Hispanopedia WikiLa proteína similar a CRACD , anteriormente conocida como KIAA1211L , es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen CRACDL . Se expresa en gran medida en la corteza cerebral del cerebro. [5] Además, se localiza en los microtúbulos y los centrosomas y se encuentra subcelularmente en el núcleo . [6] [7] Finalmente, la CRACDL está asociada con ciertos trastornos mentales y varios tipos de cáncer. [8] [9]
Gene
CRACDL es un gen codificador de proteínas. [10] La tabla anterior presenta el alias, la ubicación, el tamaño y el número de acceso del gen.
ARNm
Hay 11 isoformas de empalme del CRACDL . [5] La isoforma validada tiene 10 exones. [5]
Proteína
La tabla anterior presenta el alias, el tamaño y el número de acceso de la proteína. La proteína CRACD-L es rica en prolina y pobre en asparagina, isoleucina, fenilalanina y tirosina. [12]
Dominios y motivos
La proteína CRACD-L tiene un dominio llamado motivo DUF4592 y abarca los aminoácidos 131-239. [14] Este dominio está altamente conservado entre los ortólogos de CRACDL . El motivo DUF4592 se representa tanto en la traducción conceptual como en las figuras esquemáticas.
Modificaciones postraduccionales
La CRACDL está fosforilada en los aminoácidos Ser92 y Ser490. [15] También se predice que la proteína KIAA1211L tiene cinco sitios de SUMOilación diferentes ubicados en Lys134, Lys375, Lys866, Lys874 y Lys914. [16] Tanto los sitios fosforilados como los sitios de SUMOilación se representan en la traducción conceptual y las figuras esquemáticas.
Estructura secundaria
La estructura secundaria prevista de la proteína CRACD-L está compuesta por un 50 % de hélices alfa , un 8,9 % de láminas beta y un 17,9 % de giros. [17] El elevado número de giros es coherente con el hecho de que CRACD-L es rico en prolina . [12]
Ubicación subcelular
Se predice que la proteína CRACD-L se encuentra en el núcleo . [7] También se predice que los ortólogos, incluido el tiburón elefante, el caballo, la paloma bravía y el chimpancé, se encuentran en el núcleo. [7] La señal de ubicación nuclear se encuentra en los aminoácidos 25-43, que se representa tanto en la traducción conceptual como en las figuras esquemáticas. [7] Esta señal se conserva en todos los ortólogos. Además, esta ubicación (aminoácidos 24-43) está cargada positivamente, probablemente debido a la gran cantidad de lisina en esta ubicación. [12] Finalmente, se predice que CRACD-L se localiza principalmente en los microtúbulos y el centrosoma y, a veces, en el puente citocinético . [6]
Expresión
El gen se expresa en gran medida en la corteza cerebral del cerebro . [5] La proteína CRACD-L se encuentra en muchos tipos de tejidos diferentes, incluidos el cerebro, el hipocampo, el pulmón, el carcinoma de mama, los islotes de Langerhans, el páncreas, el riñón y otros 38 tejidos. [18] Además, se expresa en una cantidad promedio en comparación con otras proteínas humanas. [19]
Regulación de la transcripción
La región promotora de CRACDL tiene aproximadamente 1340 pares de bases con varios factores de transcripción predichos . [20] Las células gliales que carecen del homólogo 1 y los factores de transcripción del linaje de oligodendrocitos son notables porque CRACDL se expresa altamente en el cerebro. [20] [5] Además, el receptor alfa relacionado con el estrógeno también es un factor de transcripción notable debido a los bajos niveles de expresión de CRACDL cuando se inhiben los receptores de estrógeno. [21] [20] Además, se predice que CRACDL está SUMOilado. [16] Se predice que el 3' UTR de CRACDL será el objetivo de miRNA-132 , que se representa en la figura de traducción conceptual. [22]
Función
Proteínas interactuantes
Glucógeno sintetasa quinasa 3 beta (GSK3B)
La GSK3B es una proteína quinasa que regula los factores de transcripción y los microtúbulos. [23] Como tal, fosforila proteínas, disminuyendo su capacidad para unirse y estabilizar los microtúbulos. [23] Las proteínas que fosforila son los componentes principales de los ovillos neurofibrilares en la enfermedad de Alzheimer. [23] La proteína es necesaria para el establecimiento de la polaridad neuronal y el crecimiento axonal y fosforila proteínas en las células del neuroblastoma. [23] Además, está asociada con la enfermedad bipolar y es activa en las células del cáncer de mama. [23] [24]
Como tal, la interacción predicha entre CRACDL y GSK3B es probable porque CRACDL se expresa altamente en el cerebro, se asocia con el trastorno bipolar y el cáncer de mama, y se localiza en los microtúbulos. [5] [6] [8] [9] La interacción entre GSK3B y CRACDL se predijo utilizando co-inmunoprecipitación anti-cebo, pull down, purificación por afinidad en tándem, espectroscopia de polarización de fluorescencia, ensayo de proteínas quinasas, dos híbridos y experimentos de microscopía confocal. [25]
También se predice que la proteína CRACD-L interactúa con la alfa-sinucleína (SNCA), la ligasa de proteína ubiquitina E3 Mdm2 (MDM2) , la serina/treonina-proteína quinasa PAK 1 (PAK 1) y el factor de replicación de ADN Cdt1 (CDT1) . [25]
Importancia clínica
La CRACDL está asociada con la depresión, el trastorno bipolar y la esquizofrenia. [9] Además, la CRACDL está asociada con varios tipos de cáncer, incluidos el cáncer de ovario, de mama, etc. [8]
Homología
Parálogos
KIAA1211 es el parálogo de KIAA1211L. KIAA1211 se encuentra en el cromosoma 4 y tiene 1233 aminoácidos. [26] Su porcentaje de identidad con KIAA1211L es del 21%. [27] KIAA1211 tiene un ortólogo en la bacteria Proteus vulgaris, lo que indica que el parálogo se duplicó hace 4290 millones de años, antes de KIAA1211L. [28] [29]
Ortólogos
A continuación se muestra la tabla de varios ortólogos de KIAA1211L. Incluye ortólogos relacionados de manera cercana, intermedia y distante. El ortólogo más distante es el tiburón elefante, lo que indica que KIAA1211L se duplicó hace 473 millones de años. Los aminoácidos conservados entre todos los ortólogos de KIAA1211L se representan en la traducción conceptual.
Filogenia
El gen CRACDL es similar y se conserva en mamíferos, aves, reptiles, anfibios y peces. No se conserva en bacterias, arqueas, protistas, plantas, hongos, trichoplax e invertebrados.
Citas
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