Kinome

En biología molecular , bioquímica y señalización celular, el kinoma de un organismo es el conjunto completo de quinasas de proteínas codificadas en su genoma . Las quinasas son enzimas que catalizan reacciones de fosforilación (de aminoácidos) y se dividen en varios grupos y familias, por ejemplo, las que fosforilan los aminoácidos serina y treonina , las que fosforilan la tirosina y algunas que pueden fosforilar ambos, como las familias MAP2K y GSK. El término fue utilizado por primera vez en 2002 por Gerard Manning y sus colegas en dos artículos que analizaban las 518 quinasas de proteínas humanas, y se refiere tanto a las quinasas de proteínas como a las pseudoquinasas de proteínas ^{[ 1 ]} y su evolución en los eucariotas. ^{[ 2 ]} Se han determinado otros kinomas para el arroz, ^{[ 3 ]} varios hongos, nematodos e insectos, erizos de mar , ^{[ 4 ]} Dictyostelium discoideum , ^{[ 5 ]} y el proceso de infección por Mycobacterium tuberculosis . ^{[ 6 ]} Aunque la secuencia primaria de las proteínas quinasas muestra una divergencia sustancial entre eucariotas no relacionados, y las diferencias de aminoácidos en los motivos catalíticos han permitido la separación de sus kinomas en subtipos canónicos y pseudoquinasas , ^{[ 7 ]} la variación encontrada en los motivos de aminoácidos adyacentes al sitio de fosforilación real de sustratos por quinasas eucariotas es mucho menor. ^{[ 8 ]}

Dado que las quinasas son un objetivo farmacológico importante y un punto de control clave en el comportamiento celular, el quinoma también ha sido objeto de estudios de genómica funcional a gran escala con cribados de ARN de interferencia y de esfuerzos para el descubrimiento de fármacos, especialmente en la terapéutica del cáncer. ^{[ 9 ]}

En los animales, el quinoma incluye quinasas que fosforilan solo tirosina (tirosina quinasas), aquellas que actúan sobre serina o treonina, y algunas clases, como GSK3 y MAP2K, que pueden actuar sobre ambas. Las investigaciones han demostrado que existen dominios proteicos especializados que se unen a residuos de serina y treonina fosforilados, como los dominios BRCA y FHA .

• quinasa
• Pseudocinasa
• Pseudoenzima
• Fosfatoma
• fosfatasa de proteínas

• KinBase
• Base de datos del quinoma del arroz