónica Ph-positiva con conversión casi haploide in vivo y establecimiento de una línea celular de crecimiento continuo con un patrón citogenético similar". Cancer Genet. Cytogenet . 24 (2): 335– 343. doi : 10.1016/0165-4608(87)90116-6 . PMID 3466682 . {{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  2. 1 2 Kotecki M, Reddy PS, Cochran BH (1999). "Aislamiento y caracterización de una línea celular humana casi haploide". Exp. Cell Res . 252 (2): 273– 80. CiteSeerX 10.1.1.24.783 . doi : 10.1006/excr.1999.4656 . PMID 10527618 .  
  3. 1 2 3 4 Bürckstümmer T, Banning C, Hainzl P, Schobesberger R, Kerzendorfer C, Pauler FM, Chen D, Them N, Schischlik F, Rebsamen M, Smida M, Fece de la Cruz F, Lapao A, Liszt M, Eizinger B, Guenzl PM, Blomen VA, Konopka T, Gapp B, Parapatics K, Maier B, Stöckl J, Fischl W, Salic S, Taba Casari MR, Knapp S, Bennett KL, Bock C, Colinge J, Kralovics R, Ammerer G, Casari G, Brummelkamp TR, Superti-Furga G, Nijman SM (2013). "Una colección de trampas genéticas reversibles potencia la genética haploide en las células humanas" . Métodos Nat . 10 (10): 965– 71. doi : 10.1038/nmeth.2609 . PMC 6342250 . PMID 24161985 .  
  4. ↑ "ISCN 2024 – Un sistema internacional para la nomenclatura citogenómica humana (2024)" . Cytogenetic and Genome Research . 164 (1): 1– 224. 20 de noviembre de 2024. doi : 10.1159/000538512 . PMID 39571546 . 
  5. ↑ Banerjee, Ruby; Sotero-Caio, Cibele G.; Fu, Beiyuan; Yang, Fengtang (26 de octubre de 2022). " Inestabilidad cromosómica (CIN) en líneas celulares HAP1 revelada por hibridación fluorescente in situ multiplex (M-FISH)" . Molecular Cytogenetics . 15 (1) 46. doi : 10.1186/s13039-022-00625-x . PMC 9609465. PMID 36289492 .  
  6. ↑ Carette JE, Raaben M, Wong AC, Herbert AS, Obernosterer G, Mulherkar N, Kuehne AI, Kranzusch PJ, Griffin AM, Ruthel G, Dal Cin P, Dye JM, Whelan SP, Chandran K, Brummelkamp TR (2011). "La entrada del virus del Ébola requiere el transportador de colesterol Niemann-Pick C1" . Nature . 477 ( 7364): 340–3 . Bibcode : 2011Natur.477..340C . doi : 10.1038/nature10348 . PMC 3175325. PMID 21866103 .  
  7. ↑ Essletzbichler, Patrick; et al. (diciembre de 2014). "Eliminación a escala de megabases mediante CRISPR/Cas9 para generar una línea celular humana completamente haploide" . Genome Research . 24 (12): 2059–206 . doi : 10.1101/gr.177220.114 . PMC 4248322. PMID 25373145 .   
  8. ↑ Duncan, Lidia M.; Timms, Richard T.; Zavodszky, Eszter; Cano, Florencia; Dougan, Gordon; Randow, Felix; Lehner, Paul J. (2012-06-22). "La selección fenotípica basada en fluorescencia permite realizar cribados genéticos directos en células humanas haploides" . PLOS ONE . 7 (6) e39651. Bibcode : 2012PLoSO...739651D . doi : 10.1371/journal.pone.0039651 . ISSN 1932-6203 . PMC 3382162. PMID 22745803 .   
  • Entrada de Cellosaurus para KBM-7