Lista de software y herramientas de R

Esta es una lista de software y herramientas de programación para el lenguaje de programación R , que incluye entornos de desarrollo integrados (IDE) , gestores de paquetes , bibliotecas , herramientas de depuración , herramientas de computación numérica y científica, y proyectos relacionados.

• Emacs Speaks Statistics (ESS): interfaz de Emacs para R y otros programas estadísticos.
• Jupyter — admite R a través de IRkernel ^{[ 1 ]}
• RKWard — IDE y GUI basados ​​en KDE / Qt para R ^{[ 2 ]}
• RStudio : popular IDE multiplataforma para R
• StatET — IDE basado en Eclipse ^{[ 3 ]}
• Visual Studio Code : admite R mediante extensiones ( R Tools para Visual Studio ).

• Deducer — Interfaz gráfica de usuario y paquete de análisis de datos ^{[ 4 ]}
• jamovi — Entorno estadístico con interfaz gráfica de usuario (GUI) basado en R para el análisis de datos y la realización de pruebas estadísticas ^{[ 5 ]}
• Interfaz gráfica de usuario (GUI) en Java para R : consola, editor de scripts y vista de hoja de cálculo/datos multiplataforma para R.
• Rattle GUI — interfaz gráfica de usuario para minería de datos en R ^{[ 6 ]}
• R Commander (Rcmdr): interfaz gráfica de usuario básica para estadísticas en R, que se utiliza a menudo para la enseñanza y trabajos introductorios.

• CXXR — motor R experimental con código base C++ modernizado ^{[ 7 ]}
• FastR — Implementación del lenguaje R en GraalVM ^{[ 8 ]}
• GNU R — implementación principal de R , mantenida por el Equipo Central de R y distribuida como parte del Proyecto GNU .
• pqR — “R bastante rápida” ^{[ 9 ]}
• Renjin — Intérprete basado en JVM para R

• Bioconductor : repositorio de paquetes R para bioinformática y biología computacional.
• CRAN — Comprehensive R Archive Network, repositorio principal de paquetes de R.
• devtools — simplifica el desarrollo de paquetes R ^{[ 10 ]}
• Knitr : integración de código R en documentos LaTeX , LyX , HTML , Markdown , AsciiDoc y reStructuredText .
• learnr — paquete para crear tutoriales y ejercicios interactivos en R usando R Markdown y Shiny . ^{[ 11 ]}
• Packrat — sistema de gestión de dependencias ^{[ 12 ]}
• renv — sistema de gestión de paquetes específico del proyecto ^{[ 13 ]}
• R CMD build / R CMD check — Herramientas de compilación y validación de paquetes R ^{[ 14 ]}
• Tidyverse : Ggplot2 , dplyr y otros paquetes .

• lme4 — modelos lineales de efectos mixtos ^{[ 15 ]}
• Matriz — cálculos de matrices dispersas y densas ^{[ 16 ]}
• mgcv — modelos aditivos generalizados ^{[ 17 ]}
• nlme — modelos de efectos mixtos no lineales ^{[ 18 ]}
• numDeriv — derivadas numéricas ^{[ 19 ]}
• optim — funciones de optimización integradas ^{[ 20 ]}
• optimx – proporciona un reemplazo y extensión de optim ^{[ 21 ]}
• Rmpfr — aritmética de punto flotante de precisión múltiple ^{[ 22 ]}

• dplyr — kit de herramientas para la manipulación de datos
• edgeR: análisis de expresión diferencial de datos de RNA-seq ^{[ 23 ]}
• pronóstico — pronóstico de series temporales ^{[ 24 ]}
• ggplot2 — visualización de datos basada en la gramática de los gráficos ^{[ 25 ]}
• phyloseq — análisis de datos de censo del microbioma ^{[ 26 ]}
• shiny — aplicaciones web interactivas
• supervivencia — análisis de supervivencia ^{[ 27 ]}
• tidyr — reformateo de datos ordenados ^{[ 28 ]}

• banco: compara y analiza con precisión los tiempos de ejecución ^{[ 29 ]}
• lineprof — herramienta de perfilado línea por línea ^{[ 30 ]}
• microbenchmark — evaluación comparativa ^{[ 31 ]}
• profvis — perfilador interactivo de R ^{[ 32 ]}
• Rcpp — integración de R y C++ para mejorar el rendimiento ^{[ 33 ]}
• Rprof — perfilador integrado de R ^{[ 34 ]}

• BiocParallel: marco de evaluación paralela para R, utilizado en todos los paquetes de Bioconductor . ^{[ 35 ]}
• doParallel: proporciona un backend paralelo para el paquete foreach, lo que permite una fácil ejecución paralela del código R. ^{[ 36 ]}
• foreach — estructura de bucle para ejecución paralela ^{[ 37 ]}
• futuro — computación paralela y distribuida unificada ^{[ 38 ]}
• mirai — marco de evaluación asíncrona minimalista para R ^{[ 39 ]}
• parallel — paquete integrado de R para procesamiento paralelo ^{[ 40 ]}
• Rmpi — Interfaz R para la Interfaz de Paso de Mensajes ^{[ 41 ]}
• nieve — red simple de estaciones de trabajo ^{[ 42 ]}

• caret — entrenamiento y ajuste para modelos de aprendizaje automático ^{[ 43 ]}
• keras: interfaz R para el aprendizaje profundo de Keras ^{[ 44 ]}
• mlbench — colección de conjuntos de datos de referencia artificiales y del mundo real para evaluar algoritmos de aprendizaje automático ^{[ 45 ]}
• mlr — aprendizaje automático ^{[ 46 ]}
• mlr3 — sucesor moderno de mlr ^{[ 47 ]}
• randomForest — aprendizaje de conjunto utilizando bosques aleatorios ^{[ 48 ]}
• tidymodels: colección de paquetes de R para aprendizaje automático y modelado, diseñados con principios de tidyverse . ^{[ 49 ]}
• torch — Interfaz de R para PyTorch ^{[ 50 ]}
• xgboost — marco de potenciación de gradiente con enlaces a R ^{[ 51 ]}

• covr — cobertura de prueba ^{[ 52 ]}
• lintr — análisis de código estático ^{[ 53 ]}
• roxygen2 — generación de documentación para paquetes de R ^{[ 54 ] [ 55 ]}
• styler — formateador de código para scripts y paquetes de R ^{[ 56 ]}

• jaque mate: comprobaciones y aserciones rápidas de argumentos para funciones de R ^{[ 57 ]}
• RUnit: implementación de un marco de pruebas unitarias estándar ^{[ 58 ]}
• testthat — marco de pruebas unitarias ^{[ 59 ] [ 60 ]}
• tinytest — marco de pruebas unitarias ligero ^{[ 61 ]}

• Ciencia de datos
• gretl — software de código abierto para econometría que se puede integrar con R
• Lista de bibliotecas numéricas
• Listas de herramientas de desarrollo de software de programación por lenguaje
• Software estadístico

• awesome-R – Lista de software R en GitHub
• La Red Integral de Archivos R (CRAN)
• Proyecto Bioconductor
• RStudio / IDE Posit
• Proyecto Jupyter