La repetición NHL , denominada así por ncl-1 , HT2A y lin-41 , es una secuencia de aminoácidos presente en gran cantidad de proteínas eucariotas y procariotas . Por ejemplo, esta repetición se encuentra en diversas enzimas de la familia de las monooxigenasas dependientes de ascorbato y de tipo cobre II, que catalizan la α-amidación del extremo C-terminal de péptidos biológicos. [ 2 ] En muchas de ellas, aparece en secuencias en tándem, como en los reguladores de crecimiento eucariotas RBCC ( dedo RING , caja beta, hélice enrollada ). [ 3 ] La proteína Brat ( Q8MQJ9 ), un gen de los artrópodos que se identifica como "tumor cerebral", es un regulador de crecimiento que contiene una hélice beta de repetición NHL de seis aspas. [ 1 ] [ 4 ]
Las repeticiones NHL también se encuentran en la proteína quinasa de serina/treonina (STPK) de diversas bacterias patógenas. Estas STPK son receptores transmembrana con un dominio quinasa N-terminal intracelular y un dominio sensor C-terminal extracelular. En la STPK PknD de Mycobacterium tuberculosis, el dominio sensor forma una hélice b rígida de seis aspas compuesta por repeticiones NHL con una unión flexible al dominio transmembrana.
La repetición NHL también se ha utilizado para diseñar una familia de proteínas de hélice beta de 6 palas totalmente simétricas llamadas "Pizza". [ 5 ] Estas proteínas también pueden diseñarse para unirse a nanocristales minerales. [ 6 ]
Referencias
- 1 2 Edwards TA, Wilkinson BD, Wharton RP, Aggarwal AK (octubre de 2003). "Modelo del complejo represor de la traducción Pumilio del tumor cerebral" . Genes Dev . 17 (20): 2508– 2513. doi : 10.1101/gad.1119403 . PMC 218144. PMID 14561773 .
- ↑ Kano S, Miyajima N, Fukuda S, Hatakeyama S (julio de 2008). "La proteína 32 con motivo tripartito facilita el crecimiento y la migración celular mediante la degradación del interactor 2 de Abl" . Cancer Res . 68 (14): 5572–5580 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-07-6231 . PMID 18632609 .
- ↑ Slack FJ, Ruvkun G (diciembre de 1998). "Un nuevo dominio de repetición que a menudo se asocia con motivos de dedo RING y caja B". Trends Biochem. Sci . 23 (12): 474– 5. doi : 10.1016/S0968-0004(98)01299-7 . PMID 9868369 .
- ↑ Edwards TA, Pyle SE, Wharton RP, Aggarwal AK (abril de 2001). "La estructura de Pumilio revela similitud entre los motivos de unión de ARN y péptidos" . Cell . 105 ( 2): 281–9 . doi : 10.1016/S0092-8674(01)00318-X . PMID 11336677. S2CID 9341061 .
- ↑ Tame, Jeremy RH; Zhang, Kam YJ; Park, Sam-Yong; Unzai, Satoru; Terada, Daiki; Simoncini, David; Addy, Christine; Noguchi, Hiroki; Voet, Arnout RD (21 de octubre de 2014). "Diseño computacional de una proteína β-hélice simétrica autoensamblable" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 111 (42): 15102– 15107. Bibcode : 2014PNAS..11115102V . doi : 10.1073/pnas.1412768111 . ISSN 0027-8424 . PMC 4210308. PMID 25288768 .
- ↑ Voet, AR; Noguchi, H; Addy, C; Zhang, KY; Tame, JR (17 de agosto de 2015). "Biomineralización de un nanocristal de cloruro de cadmio mediante una proteína simétrica diseñada". Angewandte Chemie International Edition . 54 (34): 9857– 60. doi : 10.1002/anie.201503575 . PMID 26136355 .
- dominios de proteínas