Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

ARN pequeño MicX

El ARN pequeño MicX (anteriormente conocido como A10 ) [ 1 ] es un ARN pequeño no codificante que se encuentra en Vibrio cholerae . [ 2 ] Se le dio el nombre de MicX porque tien...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

El ARN pequeño MicX (anteriormente conocido como A10 ) [ 1 ] es un ARN pequeño no codificante que se encuentra en Vibrio cholerae . [ 2 ] Se le dio el nombre de MicX porque tiene una función similar a MicA, MicC y MicF en E. coli . [ 3 ] El ARN pequeño MicX regula negativamente una proteína de la membrana externa (codificada por VC0972 ) y también un componente de un transportador ABC (gen VC0620 ). [ 4 ] Estas interacciones se predijeron y luego se confirmaron usando un microarreglo de ADN . [ 2 ]

MicX se identificó mediante un análisis bioinformático de V. cholerae, habiendo sido predicho previamente. [ 1 ] Se compararon los niveles de transcripción de este ARN pequeño en diversas condiciones: se encontró que se expresaba en todos los medios probados ; los medios más ricos redujeron ligeramente la transcripción; la represión de ciertos factores sigma (δ S y δ E ) no modificó la transcripción, pero esta se redujo drásticamente en ausencia de la proteína Hfq . [ 2 ] Esta observación concuerda con otros patrones de expresión de ARN pequeños. [ 5 ] [ 6 ]

El gen de ARN MicX se superpone con VCA0943 , un gen que codifica una permeasa transportadora de maltosa , pero la ribonucleasa ARNasa E procesa el transcrito de MicX para crear una forma activa y estable que contiene solo la región 3′ UTR de VCA0943 . [ 2 ]

Véase también

Referencias

  1. 1 2 Livny J, Fogel MA, Davis BM, Waldor MK (2005). "sRNAPredict: un enfoque computacional integrador para identificar sRNAs en genomas bacterianos" . Nucleic Acids Research . 33 (13): 4096– 4105. doi : 10.1093/nar/gki715 . PMC 1180744. PMID 16049021 .  
  2. 1 2 3 4 Davis BM, Waldor MK (julio de 2007). "El procesamiento dependiente de la RNasa E estabiliza MicX, un sRNA de Vibrio cholerae" . Molecular Microbiology . 65 (2): 373–385 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2007.05796.x . PMC 1976385. PMID 17590231 .  
  3. ↑ Mizuno T, Chou MY, Inouye M (abril de 1984). "Un mecanismo único que regula la expresión génica: inhibición traslacional por un transcrito de ARN complementario (microARN)" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 81 (7): 1966– 1970. Bibcode : 1984PNAS...81.1966M . doi : 10.1073/pnas.81.7.1966 . PMC 345417. PMID 6201848 .  
  4. ↑ Song T, Mika F, Lindmark B, Liu Z, Schild S, Bishop A, Zhu J, Camilli A, Johansson J, Vogel J, Wai SN (octubre de 2008). "Un nuevo sRNA de Vibrio cholerae modula la colonización y afecta la liberación de vesículas de la membrana externa" . Molecular Microbiology . 70 (1): 100–111 . doi : 10.1111/j.1365-2958.2008.06392.x . PMC 2628432. PMID 18681937 .  
  5. ↑ Sledjeski DD, Whitman C, Zhang A (marzo de 2001). "Hfq es necesario para la regulación por el ARN no traducido DsrA" . Journal of Bacteriology . 183 (6): 1997–2005 . doi : 10.1128/JB.183.6.1997-2005.2001 . PMC 95095. PMID 11222598 .  
  6. ↑ Massé E, Escorcia FE, Gottesman S (octubre de 2003). "Degradación acoplada de un pequeño ARN regulador y sus ARNm diana en Escherichia coli" . Genes & Development . 17 (19): 2374–2383 . doi : 10.1101/gad.1127103 . PMC 218075. PMID 12975324 .  

Lecturas adicionales

  • Gottesman S (2004). "Los pequeños reguladores de ARN de Escherichia coli: funciones y mecanismos*" . Annual Review of Microbiology . 58 : 303–328 . doi : 10.1146/annurev.micro.58.030603.123841 . PMID 15487940 . 
  • Schlüter JP, Reinkensmeier J, Daschkey S, Evguenieva-Hackenberg E, Janssen S, Jänicke S, Becker JD, Giegerich R, Becker A (abril de 2010). "Un estudio del genoma completo de los sRNA en la alfa-proteobacteria fijadora de nitrógeno simbiótica Sinorhizobium meliloti" . BMC Genomics . 11 245. doi : 10.1186/1471-2164-11-245 . PMC 2873474. PMID 20398411 .  
  • Sittka A, Sharma CM, Rolle K, Vogel J (julio de 2009). "La secuenciación profunda del ARN de Salmonella asociado con proteínas Hfq heterólogas in vivo revela que los ARN pequeños son una clase objetivo principal e identifica fenotipos de procesamiento de ARN" . RNA Biology . 6 (3): 266– 275. doi : 10.4161/rna.6.3.8332 . PMID 19333007 . 
  • Página para MicX Vibrio cholerae sRNA en Rfam