LENG9

LENG9 se localiza en 19q13.42 en el cromosoma 19, abarcando la cadena codificante (-) desde 54.461.796 pb hasta 54.463.711 pb. ^{[ 5 ]} El gen LENG9 tiene una longitud de 1.930 pares de bases y contiene un exón. ^{[ 1 ] [ 2 ]}

Los genes LENG8-AS1 y CDC42EP5 son vecinos de LENG9 en el cromosoma 19. ^{[ 2 ]} CDC42EP5 se extiende sobre la misma región que LENG9, mientras que LENG8-AS1 se encuentra a la izquierda de ambos genes. ^{[ 5 ]} TTYH1 y LENG8 también se encuentran en la misma vecindad genética, pero se ubican en la hebra opuesta.

LENG9 se expresa en gran medida (75-100%) en los músculos esqueléticos y en parte del tejido hepático fetal, mientras que su expresión es ubicua y moderada (50-75%) en todos los demás tejidos observados. ^{[ 6 ] [ 7 ]} La expresión humana de LENG9 se observa en el cuello uterino, los pulmones y la placenta de adultos. ^{[ 8 ]} El gen también se expresa en estados patológicos, incluidos tumores pulmonares y tumores neuroectodérmicos primitivos , que suelen encontrarse en niños o adultos jóvenes. Sin embargo, LENG9 no se expresa durante la etapa juvenil del desarrollo. ^{[ 8 ]}

Se predice que la región promotora tiene una longitud de 1101 pares de bases. ^{[ 9 ]} El sitio de inicio de la transcripción encontrado en esta región se ubica 119 pb corriente arriba del codón de inicio ^{[ 1 ]} así como un codón de parada en fase entre 1087 pb y 1089 pb. ^{[ 5 ]}

En humanos, LENG9 tiene dos variantes de transcripción de ARNm no empalmado . ^{[ 5 ]} La variante (1) es la transcripción más larga y más conservada del gen y está compuesta por un exón que consta de 1919 pb.

LENG9 tiene una longitud de 501 aminoácidos, con un peso molecular predicho de 53,2 kDa. ^{[ 10 ]} Se predice que el punto isoeléctrico de la proteína LENG9 es 7,7. ^{[ 11 ]} No se encontraron secuencias transmembrana conocidas para LENG9. ^{[ 12 ]}

Se realizó un análisis de la proteína LENG9 comparándola con la base de datos "humana" ^{[ 10 ]} , la cual indicó una mayor frecuencia de los aminoácidos alanina y prolina que la de una proteína humana normal. Por el contrario, se detectó una frecuencia anormalmente baja de los aminoácidos aspartato, isoleucina, metionina, asparagina, serina y tirosina.

Se predice que la estructura secundaria de LENG9 está compuesta por hélices alfa y láminas beta a lo largo de toda la secuencia. ^{[ 14 ] [ 13 ] [ 15 ]} La estructura terciaria de LENG9 se muestra en la imagen de la derecha.

Un péptido señal fuerte detectado en la región mitocondrial (0,788) sugiere que la proteína LENG9 se localiza en la matriz mitocondrial . ^{[ 12 ]} Sin embargo, un análisis posterior entre otros ortólogos de mamíferos predijo una localización subcelular en el citoplasma y una localización nuclear para Danio rerio . ^{[ 12 ] [ 16 ]}

Se prevé que LENG9 sufra modificaciones postraduccionales como fosforilación , acetilación N-terminal , sumoilación y modificación del anclaje de glicosilfosfatidilinositol (GPI) C-terminal.

LENG9 posee tres dominios conservados. El dominio de dedo de zinc de unión a iones metálicos ZnF_C3H1 ^{[ 22 ]} se encuentra entre los aminoácidos 46 y 61. LENG9 también tiene un dominio de función desconocida perteneciente a la familia de dominios DUF504, que abarca desde el aminoácido 109 hasta el 160. El último dominio conservado se extiende desde el aminoácido 320 hasta el 500 y se conoce como dominio similar a la ARN ligasa 2'5' de AKAP7 (AKAP7_NLS). ^{[ 5 ] [ 23 ]}

Las repeticiones conservadas WD40 se encuentran en LENG9, abarcando desde el aminoácido 98 hasta el 159. ^{[ 13 ] [ 24 ]} Este motivo se caracteriza por estructuras de hélice beta en la estructura terciaria.

Se ha descubierto que LENG9 interactúa con la proteína C9ORF41, que codifica la metiltransferasa , implicada en la conversión de carnosina a anserina presente en el músculo esquelético. Otro interactuante es CDC5L , ^{[ 26 ]} que es un regulador positivo del ciclo celular para la transición de la fase G2 a la fase M. ^{[ 27 ]} FOXS1 es otra proteína interactuante que funciona como un represor transcripcional para suprimir promotores como FASLG, FOXO3 y FOXO4. ^{[ 28 ]}

Se encontró que el gen LENG9 se regulaba positivamente y se expresaba en los tejidos del endometrio endotelial (hEEC) durante varias etapas del ciclo menstrual/reproductivo cuando se transfectaba con el gen de ARN miR-30d . ^{[ 3 ] [ 29 ]} Dado que se observa que la sobreexpresión ectópica de miR-30d en los hEEC afecta a los genes asociados al cáncer, se predice que LENG9 desempeña un papel en los trastornos del sistema reproductivo y endocrino.

El análisis de la receptividad endometrial mediante miRNA del endometrio receptivo y prereceptivo de mujeres fértiles también indicó una regulación positiva significativa de miR-30d. ^{[ 4 ]} En consecuencia, la expresión inducida de LENG9 por la transfección de miR-30d sugiere una posible relación entre el gen LENG9 y las funciones de fertilidad femenina.

Se comparó la proteína LENG9 con el fibrinógeno y el citocromo C para observar la tasa de cambio evolutivo. La tasa de cambio relativamente rápida de LENG9, en comparación con la de otras proteínas, sugiere que el gen es adaptativo para estructuras y funciones celulares vitales.

No se conocen parálogos para LENG9. ^{[ 2 ]}

LENG9 está altamente conservado en mamíferos y peces óseos como el pez cebra. ^{[ 24 ]} También está conservado en algunos reptiles y anfibios. ^{[ 31 ]} El gen no está presente en invertebrados, aves, bacterias ni hongos. ^{[ 32 ]}